RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 ZNF333Q96JL9 665 aa23.45■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 OSGEPQ9NPF4 335 aa23.45■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 PARP2Q9UGN5 583 aa23.45■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 PFASO15067 1338 aa23.45■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.45■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.341e-10■■■■□ 22.5
OPN3-201ENST00000366554 EYA4O95677 639 aa23.45■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 GSTA2P09210 222 aa23.45■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 CASZ1Q86V15 1759 aa23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 CYTH3O43739 400 aa23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 RASA1P20936 1047 aa23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 PPATQ06203 517 aa23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 LONRF1Q17RB8 773 aa23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 ANKRD42Q8N9B4 389 aa23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 GRAMD1AQ96CP6 724 aa23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 C18orf8Q96DM3 657 aa23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 PYGBP11216 843 aa23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 EPS15P42566 896 aa23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 COASYQ13057 564 aa23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 NEK8Q86SG6 692 aa23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 GDAP1Q8TB36 358 aa23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 FGD4Q96M96 766 aa23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 RUNDC3BQ96NL0 473 aa23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 SERPINB12Q96P63 405 aa23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 USP40Q9NVE5 1235 aa23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 ABCF2Q9UG63 623 aa23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 USP20Q9Y2K6 914 aa23.44■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 MROH7Q68CQ1 1323 aa23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 TTC36A6NLP5 189 aa23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 PDLIM1O00151 329 aa23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 TXKP42681 527 aa23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 GALCP54803 685 aa23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 DNAJC19Q96DA6 116 aa23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 SCOCQ9UIL1 159 aa23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 LRCH1Q9Y2L9 728 aa23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 H0Y3Z8 333 aa23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 PODXLO00592 558 aa23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 MUM1Q2TAK8 710 aa23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 KCNK18Q7Z418 384 aa23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 TTC8Q8TAM2 541 aa23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 DTNBP1Q96EV8 351 aa23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 MAGEB18Q96M61 343 aa23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 NMRK1Q9NWW6 199 aa23.43■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 SMAPO00193 183 aa23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 TARSP26639 723 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 VSIG1Q86XK7 387 aa23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 ERP27Q96DN0 273 aa23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 MTMR9Q96QG7 549 aa23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 PCYOX1Q9UHG3 505 aa23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 HAO1Q9UJM8 370 aa23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 TNS2Q63HR2 1409 aa23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 PHF2O75151 1096 aa23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 YARSP54577 528 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 FAM26FQ5R3K3 315 aa23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 VPS36Q86VN1 386 aa23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 SLC35G2Q8TBE7 412 aa23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 MAIP1Q8WWC4 291 aa23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 LRRC27Q9C0I9 530 aa23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 KCNK9Q9NPC2 374 aa23.42■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 NVLO15381 856 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 ENTPD5O75356 428 aa23.41■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 VCAM1P19320 739 aa23.41■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 DCLRE1BQ9H816 532 aa23.41■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 ECE2O60344 883 aa23.41■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 T-ENOLP0DO92 83 aa23.41■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 KRT13P13646 458 aa23.41■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 PON1P27169 355 aa23.41■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 CHRNA3P32297 505 aa23.41■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.341e-7■□□□□ 9.6
OPN3-201ENST00000366554 GRM4Q14833 912 aa23.41■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 CLUL1Q15846 466 aa23.41■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 ALG3Q92685 438 aa23.41■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 ART4Q93070 314 aa23.41■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.41■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.41■■□□□ 1.34
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