RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 CYB5D1Q6P9G0 228 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 TNFRSF25Q93038 417 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD27Q96NW4 1050 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC27Q9C0I9 530 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 LACRTQ9GZZ8 138 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 ARMT1Q9H993 441 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 SENP2Q9HC62 589 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 SPON1Q9HCB6 807 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 SLC40A1Q9NP59 571 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 VPS54Q9P1Q0 977 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 LRWD1Q9UFC0 647 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 TNKSO95271 1327 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 C5orf60A6NFR6 353 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 CFAP73A6NFT4 308 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 B4DLN1 442 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 MYO1FO00160 1098 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF185O15231 689 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 KCNA3P22001 575 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 KIF5BP33176 963 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 RELBQ01201 579 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 IFT88Q13099 833 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF174Q15697 407 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 LRCH2Q5VUJ6 765 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 TAF4BQ92750 862 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 ARL8AQ96BM9 186 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 CENPTQ96BT3 561 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 GMLQ99445 158 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 BLZF1Q9H2G9 400 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 TMBIM4Q9HC24 238 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 KBTBD4Q9NVX7 518 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 PSME4Q14997 1843 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-201ENST00000372616 MYO3BQ8WXR4 1341 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 GSG1L2A8MUP6 293 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC188H7C350 402 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 TRAPPC3O43617 180 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 KRT14P02533 472 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 GNAQP50148 359 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 NLRP5P59047 1200 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC63Q05C16 580 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 PPARAQ07869 468 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 RIPK1Q13546 671 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 SEC23AQ15436 765 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 PKN1Q16512 942 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 MAN2A1Q16706 1144 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 VWA3BQ502W6 1294 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 FUKQ8N0W3 1084 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 LCORLQ8N3X6 602 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 MIGA1Q8NAN2 632 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 TTC16Q8NEE8 873 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 PBKQ96KB5 322 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 MRIQ9BWK5 157 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 ISCUQ9H1K1 167 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF233A6NK53 670 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 BTNL10A8MVZ5 291 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 PPIP5K2O43314 1243 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 ECE2O60344 883 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 SCG2P13521 617 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 ANXA13P27216 316 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 CLN3Q13286 438 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA0753Q2KHM9 967 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC178Q5BJE1 867 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 TMTC3Q6ZXV5 915 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 HOOK3Q86VS8 718 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 PLCD4Q9BRC7 762 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
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