RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 RILPQ96NA2 401 aa13.22□□□□□ -0.29
PTPRG-201ENST00000295874 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
PTPRG-201ENST00000295874 SEL1LQ9UBV2 794 aa13.22□□□□□ -0.29
PTPRG-201ENST00000295874 PLAAQ9Y263 795 aa13.22□□□□□ -0.29
PTPRG-201ENST00000295874 SLC37A4O43826 429 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRG-201ENST00000295874 KRT15P19012 456 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRG-201ENST00000295874 STAT3P40763 770 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRG-201ENST00000295874 RAP1GDS1P52306 607 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRG-201ENST00000295874 PDCLQ13371 301 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRG-201ENST00000295874 ALCAMQ13740 583 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRG-201ENST00000295874 MUM1Q2TAK8 710 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF507Q8TCN5 953 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRG-201ENST00000295874 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
PTPRG-201ENST00000295874 ACCSQ96QU6 501 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRG-201ENST00000295874 CYTH3O43739 400 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRG-201ENST00000295874 PHBP35232 272 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRG-201ENST00000295874 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
PTPRG-201ENST00000295874 NAB2Q15742 525 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRG-201ENST00000295874 RHOT2Q8IXI1 618 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRG-201ENST00000295874 PPM1KQ8N3J5 372 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRG-201ENST00000295874 DNAJC12Q9UKB3 198 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRG-201ENST00000295874 DUSP10Q9Y6W6 482 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRG-201ENST00000295874 ESYT3A0FGR9 886 aa13.21□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 F5H6K3 240 aa13.21□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 WNT7AO00755 349 aa13.21□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 TNNC2P02585 160 aa13.21□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 NFKBIAP25963 317 aa13.21□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 KLRC3Q07444 240 aa13.21□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 IL17AQ16552 155 aa13.21□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 NKX2-3Q8TAU0 364 aa13.21□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 P3H4Q92791 437 aa13.21□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP13.21□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 HOMER3Q9NSC5 361 aa13.21□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 PASKQ96RG2 1323 aa13.21□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa13.21□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 KLRC4O43908 158 aa13.21□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 METTL23Q86XA0 190 aa13.21□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 FMO2Q99518 471 aa13.21□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa13.21□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 KIAA0895Q8NCT3 520 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 OPHN1O60890 802 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 LRRN2O75325 713 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 EYA4O95677 639 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 PDE6CP51160 858 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 MFAP3P55082 362 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF662Q6ZS27 426 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 TADA2BQ86TJ2 420 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 CLEC10AQ8IUN9 316 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 PDZD8Q8NEN9 1154 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 CDHR1Q96JP9 859 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 DRC3Q9H069 523 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 NYAP2Q9P242 653 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 FGGP02679 453 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 MESDQ14696 234 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 PIGOQ8TEQ8 1089 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 GANCQ8TET4 914 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 RNF181Q9P0P0 153 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 CCPG1Q9ULG6 757 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 GH2P01242 217 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 PPP2R5DQ14738 602 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 C4orf50Q6ZRC1 276 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 LCA5Q86VQ0 697 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 SFI1A8K8P3 1242 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 UCHL3P15374 230 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 MAN1A1P33908 653 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 CACNB3P54284 484 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 ESRRGP62508 458 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 UBXN2AP68543 259 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 DR1Q01658 176 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 PPARDQ03181 441 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 AOC3Q16853 763 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 XKR9Q5GH70 373 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 PPP4R1Q8TF05 950 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 A0A0U1RQJ8 604 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 GOLGA8CPA6NN73 597 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 CSPG5O95196 566 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 SNAP25P60880 206 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 IGBP1P78318 339 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 Q3C1V9 767 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 FAM102BQ5T8I3 360 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 HHIPL2Q6UWX4 724 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 FAM160B2Q86V87 743 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 KCTD17Q8N5Z5 321 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 PARD3BQ8TEW8 1205 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 GRK7Q8WTQ7 553 aa13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms