RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277010.8

SIGMAR1-201, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIGMAR1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-201ENST00000277010 MYMKA6NI61 221 aa25.26■■□□□ 1.63
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SIGMAR1-201ENST00000277010 DYMQ7RTS9 669 aa25.26■■□□□ 1.63
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SIGMAR1-201ENST00000277010 DRC1Q96MC2 740 aa25.26■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 TIPINQ9BVW5 301 aa25.26■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 KBTBD4Q9NVX7 518 aa25.26■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
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SIGMAR1-201ENST00000277010 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
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SIGMAR1-201ENST00000277010 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa25.26■■□□□ 1.63
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SIGMAR1-201ENST00000277010 CD52P31358 61 aa25.25■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 TFDP1Q14186 410 aa25.25■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa25.25■■□□□ 1.63
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SIGMAR1-201ENST00000277010 DBF4BQ8NFT6 615 aa25.25■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 GBP4Q96PP9 640 aa25.25■■□□□ 1.63
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SIGMAR1-201ENST00000277010 SLFN14P0C7P3 912 aa25.24■■□□□ 1.63
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SIGMAR1-201ENST00000277010 USP38Q8NB14 1042 aa25.24■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 IFT74Q96LB3 600 aa25.24■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 ODF2LQ9ULJ1 636 aa25.24■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 PADI3Q9ULW8 664 aa25.24■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF202O95125 648 aa25.23■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 PFKMP08237 780 aa25.23■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 PEX3P56589 373 aa25.23■■□□□ 1.63
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SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF365Q70YC5 407 aa25.23■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 FAM228AQ86W67 206 aa25.23■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa25.23■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.634e-9■■□□□ 13.8
SIGMAR1-201ENST00000277010 KIFC3Q9BVG8 833 aa25.23■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 MINDY3Q9H8M7 445 aa25.23■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 MAGEF1Q9HAY2 307 aa25.23■■□□□ 1.63
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SIGMAR1-201ENST00000277010 PHKA2P46019 1235 aa25.23■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 PTENP60484 403 aa25.23■■□□□ 1.63
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SIGMAR1-201ENST00000277010 UBE2HP62256 183 aa25.22■■□□□ 1.63
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SIGMAR1-201ENST00000277010 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa25.22■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa25.21■■□□□ 1.63
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SIGMAR1-201ENST00000277010 FAM160A1Q05DH4 1040 aa25.21■■□□□ 1.63
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SIGMAR1-201ENST00000277010 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
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SIGMAR1-201ENST00000277010 CNKSR3Q6P9H4 555 aa25.21■■□□□ 1.63
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SIGMAR1-201ENST00000277010 DEPTORQ8TB45 409 aa25.21■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
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SIGMAR1-201ENST00000277010 GPR182O15218 404 aa25.2■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 C9orf50Q5SZB4 431 aa25.2■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa25.2■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 PAGE5Q96GU1 130 aa25.2■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 LRRC27Q9C0I9 530 aa25.2■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 BLZF1Q9H2G9 400 aa25.2■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 PARVGQ9HBI0 331 aa25.2■■□□□ 1.63
SIGMAR1-201ENST00000277010 TET1Q8NFU7 2136 aa25.2■■□□□ 1.62
SIGMAR1-201ENST00000277010 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa25.2■■□□□ 1.62
SIGMAR1-201ENST00000277010 NR1I2O75469 434 aa25.2■■□□□ 1.62
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