RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 SMTNP53814 917 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 GTF2BQ00403 316 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 RPAINQ86UA6 219 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 SFR1Q86XK3 245 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 NME8Q8N427 588 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 MYCT1Q8N699 235 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 ANKLE1Q8NAG6 615 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 KIAA0895Q8NCT3 520 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 IFT74Q96LB3 600 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 KBTBD13C9JR72 458 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 BIN1O00499 593 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 IKBKBO14920 756 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 PPP1R37O75864 691 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 SGPL1O95470 568 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 MTFR1Q15390 333 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 ANO6Q4KMQ2 910 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 ODR4Q5SWX8 454 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 MYOCDQ8IZQ8 938 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 C7orf31Q8N865 590 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 GLT1D1Q96MS3 346 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 RNF208Q9H0X6 261 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 RWDD2AQ9UIY3 292 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 GLRA2P23416 452 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 PRCPP42785 496 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 NPTX2P47972 431 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 NFIL3Q16649 462 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 CENPPQ6IPU0 288 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 SCFD1Q8WVM8 642 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 DEFB118Q96PH6 123 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 C2orf40Q9H1Z8 148 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 SETD4Q9NVD3 440 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 HDAC6Q9UBN7 1215 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 GDAQ9Y2T3 454 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 GRIN2DO15399 1336 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 PCNTO95613 3336 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 A0A1W2PQY0 241 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 BICDL2A1A5D9 508 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 SFI1A8K8P3 1242 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 SMTNL1A8MU46 457 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 PSMA7O14818 248 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 CCNE1P24864 410 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 GJA8P48165 433 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF165P49910 485 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 EFNA5P52803 228 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 PEX3P56589 373 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 LRRC63Q05C16 580 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 TFDP1Q14186 410 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 IQCB1Q15051 598 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF410Q86VK4 478 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 BSNDQ8WZ55 320 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 TMEM143Q96AN5 459 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 TMEM206Q9H813 350 aa6.5□□□□□ -1.37
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