RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 GAS7O60861 476 aa30.39■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 GUCY1A3Q02108 690 aa30.39■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 PPATQ06203 517 aa30.39■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 CLUL1Q15846 466 aa30.39■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 PTGISQ16647 500 aa30.39■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 AMACRQ9UHK6 382 aa30.39■■■□□ 2.46
UBP1-201ENST00000283628 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 POLR2MP0CAP2 368 aa30.38■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP30.38■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 SLC9A9Q8IVB4 645 aa30.38■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 TTLL6Q8N841 843 aa30.38■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 GPR88Q9GZN0 384 aa30.38■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 CHMP2AO43633 222 aa30.38■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 CFBP00751 764 aa30.38■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 ITGA4P13612 1032 aa30.38■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 MYBPC2Q14324 1141 aa30.38■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 NEUROG2Q9H2A3 272 aa30.38■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa30.38■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 MYL7Q01449 175 aa30.37■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 COG2Q14746 738 aa30.37■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 CBWD6Q4V339 395 aa30.37■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 CBWD3Q5JTY5 395 aa30.37■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 CBWD5Q5RIA9 395 aa30.37■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 MICALCLQ6ZW33 695 aa30.37■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 DEFB132Q7Z7B7 95 aa30.37■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 CARD9Q9H257 536 aa30.37■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 IKZF4Q9H2S9 585 aa30.37■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 SAMM50Q9Y512 469 aa30.37■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 ZNF844Q08AG5 666 aa30.37■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 SPICE1Q8N0Z3 855 aa30.37■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 OSGEPQ9NPF4 335 aa30.37■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 DAPK3O43293 454 aa30.36■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 ERLIN2O94905 339 aa30.36■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 GUCY2CP25092 1073 aa30.36■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 SETQ01105 290 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 KIF22Q14807 665 aa30.36■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 CEP55Q53EZ4 464 aa30.36■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 SPDYCQ5MJ68 293 aa30.36■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 ODR4Q5SWX8 454 aa30.36■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 CYP2J2P51589 502 aa30.35■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 AGBL2Q5U5Z8 902 aa30.35■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 NAA35Q5VZE5 725 aa30.35■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 RTKN2Q8IZC4 609 aa30.35■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 MICALL1Q8N3F8 863 aa30.35■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 CSRNP1Q96S65 589 aa30.35■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 PSMD1Q99460 953 aa30.35■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 RAB17Q9H0T7 212 aa30.35■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 MYH11P35749 1972 aa30.35■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 TTI1O43156 1089 aa30.35■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 FGGP02679 453 aa30.35■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 TNFAIP3P21580 790 aa30.35■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 PTENP60484 403 aa30.35■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 BFSP1Q12934 665 aa30.35■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 PLS1Q14651 629 aa30.35■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 TMC3Q7Z5M5 1100 aa30.35■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 VTI1AQ96AJ9 217 aa30.35■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 GOPCQ9HD26 462 aa30.35■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 SMCHD1A6NHR9 2005 aa30.35■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD62A6NC57 917 aa30.34■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB39O15060 712 aa30.34■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 VIL1P09327 827 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 INPP5BP32019 993 aa30.34■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 SLC16A10Q8TF71 515 aa30.34■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 STRA6Q9BX79 667 aa30.34■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 GGA2Q9UJY4 613 aa30.34■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa30.34■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 HADHBP55084 474 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 KSR1Q8IVT5 923 aa30.34■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 ZNF577Q9BSK1 485 aa30.34■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 TMX2Q9Y320 296 aa30.34■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 KIAA0754O94854 1291 aa30.33■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 TRIM49P0CI25 452 aa30.33■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 TRIM49CP0CI26 452 aa30.33■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 KCNA3P22001 575 aa30.33■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 NLRP14Q86W24 1093 aa30.33■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 NEK9Q8TD19 979 aa30.33■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa30.33■■■□□ 2.45
UBP1-201ENST00000283628 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa30.32■■■□□ 2.44
UBP1-201ENST00000283628 RHOT2Q8IXI1 618 aa30.32■■■□□ 2.44
UBP1-201ENST00000283628 TEKT3Q9BXF9 490 aa30.32■■■□□ 2.44
UBP1-201ENST00000283628 UNC45AQ9H3U1 944 aa30.32■■■□□ 2.44
UBP1-201ENST00000283628 MYO1FO00160 1098 aa30.32■■■□□ 2.44
UBP1-201ENST00000283628 EXOC3O60645 756 aa30.32■■■□□ 2.44
UBP1-201ENST00000283628 FAM107AO95990 144 aa30.32■■■□□ 2.44
UBP1-201ENST00000283628 BCRP11274 1271 aa30.32■■■□□ 2.44
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