RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263857.10

POLR1A-201, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene POLR1A, Length 12,749 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-201ENST00000263857 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 GGPS1O95749 300 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 HNMTP50135 292 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 FBXO42Q6P3S6 717 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 IYDQ6PHW0 289 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 NELFCDQ8IXH7 590 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 ACRBPQ8NEB7 543 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 ARL8AQ96BM9 186 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 IKBKBO14920 756 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 ASNA1O43681 348 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 CAPN1P07384 714 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 MYBL1P10243 752 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 RAD51Q06609 339 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 DCTPP1Q9H773 170 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 TMC5Q6UXY8 1006 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 TMC2Q8TDI7 906 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 KIFC1Q9BW19 673 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 UBXN6Q9BZV1 441 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 FIS1Q9Y3D6 152 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 SYCP2Q9BX26 1530 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 LCA5LO95447 670 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 RXRGP48443 463 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.274e-7■■■■□ 26.5
POLR1A-201ENST00000263857 C2CD6Q53TS8 623 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 ATP11CQ8NB49 1132 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 FAF2Q96CS3 445 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 SH3TC1Q8TE82 1336 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 M0R2C6 588 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 TFCP2Q12800 502 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 GTF2H3Q13889 308 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 MXD3Q9BW11 206 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 SERHL2Q9H4I8 314 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 SERHLQ9NQF3 203 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 LRRIQ4A6NIV6 560 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 PDE9AO76083 593 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 MXI1P50539 228 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 SDE2Q6IQ49 451 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 FKBP14Q9NWM8 211 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 NMRK1Q9NWW6 199 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 NFIBO00712 420 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 SERPING1P05155 500 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 STAT5AP42229 794 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 STAT5BP51692 787 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 RAD23BP54727 409 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 CASP8Q14790 479 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 C19orf18Q8NEA5 215 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 EXT2Q93063 718 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 EME1Q96AY2 570 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 LZTS1Q9Y250 596 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 CSADQ9Y600 493 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 ATP10DQ9P241 1426 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 BUB1O43683 1085 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 KLHL2O95198 593 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 LMBR1LQ6UX01 489 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 HIPK4Q8NE63 616 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 FAM161BQ96MY7 647 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 ASNSD1Q9NWL6 643 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 IMPAD1Q9NX62 359 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 STAP1Q9ULZ2 295 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 ZMYM6O95789 1325 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 SLC27A2O14975 620 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 PSMA2P25787 234 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 LRRC63Q05C16 580 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 CUL4AQ13619 759 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 PMF1Q6P1K2 205 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 BLIDQ8IZY5 108 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 WDR11Q9BZH6 1224 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 MAD2L2Q9UI95 211 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 COG2Q14746 738 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 RINLQ6ZS11 566 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 LRRC8AQ8IWT6 810 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 KRT35Q92764 455 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 COX16Q9P0S2 106 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 PLAAQ9Y263 795 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 KLHL20Q9Y2M5 609 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-201ENST00000263857 CFAP99D6REC4 459 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms