RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
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PTPRO-202ENST00000348962 FAF2Q96CS3 445 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRO-202ENST00000348962 GINM1Q9NU53 330 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRO-202ENST00000348962 MAP3K7O43318 606 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRO-202ENST00000348962 CXCR5P32302 372 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRO-202ENST00000348962 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRO-202ENST00000348962 DR1Q01658 176 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRO-202ENST00000348962 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRO-202ENST00000348962 EFHC2Q5JST6 749 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRO-202ENST00000348962 TTC23LQ6PF05 361 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRO-202ENST00000348962 CEP120Q8N960 986 aa16.5■□□□□ 0.23
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