RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000642113.1

TMC3-AS1-207, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

BASIC

Gene TMC3-AS1, Length 2,043 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PTPRMP28827 1452 aa15.71■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.7■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-207ENST00000642113 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-207ENST00000642113 DMRT2Q9Y5R5 561 aa15.68■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PTPRKQ15262 1439 aa15.68■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-207ENST00000642113 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.67■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ITGAEP38570 1179 aa15.67■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-207ENST00000642113 GGT6Q6P531 493 aa15.67■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-207ENST00000642113 KIF15Q9NS87 1388 aa15.65■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-207ENST00000642113 KIF3BO15066 747 aa15.65■□□□□ 0.1
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
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TMC3-AS1-207ENST00000642113 C3P01024 1663 aa15.64■□□□□ 0.09
TMC3-AS1-207ENST00000642113 DUOX2Q9NRD8 1548 aa15.63■□□□□ 0.09
TMC3-AS1-207ENST00000642113 NCOA1Q15788 1441 aa15.62■□□□□ 0.09
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa15.62■□□□□ 0.09
TMC3-AS1-207ENST00000642113 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ADGRL2O95490 1459 aa15.61■□□□□ 0.09
TMC3-AS1-207ENST00000642113 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TMC3-AS1-207ENST00000642113 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
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TMC3-AS1-207ENST00000642113 MROH1Q8NDA8 1641 aa15.6■□□□□ 0.09
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MROH2AA6NES4 1674 aa15.59■□□□□ 0.09
TMC3-AS1-207ENST00000642113 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.59■□□□□ 0.09
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CEP152O94986 1710 aa15.59■□□□□ 0.09
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ERBINQ96RT1 1412 aa15.57■□□□□ 0.08
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CNTLNQ9NXG0 1405 aa15.56■□□□□ 0.08
TMC3-AS1-207ENST00000642113 KDM5DQ9BY66 1539 aa15.56■□□□□ 0.08
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ZMYM3Q14202 1370 aa15.55■□□□□ 0.08
TMC3-AS1-207ENST00000642113 DEPDC5O75140 1603 aa15.55■□□□□ 0.08
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
TMC3-AS1-207ENST00000642113 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa15.53■□□□□ 0.08
TMC3-AS1-207ENST00000642113 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.53■□□□□ 0.08
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa15.53■□□□□ 0.08
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ABCC3O15438 1527 aa15.53■□□□□ 0.08
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ROCK1Q13464 1354 aa15.52■□□□□ 0.08
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PREX1Q8TCU6 1659 aa15.52■□□□□ 0.08
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
TMC3-AS1-207ENST00000642113 LMTK3Q96Q04 1460 aa15.52■□□□□ 0.07
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa15.51■□□□□ 0.07
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SLC4A2P04920 1241 aa15.5■□□□□ 0.07
TMC3-AS1-207ENST00000642113 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TMC3-AS1-207ENST00000642113 FAM135AQ9P2D6 1515 aa15.49■□□□□ 0.07
TMC3-AS1-207ENST00000642113 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.49■□□□□ 0.07
TMC3-AS1-207ENST00000642113 HSPA2P54652 639 aa15.48■□□□□ 0.07
TMC3-AS1-207ENST00000642113 VWDEQ8N2E2 1590 aa15.47■□□□□ 0.07
TMC3-AS1-207ENST00000642113 UNC13BO14795 1591 aa15.46■□□□□ 0.07
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MYO3AQ8NEV4 1616 aa15.46■□□□□ 0.07
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PZPP20742 1482 aa15.46■□□□□ 0.07
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TMC3-AS1-207ENST00000642113 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa15.45■□□□□ 0.06
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TMC3-AS1-207ENST00000642113 HFM1A2PYH4 1435 aa15.41■□□□□ 0.06
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
TMC3-AS1-207ENST00000642113 LMTK2Q8IWU2 1503 aa15.41■□□□□ 0.06
TMC3-AS1-207ENST00000642113 IQGAP3Q86VI3 1631 aa15.4■□□□□ 0.06
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa15.4■□□□□ 0.06
TMC3-AS1-207ENST00000642113 EFCAB6Q5THR3 1501 aa15.4■□□□□ 0.06
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ERVK-7P63135 1459 aa15.4■□□□□ 0.06
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TET3O43151 1660 aa15.4■□□□□ 0.06
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TNRQ92752 1358 aa15.4■□□□□ 0.06
TMC3-AS1-207ENST00000642113 E9PCH4 1651 aa15.38■□□□□ 0.05
TMC3-AS1-207ENST00000642113 NUP155O75694 1391 aa15.38■□□□□ 0.05
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa15.37■□□□□ 0.05
TMC3-AS1-207ENST00000642113 STRCQ7RTU9 1775 aa15.37■□□□□ 0.05
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SYNMO15061 1565 aa15.35■□□□□ 0.05
TMC3-AS1-207ENST00000642113 A2ML1A8K2U0 1454 aa15.34■□□□□ 0.05
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PIK3C2BO00750 1634 aa15.32■□□□□ 0.04
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TRIM52Q96A61 297 aa15.32■□□□□ 0.04
TMC3-AS1-207ENST00000642113 UGGT1Q9NYU2 1555 aa15.32■□□□□ 0.04
TMC3-AS1-207ENST00000642113 UBR1Q8IWV7 1749 aa15.32■□□□□ 0.04
TMC3-AS1-207ENST00000642113 NLRP1Q9C000 1473 aa15.32■□□□□ 0.04
TMC3-AS1-207ENST00000642113 NOS1P29475 1434 aa15.31■□□□□ 0.04
TMC3-AS1-207ENST00000642113 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MYO5BQ9ULV0 1848 aa15.3■□□□□ 0.04
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.29■□□□□ 0.04
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa15.28■□□□□ 0.04
TMC3-AS1-207ENST00000642113 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.27■□□□□ 0.04
TMC3-AS1-207ENST00000642113 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
TMC3-AS1-207ENST00000642113 IDI1Q13907 227 aa15.27■□□□□ 0.03
TMC3-AS1-207ENST00000642113 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.27■□□□□ 0.03
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PLA2R1Q13018 1463 aa15.25■□□□□ 0.03
TMC3-AS1-207ENST00000642113 NEURL4Q96JN8 1562 aa15.23■□□□□ 0.03
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PKD2Q13563 968 aa15.23■□□□□ 0.03
TMC3-AS1-207ENST00000642113 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ADGRB3O60242 1522 aa15.22■□□□□ 0.03
TMC3-AS1-207ENST00000642113 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
TMC3-AS1-207ENST00000642113 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.21■□□□□ 0.03
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa15.21■□□□□ 0.03
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CLTCL1P53675 1640 aa15.21■□□□□ 0.02
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PTPRTO14522 1441 aa15.2■□□□□ 0.02
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SLC52A1Q9NWF4 448 aa15.2■□□□□ 0.02
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MPHOSPH9Q99550 1183 aa15.19■□□□□ 0.02
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TRPM2O94759 1503 aa15.19■□□□□ 0.02
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CHGAP10645 457 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
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