RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284116.8

GDPD1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDPD1, Length 1,821 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1-201ENST00000284116 SPAG5Q96R06 1193 aa20.64■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.64■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.63■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 GLTPD2A6NH11 291 aa20.63■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 CCDC169A6NNP5 214 aa20.63■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 TISP43B9A030 160 aa20.63■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 SORBS3O60504 671 aa20.63■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 DGAT1O75907 488 aa20.63■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.63■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 XKR3Q5GH77 459 aa20.63■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.63■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 RDH13Q8NBN7 331 aa20.63■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.63■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 CYP26B1Q9NR63 512 aa20.63■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 TBX20Q9UMR3 447 aa20.63■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.63■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.63■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 MAPK13O15264 365 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 KRT13P13646 458 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 JAM2P57087 298 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 RTP1P59025 263 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 ARID5AQ03989 594 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 BSNDQ8WZ55 320 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 KMT5AQ9NQR1 393 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 SCN4AP35499 1836 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 UTRNP46939 3433 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 TRIM49P0CI25 452 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 TRIM49CP0CI26 452 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 OSBPP22059 807 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 PRKCIP41743 596 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 SLC18A3Q16572 532 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 CBWD6Q4V339 395 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 IQCEQ6IPM2 695 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 MYH10P35580 1976 aa20.61■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 ATP4AP20648 1035 aa20.61■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 COPB2P35606 906 aa20.61■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.61■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.61■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.61■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 GOLGA1Q92805 767 aa20.61■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.61■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.61■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 ZNF302Q9NR11 478 aa20.61■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 ANO9A1A5B4 782 aa20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 ENC1O14682 589 aa20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 TACC1O75410 805 aa20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 VAMP7P51809 220 aa20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 SOX10P56693 466 aa20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 GJB7Q6PEY0 223 aa20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 TRIM58Q8NG06 486 aa20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 RABGGTAQ92696 567 aa20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 A0A087X0T9 212 aa20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 DENND3A2RUS2 1198 aa20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 FAM228BP0C875 321 aa20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 CHMP4BP1P59074 171 aa20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 MYL7Q01449 175 aa20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 PTK2Q05397 1052 aa20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 Q3C1V9 767 aa20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 SAR1BQ9Y6B6 198 aa20.6■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 LRRC37A2A6NM11 1700 aa20.59■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa20.59■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 TGFB3P10600 412 aa20.59■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 DLG4P78352 724 aa20.59■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 NEDD9Q14511 834 aa20.59■□□□□ 0.89
GDPD1-201ENST00000284116 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms