RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 KRT17Q04695 432 aa23.73■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 KCNC3Q14003 757 aa23.73■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 NLRP7Q8WX94 980 aa23.73■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 PHF20Q9BVI0 1012 aa23.73■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 TECTAO75443 2155 aa23.73■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 XBP1P17861 261 aa23.72■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 FGFR4P22455 802 aa23.72■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 TECP42680 631 aa23.72■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 ZXDAP98168 799 aa23.72■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 INF2Q27J81 1249 aa23.72■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 CLLU1OSQ5K130 101 aa23.72■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 ANKRD54Q6NXT1 300 aa23.72■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 LLGL2Q6P1M3 1020 aa23.72■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 B3GNT9Q6UX72 402 aa23.72■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa23.72■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 ETNPPLQ8TBG4 499 aa23.72■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 SPG21Q9NZD8 308 aa23.72■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 STK36Q9NRP7 1315 aa23.72■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 WDR81Q562E7 1941 aa23.72■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF318Q5VUA4 2279 aa23.71■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 A0A0U1RQF3 1178 aa23.71■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 HIDE1A8MVS5 230 aa23.71■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 ANKRD1Q15327 319 aa23.71■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 TMC7Q7Z402 723 aa23.71■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 S1PR5Q9H228 398 aa23.71■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.7■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 EOMESO95936 686 aa23.7■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 MRE11P49959 708 aa23.7■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 AK2P54819 239 aa23.7■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 DRP2Q13474 957 aa23.7■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 LETM2Q2VYF4 491 aa23.7■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 MTERF2Q49AM1 385 aa23.7■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 HELQQ8TDG4 1101 aa23.7■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 PBXIP1Q96AQ6 731 aa23.7■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 DACT1Q9NYF0 836 aa23.7■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 SLC37A4O43826 429 aa23.69■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 DTNBO60941 627 aa23.69■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 CTDNEP1O95476 244 aa23.69■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 CDC42EP1Q00587 391 aa23.69■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 XKR3Q5GH77 459 aa23.69■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 SYCE2Q6PIF2 218 aa23.69■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.69■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 APOL5Q9BWW9 433 aa23.69■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.69■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 NEK8Q86SG6 692 aa23.68■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 CEP89Q96ST8 783 aa23.68■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 TMEM150BA6NC51 233 aa23.67■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 STBD1O95210 358 aa23.67■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 DNM2P50570 870 aa23.67■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 SIGLEC14Q08ET2 396 aa23.67■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.67■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 OXER1Q8TDS5 423 aa23.67■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 WASF1Q92558 559 aa23.67■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 CASP10Q92851 521 aa23.67■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 FAM20AQ96MK3 541 aa23.67■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 SH2D3AQ9BRG2 576 aa23.67■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 CHST12Q9NRB3 414 aa23.67■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 A0A087WZ62 844 aa23.66■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa23.66■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 C2orf71A6NGG8 1288 aa23.66■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.66■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 BCAR1P56945 870 aa23.66■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.66■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 NECAB1Q8N987 351 aa23.66■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 KCNMB3Q9NPA1 279 aa23.66■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.65■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 PHKA2P46019 1235 aa23.65■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 PSMC5P62195 406 aa23.65■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 PPP2R5CQ13362 524 aa23.65■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 ME3Q16798 604 aa23.65■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 PTPN21Q16825 1174 aa23.65■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.65■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF410Q86VK4 478 aa23.65■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 PRSS33Q8NF86 280 aa23.65■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.65■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 VAV3Q9UKW4 847 aa23.65■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa23.65■■□□□ 1.38
SOCS1-201ENST00000332029 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa23.64■■□□□ 1.37
SOCS1-201ENST00000332029 EML1O00423 815 aa23.64■■□□□ 1.37
SOCS1-201ENST00000332029 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
SOCS1-201ENST00000332029 FDPSP14324 419 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
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