RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294304.11

LRP5-201, Transcript of LDL receptor related protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP5, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5-201ENST00000294304 CDO1Q16878 200 aa22.81■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 BEST2Q8NFU1 509 aa22.81■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 PPP4R1Q8TF05 950 aa22.81■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 PFDN4Q9NQP4 134 aa22.81■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 CCDC188H7C350 402 aa22.8■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 SLC7A5Q01650 507 aa22.8■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa22.8■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.8■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 ZMYND15Q9H091 742 aa22.8■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.8■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 RFX1P22670 979 aa22.8■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.8■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 EFNA5P52803 228 aa22.8■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.8■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 ZWILCHQ9H900 591 aa22.8■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 GARSP41250 739 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 BCAS4Q8TDM0 211 aa22.8■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 RNF139Q8WU17 664 aa22.8■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 C11orf70Q9BRQ4 267 aa22.8■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.79■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.79■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 CCDC68Q9H2F9 335 aa22.79■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.79■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 SAT1P21673 171 aa22.79■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa22.79■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 RNF149Q8NC42 400 aa22.79■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 RASSF4Q9H2L5 321 aa22.79■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 HUS1O60921 280 aa22.79■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.79■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 ANXA13P27216 316 aa22.79■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 ARHGAP24Q8N264 748 aa22.79■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 SNAPC2Q13487 334 aa22.79■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.79■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.79■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 PFDN6O15212 129 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 PDE1BQ01064 536 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 ZSCAN26Q16670 478 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 A0A1B0GTH6 734 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 CALB1P05937 261 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 SLMAPQ14BN4 828 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 PDXDC1Q6P996 788 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 ADGRB2O60241 1585 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.245e-7■■■□□ 18.3
LRP5-201ENST00000294304 WHAMMQ8TF30 809 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 RGL2O15211 777 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 SRGAP2O75044 1071 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 RIT2Q99578 217 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 KCND2Q9NZV8 630 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 CPP00450 1065 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 IL1R1P14778 569 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 DNAAF3Q8N9W5 541 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 ATG4CQ96DT6 458 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 SCYL1Q96KG9 808 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.77■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 FMO2Q99518 471 aa22.77■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.77■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 GRIN1Q05586 938 aa22.77■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.77■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 CLCN6P51797 869 aa22.77■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.77■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 STRIP2Q9ULQ0 834 aa22.77■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.77■■□□□ 1.24
LRP5-201ENST00000294304 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
LRP5-201ENST00000294304 RPA1P27694 616 aa22.77■■□□□ 1.23
LRP5-201ENST00000294304 GNA15P30679 374 aa22.77■■□□□ 1.23
LRP5-201ENST00000294304 ARL13BQ3SXY8 428 aa22.77■■□□□ 1.23
LRP5-201ENST00000294304 HSPH1Q92598 858 aa22.77■■□□□ 1.23
LRP5-201ENST00000294304 UBE4BO95155 1302 aa22.76■■□□□ 1.23
LRP5-201ENST00000294304 FTLP02792 175 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
LRP5-201ENST00000294304 CAP2P40123 477 aa22.76■■□□□ 1.23
LRP5-201ENST00000294304 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.76■■□□□ 1.23
LRP5-201ENST00000294304 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
LRP5-201ENST00000294304 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
LRP5-201ENST00000294304 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.76■■□□□ 1.23
LRP5-201ENST00000294304 SEC23AQ15436 765 aa22.76■■□□□ 1.23
LRP5-201ENST00000294304 GINM1Q9NU53 330 aa22.76■■□□□ 1.23
LRP5-201ENST00000294304 GRIN3BO60391 1043 aa22.76■■□□□ 1.23
LRP5-201ENST00000294304 AP3M2P53677 418 aa22.76■■□□□ 1.23
LRP5-201ENST00000294304 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.76■■□□□ 1.23
LRP5-201ENST00000294304 TJP3O95049 919 aa22.76■■□□□ 1.23
LRP5-201ENST00000294304 ZBED1O96006 694 aa22.76■■□□□ 1.23
LRP5-201ENST00000294304 SOX5P35711 763 aa22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms