RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294161.10

TTC9C-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC9C, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9C-201ENST00000294161 YWHABP31946 246 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 TERF2Q15554 542 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 NSMFQ6X4W1 530 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 OTUD6AQ7L8S5 288 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 TAF4BQ92750 862 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 CDHR1Q96JP9 859 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 SENP7Q9BQF6 1050 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 UBXN6Q9BZV1 441 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 VIPAS39Q9H9C1 493 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 POLD4Q9HCU8 107 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 OTOFQ9HC10 1997 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 CES2O00748 559 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 STAM2O75886 525 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 SASH3O75995 380 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 TFRCP02786 760 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 MYL7Q01449 175 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 BFSP1Q12934 665 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 CHADLQ6NUI6 762 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 DAW1Q8N136 415 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 TMOD4Q9NZQ9 345 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 GRID2IPA4D2P6 1211 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 ZNF185O15231 689 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 BUB1O43683 1085 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 H2AFZP0C0S5 128 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 PTPRAP18433 802 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 ABCD1P33897 745 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 SOX5P35711 763 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 SMTNP53814 917 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 APBA1Q02410 837 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 H2AFVQ71UI9 128 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 ATG4CQ96DT6 458 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 WRNIP1Q96S55 665 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 TLR10Q9BXR5 811 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 NAGPAQ9UK23 515 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 USP2O75604 605 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 PALMO75781 387 aa16.08■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 KLRC1P26715 233 aa16.08■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 DSG3P32926 999 aa16.08■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 COG2Q14746 738 aa16.08■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 HSP90B2PQ58FF3 399 aa16.08■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 NFRKBQ6P4R8 1299 aa16.08■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 VSIG10LQ86VR7 867 aa16.08■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 GPIHBP1Q8IV16 184 aa16.08■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 SYCE1Q8N0S2 351 aa16.08■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 SPATA4Q8NEY3 305 aa16.08■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 ATP6V0A1Q93050 837 aa16.08■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 C17orf75Q9HAS0 396 aa16.08■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 KCNG1Q9UIX4 513 aa16.08■□□□□ 0.17
TTC9C-201ENST00000294161 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 ATP2A1O14983 1001 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 OAS2P29728 719 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 GTF2BQ00403 316 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 CASP8Q14790 479 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 XKR9Q5GH70 373 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 MEI1Q5TIA1 1274 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 HAUS6Q7Z4H7 955 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 XXYLT1Q8NBI6 393 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 BCAS3Q9H6U6 928 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 HOXC10Q9NYD6 342 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 APEX2Q9UBZ4 518 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 SALL4Q9UJQ4 1053 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 DNAJC12Q9UKB3 198 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 MYH11P35749 1972 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 MYPNQ86TC9 1320 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 NR3C2P08235 984 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 NPEPPSP55786 919 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 C2orf54Q08AI8 447 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 KSR1Q8IVT5 923 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 COG1Q8WTW3 980 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 KIFAP3Q92845 792 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 PBKQ96KB5 322 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 SELENOOQ9BVL4 669 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa16.06■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 F8VZ95 297 aa16.06■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 CELF2O95319 508 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 PSAPP07602 524 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms