RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 CASP5P51878 434 aa30.23■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TFDP1Q14186 410 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCFD1Q8WVM8 642 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARMC5Q96C12 935 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBTB10Q96DT7 871 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 RWDD2AQ9UIY3 292 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 AKT3Q9Y243 479 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBE4BO95155 1302 aa30.23■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MYL5Q02045 173 aa30.22■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RHPN2Q8IUC4 686 aa30.22■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FIZ1Q96SL8 496 aa30.22■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 LUZP1Q86V48 1076 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF507Q8TCN5 953 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 P2RX5Q93086 422 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSG101Q99816 390 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRDM10Q9NQV6 1147 aa30.22■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP2C9P11712 490 aa30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCNE1P24864 410 aa30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 ITGA7Q13683 1181 aa30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa30.2■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 IQCB1Q15051 598 aa30.2■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC01465Q8N7H1 131 aa30.2■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa30.2■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 HVCN1Q96D96 273 aa30.2■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIFC3Q9BVG8 833 aa30.2■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 PHF24Q9UPV7 400 aa30.2■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa30.19■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 DENND3A2RUS2 1198 aa30.19■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 CAPSQ13938 189 aa30.19■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PQY0 241 aa30.18■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 TREHO43280 583 aa30.18■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAM17P78536 824 aa30.18■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 GTF2BQ00403 316 aa30.18■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF149Q8NC42 400 aa30.18■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 NLRP4Q96MN2 994 aa30.18■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 C2orf40Q9H1Z8 148 aa30.18■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM206Q9H813 350 aa30.18■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CENPFP49454 3210 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KSR1Q8IVT5 923 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCLT1Q96NL6 688 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP1R37O75864 691 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 VTNP04004 478 aa30.17■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TAF2Q6P1X5 1199 aa30.17■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SEMA6BQ9H3T3 888 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 FRMPD3Q5JV73 1810 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 FSD2A1L4K1 749 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 SGPL1O95470 568 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 HIC1Q14526 733 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
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