RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 NRBP2Q9NSY0 501 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 ABHD10Q9NUJ1 306 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 CAPN11Q9UMQ6 739 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 STX10O60499 249 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 SMPD1P17405 629 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNJ6P48051 423 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 PDE4CQ08493 712 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 ACVR2BQ13705 512 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 LAMC2Q13753 1193 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP4F22Q6NT55 531 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 ASAP3Q8TDY4 903 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP8B4Q8TF62 1192 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 CBWD1Q9BRT8 395 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 KCND1Q9NSA2 647 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 GJD2Q9UKL4 321 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 DENND3A2RUS2 1198 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 MAFO75444 373 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 HOXC6P09630 235 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 GLRA2P23416 452 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 ADSSP30520 456 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 KRT9P35527 623 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP2J2P51589 502 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 SMTNP53814 917 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 SREBF2Q12772 1141 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNH2Q12809 1159 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 MAP4K3Q8IVH8 894 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC7A3Q8WY07 619 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC35C1Q96A29 364 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 RNPEPQ9H4A4 650 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 HTTP42858 3142 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 GH1P01241 217 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHA2P01877 340 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 RFC5P40937 340 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 CCL14Q16627 93 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 FIGNQ5HY92 759 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC39A4Q6P5W5 647 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 C12orf56Q8IXR9 622 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC17A8Q8NDX2 589 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 PPTC7Q8NI37 304 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 GOLGA5Q8TBA6 731 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 AFG1LQ8WV93 481 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM167AQ96KS9 214 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAJC7Q99615 494 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM184BQ9ULE4 1060 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 MGAMO43451 1857 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD63C9JTQ0 380 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGAP6O43182 974 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 EPB41P11171 864 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 GRM1Q13255 1194 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 MTF1Q14872 753 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 DUSP28Q4G0W2 176 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 RETREG2Q8NC44 543 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 MKNK1Q9BUB5 465 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 SIP14410 1827 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 SOWAHDA6NJG2 315 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 MYBPC2Q14324 1141 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM186BQ8IYM0 893 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC51Q96ER9 411 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 NUP58Q9BVL2 599 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 PCIF1Q9H4Z3 704 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 NOL4O94818 638 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 TOMM70O94826 608 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 LGALS2P05162 132 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC26A2P50443 739 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 APBA1Q02410 837 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR59Q6PJI9 974 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 RAD9BQ6WBX8 426 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNN1Q92952 543 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 HVCN1Q96D96 273 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB10Q96DT7 871 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 C16orf70Q9BSU1 422 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 CRACR2AQ9BSW2 395 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 PDCL3Q9H2J4 239 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 EVPLQ92817 2033 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PQJ5 194 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 CA12O43570 354 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-201ENST00000284957 TPM1P09493 284 aa10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms