RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368358.3

HCN3-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN3, Length 3,718 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3-201ENST00000368358 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.56□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 DHX15O43143 795 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 LRRN2O75325 713 aa14.56□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 AKAP3O75969 853 aa14.56□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.56□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.56□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.56□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 TADA3O75528 432 aa14.56□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 STRN3Q13033 797 aa14.56□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.56□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.56□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 NEK9Q8TD19 979 aa14.56□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 FAM84AQ96KN4 292 aa14.56□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 NCK2O43639 380 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 LIG4P49917 911 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 NEDD9Q14511 834 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 ZNF862O60290 1169 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 RGS20O76081 388 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 BCRP11274 1271 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 HYIQ5T013 277 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 ANO5Q75V66 913 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 ZBTB33Q86T24 672 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 NRBP2Q9NSY0 501 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 GFPT2O94808 682 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 BIRC3Q13489 604 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 SEZ6Q53EL9 994 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 CBWD1Q9BRT8 395 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa14.55□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 RASSF10A6NK89 507 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 ARHGAP25P42331 645 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 SEMA3FQ13275 785 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 CEP63Q96MT8 703 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 KCND1Q9NSA2 647 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 CENPFP49454 3210 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 FTCDO95954 541 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 KCNA2P16389 499 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 ABCB4P21439 1286 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 GCLMP48507 274 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 TTLL4Q14679 1199 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 GBP6Q6ZN66 633 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 ACCSQ96QU6 501 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 KCNMA1Q12791 1236 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 CCDC70Q6NSX1 233 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 SEPT1Q8WYJ6 367 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 ST7Q9NRC1 585 aa14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 PHACTR2O75167 634 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 VAV2P52735 878 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 RHPN2Q8IUC4 686 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 CCDC170Q8IYT3 715 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 VTI1AQ96AJ9 217 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 CYP26B1Q9NR63 512 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 PLAGL2Q9UPG8 496 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 FHOD1Q9Y613 1164 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 TNNI1P19237 187 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 ADCYAP1R1P41586 468 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 XKR3Q5GH77 459 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 PDXDC1Q6P996 788 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 ARMCX2Q7L311 632 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 DNERQ8NFT8 737 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 CCDC102AQ96A19 550 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 IWS1Q96ST2 819 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 K7ERI5 159 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 MAFGO15525 162 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 CETN1Q12798 172 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 VPS36Q86VN1 386 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 AKT3Q9Y243 479 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 RPTORQ8N122 1335 aa14.53□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 GJB1P08034 283 aa14.52□□□□□ -0.08
HCN3-201ENST00000368358 ZNF286BP0CG31 522 aa14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms