RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC37A4O43826 429 aa28.87■■■□□ 2.21
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CAPNS1-201ENST00000246533 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
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CAPNS1-201ENST00000246533 NEK8Q86SG6 692 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-201ENST00000246533 PPTC7Q8NI37 304 aa28.86■■■□□ 2.21
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CAPNS1-201ENST00000246533 PRPHP41219 470 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBED6P86452 979 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 SETQ01105 290 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM60Q495X7 471 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 AFAP1L1Q8TED9 768 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 DPF3Q92784 378 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 JAKMIP2Q96AA8 810 aa28.8■■■□□ 2.2
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