RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380876.4

EIF3CL-201, Transcript of eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EIF3CL, Length 3,085 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CL-201ENST00000380876 SEMA3FQ13275 785 aa14.57□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.57□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 SIX2Q9NPC8 291 aa14.57□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa14.57□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 A0A1B0GUL6 1792 aa14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 LGR5O75473 907 aa14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 AP1G2O75843 785 aa14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 STAT1P42224 750 aa14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 SLC20A1Q8WUM9 679 aa14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 REEP2Q9BRK0 252 aa14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 AFF2P51816 1311 aa14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 ZBTB39O15060 712 aa14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 GNA14O95837 355 aa14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 ABL2P42684 1182 aa14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 MPP2Q14168 576 aa14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 EPHA7Q15375 998 aa14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 TAF11Q15544 211 aa14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 GNPTABQ3T906 1256 aa14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 MSH2P43246 934 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 BTDP43251 543 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 CYP2J2P51589 502 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 SIK1P57059 783 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 SARNPP82979 210 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 MAPK7Q13164 816 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 NSMFQ6X4W1 530 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 SYCE1Q8N0S2 351 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 ALG6Q9Y672 507 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 BCL9O00512 1426 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 USP17L10C9JJH3 530 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 NR3C1P04150 777 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 ERFP50548 548 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 COPS2P61201 443 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 PDIA5Q14554 519 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 PRELID2Q8N945 189 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 C1orf54Q8WWF1 131 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 ADAM22Q9P0K1 906 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 RIPK2O43353 540 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 TNFAIP3P21580 790 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 SESN3P58005 492 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 ITIH4Q14624 930 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 PRR16Q569H4 304 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 SLC35C1Q96A29 364 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 RUSC1Q9BVN2 902 aa14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 CES2O00748 559 aa14.54□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 MAP3K13O43283 966 aa14.54□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 ZNF449Q6P9G9 518 aa14.54□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.54□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.54□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 PDE6CP51160 858 aa14.54□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 KYNUQ16719 465 aa14.54□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 C6orf118Q5T5N4 469 aa14.54□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.54□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 CAPN12Q6ZSI9 719 aa14.54□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.54□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 SPOCK2Q92563 424 aa14.54□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.54□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 SLC5A4Q9NY91 659 aa14.54□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 PFASO15067 1338 aa14.54□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 KCNQ2O43526 872 aa14.53□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 CLSTN1O94985 981 aa14.53□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 CHKAP35790 457 aa14.53□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 HSPA2P54652 639 aa14.53□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.53□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 CYP4X1Q8N118 509 aa14.53□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 SEC14L1Q92503 715 aa14.53□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 P3H4Q92791 437 aa14.53□□□□□ -0.08
EIF3CL-201ENST00000380876 CENPTQ96BT3 561 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms