RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218652.11

NDFIP2-201, Transcript of Nedd4 family interacting protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NDFIP2, Length 4,625 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2-201ENST00000218652 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 PCDHA6Q9UN73 950 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 H7C1W4 665 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 TRIM49P0CI25 452 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 TRIM49CP0CI26 452 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 MCF2P10911 925 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 CCND2P30279 289 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 RAD23BP54727 409 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 FSCBQ5H9T9 825 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 DSTYKQ6XUX3 929 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 CATSPER4Q7RTX7 472 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 SYNE4Q8N205 404 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 DPF2Q92785 391 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 EDEM3Q9BZQ6 932 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 NEDD4P46934 1319 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 SYCE1LA8MT33 242 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 BAG6P46379 1132 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 COASYQ13057 564 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 NR1H3Q13133 447 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 ZBED8Q8IZ13 594 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 C1orf54Q8WWF1 131 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 RAPGEF5Q92565 580 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 SLC13A4Q9UKG4 626 aa15.96■□□□□ 0.15
NDFIP2-201ENST00000218652 KDM6BO15054 1643 aa15.96■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 POTEFA5A3E0 1075 aa15.96■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 POTEIP0CG38 1075 aa15.96■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 TAC1P20366 129 aa15.96■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 GPR162Q16538 588 aa15.96■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 POTEGQ6S5H5 508 aa15.96■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 SHC4Q6S5L8 630 aa15.96■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 POTEEQ6S8J3 1075 aa15.96■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 TTC25Q96NG3 672 aa15.96■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 ACAD11Q709F0 780 aa15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 NUDCD3Q8IVD9 361 aa15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 AGR3Q8TD06 166 aa15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 SLC26A7Q8TE54 656 aa15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 CHP1Q99653 195 aa15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 NUP85Q9BW27 656 aa15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 SUFUQ9UMX1 484 aa15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 L3MBTL1Q9Y468 752 aa15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 COPS2P61201 443 aa15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 OCA2Q04671 838 aa15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 GRAMD4Q6IC98 578 aa15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 RMDN3Q96TC7 470 aa15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 LRRC1Q9BTT6 524 aa15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 BRIP1Q9BX63 1249 aa15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 AATKQ6ZMQ8 1374 aa15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 TMEM260Q9NX78 707 aa15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 ZBTB5O15062 677 aa15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 LDHAP00338 332 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 ZBTB18Q99592 522 aa15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 MTRQ99707 1265 aa15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 ZNF341Q9BYN7 854 aa15.95■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 CHRNA3P32297 505 aa15.94■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 ABCD1P33897 745 aa15.94■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 MAPK6Q16659 721 aa15.94■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 SZRD1Q7Z422 152 aa15.94■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa15.94■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 KPNA7A9QM74 516 aa15.94■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 PPP1R37O75864 691 aa15.94■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 FCER1AP12319 257 aa15.94■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 HLFQ16534 295 aa15.94■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 KLHL38Q2WGJ6 581 aa15.94■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 FAM160B2Q86V87 743 aa15.94■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 DENND3A2RUS2 1198 aa15.94■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 BCAR1P56945 870 aa15.94■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa15.94■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 MCPH1Q8NEM0 835 aa15.94■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 NCAPHQ15003 741 aa15.93■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 PIGBQ92521 554 aa15.93■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 NDE1Q9NXR1 346 aa15.93■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 SLC9A2Q9UBY0 812 aa15.93■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 SDC4P31431 198 aa15.93■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 AP3B2Q13367 1082 aa15.93■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 MTMR1Q13613 665 aa15.93■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.93■□□□□ 0.14
NDFIP2-201ENST00000218652 BPIFA3Q9BQP9 254 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms