RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 MKL1Q969V6 931 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 C16orf92Q96LL3 132 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 WDR92Q96MX6 357 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 DNAJC7Q99615 494 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 B4E1Z4 1266 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 RPS6KA4O75676 772 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 TOX4O94842 621 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 CYP17A1P05093 508 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 ADRA1BP35368 520 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 NME9Q86XW9 330 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 CHST14Q8NCH0 376 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 DYDC2Q96IM9 177 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 MNTQ99583 582 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 RCAN3Q9UKA8 241 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 M0R2C6 588 aa6□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 MFAP3LO75121 409 aa6□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 KRT37O76014 449 aa6□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 BCAR1P56945 870 aa6□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 EPHA7Q15375 998 aa6□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 MDGA1Q8NFP4 955 aa6□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 GRXCR1A8MXD5 290 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 PLD2O14939 933 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 MTSS1O43312 755 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 PROZP22891 400 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 C2orf27AQ580R0 203 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 KRT40Q6A162 431 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF276Q8N554 614 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 PCIF1Q9H4Z3 704 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 FZD1Q9UP38 647 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 DAPK3O43293 454 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 FAM20BO75063 409 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 PPFIA4O75335 1185 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 RHOBTB3O94955 611 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 GCP02774 474 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 FBLP22087 321 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 IGFALSP35858 605 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 KIR2DL3P43628 341 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 SPIDRQ14159 915 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 CMTM4Q8IZR5 234 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 SAMD15Q9P1V8 674 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 DNAI1Q9UI46 699 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 H7C1D1 291 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 ITGB1P05556 798 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 BMP5P22003 454 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 ADCY1Q08828 1119 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 MYBPC3Q14896 1274 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 SYNE4Q8N205 404 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 KIAA1958Q8N8K9 716 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 ARL8AQ96BM9 186 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 C8orf37Q96NL8 207 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 OSBPL6Q9BZF3 934 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 A0A0A6YYJ9 748 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 PTPDC1A2A3K4 754 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 MAFGO15525 162 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 ASLP04424 464 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 NR4A1P22736 598 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 NPEPPSP55786 919 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 FSTL1Q12841 308 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF174Q15697 407 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 MB21D1Q8N884 522 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 ST8SIA2Q92186 375 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 VOPP1Q96AW1 172 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 CABP5Q9NP86 173 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 HS3ST4Q9Y661 456 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 E9PSI1 815 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 LMNAP02545 664 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.469e-6■□□□□ 8.9
PTPRK-202ENST00000368205 MAN2A1Q16706 1144 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms