RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638790.1

MED17-216, Transcript of mediator complex subunit 17, human

TSL 5

Gene MED17, Length 1,885 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED17-216	ENST00000638790	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.78	■■■■□ 3
MED17-216	ENST00000638790	NEUROD1	Q13562	356 aa		33.77	■■■■□ 3
MED17-216	ENST00000638790	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		33.76	■■■■□ 3
MED17-216	ENST00000638790	A2M	P01023	1474 aa		33.76	■■■■□ 3
MED17-216	ENST00000638790	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		33.76	■■■■□ 3
MED17-216	ENST00000638790	PKD2	Q13563	968 aa		33.76	■■■■□ 3
MED17-216	ENST00000638790	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.76	■■■□□ 2.99
MED17-216	ENST00000638790	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.75	■■■□□ 2.99
MED17-216	ENST00000638790	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.71	■■■□□ 2.99
MED17-216	ENST00000638790	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	33.69	■■■□□ 2.98	1e-7	■■■■□ 23.9
MED17-216	ENST00000638790	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	33.69	■■■□□ 2.98
MED17-216	ENST00000638790	KIF3B	O15066	747 aa		33.67	■■■□□ 2.98
MED17-216	ENST00000638790	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.66	■■■□□ 2.98
MED17-216	ENST00000638790	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.66	■■■□□ 2.98
MED17-216	ENST00000638790	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.65	■■■□□ 2.98
MED17-216	ENST00000638790	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		33.64	■■■□□ 2.98
MED17-216	ENST00000638790	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.64	■■■□□ 2.98
MED17-216	ENST00000638790	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	33.63	■■■□□ 2.97
MED17-216	ENST00000638790	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.61	■■■□□ 2.97
MED17-216	ENST00000638790	TONSL	Q96HA7	1378 aa		33.58	■■■□□ 2.97
MED17-216	ENST00000638790	KANK1	Q14678	1352 aa		33.55	■■■□□ 2.96
MED17-216	ENST00000638790	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	33.54	■■■□□ 2.96
MED17-216	ENST00000638790	ATP10A	O60312	1499 aa		33.52	■■■□□ 2.96
MED17-216	ENST00000638790	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33.52	■■■□□ 2.96
MED17-216	ENST00000638790	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.51	■■■□□ 2.95
MED17-216	ENST00000638790	TET3	O43151	1660 aa		33.5	■■■□□ 2.95
MED17-216	ENST00000638790	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		33.5	■■■□□ 2.95
MED17-216	ENST00000638790	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
MED17-216	ENST00000638790		E9PCH4	1651 aa		33.46	■■■□□ 2.95
MED17-216	ENST00000638790	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		33.42	■■■□□ 2.94
MED17-216	ENST00000638790	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		33.42	■■■□□ 2.94
MED17-216	ENST00000638790	AGL	P35573	1532 aa		33.41	■■■□□ 2.94
MED17-216	ENST00000638790	GGT6	Q6P531	493 aa		33.41	■■■□□ 2.94
MED17-216	ENST00000638790	PTPRT	O14522	1441 aa		33.4	■■■□□ 2.94
MED17-216	ENST00000638790	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		33.4	■■■□□ 2.94
MED17-216	ENST00000638790	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		33.37	■■■□□ 2.93
MED17-216	ENST00000638790	ABCC3	O15438	1527 aa		33.36	■■■□□ 2.93
MED17-216	ENST00000638790	CEP152	O94986	1710 aa		33.36	■■■□□ 2.93
MED17-216	ENST00000638790	TRPM2	O94759	1503 aa		33.33	■■■□□ 2.93
MED17-216	ENST00000638790	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.32	■■■□□ 2.93
MED17-216	ENST00000638790	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		33.31	■■■□□ 2.92
MED17-216	ENST00000638790	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		33.3	■■■□□ 2.92
MED17-216	ENST00000638790	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
MED17-216	ENST00000638790	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
MED17-216	ENST00000638790	NPAT	Q14207	1427 aa		33.27	■■■□□ 2.92
MED17-216	ENST00000638790	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.23	■■■□□ 2.91
MED17-216	ENST00000638790	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.23	■■■□□ 2.91
MED17-216	ENST00000638790	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		33.23	■■■□□ 2.91
MED17-216	ENST00000638790	CLTCL1	P53675	1640 aa		33.19	■■■□□ 2.9
MED17-216	ENST00000638790	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		33.18	■■■□□ 2.9
MED17-216	ENST00000638790	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		33.18	■■■□□ 2.9
MED17-216	ENST00000638790	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.15	■■■□□ 2.9
MED17-216	ENST00000638790	NOS1	P29475	1434 aa		33.14	■■■□□ 2.9
MED17-216	ENST00000638790	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.13	■■■□□ 2.89
MED17-216	ENST00000638790	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		33.12	■■■□□ 2.89
MED17-216	ENST00000638790	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.09	■■■□□ 2.89
MED17-216	ENST00000638790	RGL3	Q3MIN7	710 aa		33.08	■■■□□ 2.89
MED17-216	ENST00000638790	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		33.08	■■■□□ 2.89
MED17-216	ENST00000638790	SYNM	O15061	1565 aa		33.02	■■■□□ 2.88
MED17-216	ENST00000638790	MLEC	Q14165	292 aa		33.02	■■■□□ 2.88
MED17-216	ENST00000638790	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.88
MED17-216	ENST00000638790	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
MED17-216	ENST00000638790	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		33	■■■□□ 2.87
MED17-216	ENST00000638790	PIK3C2B	O00750	1634 aa		33	■■■□□ 2.87
MED17-216	ENST00000638790	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		32.99	■■■□□ 2.87
MED17-216	ENST00000638790	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.98	■■■□□ 2.87
MED17-216	ENST00000638790	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
MED17-216	ENST00000638790	KIF1B	O60333	1816 aa		32.97	■■■□□ 2.87
MED17-216	ENST00000638790	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		32.96	■■■□□ 2.87
MED17-216	ENST00000638790	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.96	■■■□□ 2.87
MED17-216	ENST00000638790	STAC3	Q96MF2	364 aa		32.95	■■■□□ 2.87
MED17-216	ENST00000638790	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.94	■■■□□ 2.86
MED17-216	ENST00000638790	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
MED17-216	ENST00000638790	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
MED17-216	ENST00000638790	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.91	■■■□□ 2.86
MED17-216	ENST00000638790	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.91	■■■□□ 2.86
MED17-216	ENST00000638790	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.89	■■■□□ 2.86
MED17-216	ENST00000638790	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.89	■■■□□ 2.86
MED17-216	ENST00000638790	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	32.87	■■■□□ 2.85
MED17-216	ENST00000638790	IDI1	Q13907	227 aa		32.87	■■■□□ 2.85
MED17-216	ENST00000638790	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		32.87	■■■□□ 2.85
MED17-216	ENST00000638790	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
MED17-216	ENST00000638790	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
MED17-216	ENST00000638790	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
MED17-216	ENST00000638790	IFT172	Q9UG01	1749 aa		32.84	■■■□□ 2.85
MED17-216	ENST00000638790	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.83	■■■□□ 2.85
MED17-216	ENST00000638790	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
MED17-216	ENST00000638790	MYOM2	P54296	1465 aa		32.83	■■■□□ 2.85
MED17-216	ENST00000638790	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		32.81	■■■□□ 2.84
MED17-216	ENST00000638790	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		32.79	■■■□□ 2.84
MED17-216	ENST00000638790	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
MED17-216	ENST00000638790	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		32.78	■■■□□ 2.84
MED17-216	ENST00000638790	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.76	■■■□□ 2.84
MED17-216	ENST00000638790	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.84
MED17-216	ENST00000638790	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		32.76	■■■□□ 2.83
MED17-216	ENST00000638790	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		32.75	■■■□□ 2.83
MED17-216	ENST00000638790	USP47	Q96K76	1375 aa		32.74	■■■□□ 2.83
MED17-216	ENST00000638790	PPL	O60437	1756 aa		32.74	■■■□□ 2.83
MED17-216	ENST00000638790	LAMC1	P11047	1609 aa		32.73	■■■□□ 2.83
MED17-216	ENST00000638790	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.72	■■■□□ 2.83

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