RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 ATP10AO60312 1499 aa25.62■■□□□ 1.69
CLN8-211ENST00000636934 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CLN8-211ENST00000636934 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.61■■□□□ 1.69
CLN8-211ENST00000636934 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.59■■□□□ 1.69
CLN8-211ENST00000636934 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.59■■□□□ 1.69
CLN8-211ENST00000636934 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.58■■□□□ 1.69
CLN8-211ENST00000636934 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
CLN8-211ENST00000636934 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CLN8-211ENST00000636934 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CLN8-211ENST00000636934 FANCAO15360 1455 aa25.56■■□□□ 1.68
CLN8-211ENST00000636934 PLA2R1Q13018 1463 aa25.56■■□□□ 1.68
CLN8-211ENST00000636934 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.55■■□□□ 1.68
CLN8-211ENST00000636934 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.55■■□□□ 1.68
CLN8-211ENST00000636934 OSCARQ8IYS5 282 aa25.54■■□□□ 1.68
CLN8-211ENST00000636934 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.53■■□□□ 1.68
CLN8-211ENST00000636934 ASXL2Q76L83 1435 aa25.52■■□□□ 1.68
CLN8-211ENST00000636934 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CLN8-211ENST00000636934 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.51■■□□□ 1.67
CLN8-211ENST00000636934 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CLN8-211ENST00000636934 ATP7AQ04656 1500 aa25.5■■□□□ 1.67
CLN8-211ENST00000636934 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
CLN8-211ENST00000636934 DEPDC5O75140 1603 aa25.49■■□□□ 1.67
CLN8-211ENST00000636934 LAMC1P11047 1609 aa25.49■■□□□ 1.67
CLN8-211ENST00000636934 ADGRL1O94910 1474 aa25.48■■□□□ 1.67
CLN8-211ENST00000636934 AFAP1Q8N556 730 aa25.48■■□□□ 1.67
CLN8-211ENST00000636934 A2MP01023 1474 aa25.48■■□□□ 1.67
CLN8-211ENST00000636934 KANK1Q14678 1352 aa25.45■■□□□ 1.66
CLN8-211ENST00000636934 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.45■■□□□ 1.66
CLN8-211ENST00000636934 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.44■■□□□ 1.66
CLN8-211ENST00000636934 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
CLN8-211ENST00000636934 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CLN8-211ENST00000636934 NEFLP07196 543 aa25.43■■□□□ 1.66
CLN8-211ENST00000636934 RGL3Q3MIN7 710 aa25.42■■□□□ 1.66
CLN8-211ENST00000636934 MRS2Q9HD23 443 aa25.42■■□□□ 1.66
CLN8-211ENST00000636934 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.42■■□□□ 1.66
CLN8-211ENST00000636934 TET3O43151 1660 aa25.41■■□□□ 1.66
CLN8-211ENST00000636934 TRPM2O94759 1503 aa25.41■■□□□ 1.66
CLN8-211ENST00000636934 E9PCH4 1651 aa25.41■■□□□ 1.66
CLN8-211ENST00000636934 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.41■■□□□ 1.66
CLN8-211ENST00000636934 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN8-211ENST00000636934 STAC3Q96MF2 364 aa25.39■■□□□ 1.66
CLN8-211ENST00000636934 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.38■■□□□ 1.65
CLN8-211ENST00000636934 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.37■■□□□ 1.65
CLN8-211ENST00000636934 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CLN8-211ENST00000636934 PTPRTO14522 1441 aa25.37■■□□□ 1.65
CLN8-211ENST00000636934 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CLN8-211ENST00000636934 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.35■■□□□ 1.65
CLN8-211ENST00000636934 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.35■■□□□ 1.65
CLN8-211ENST00000636934 CEP152O94986 1710 aa25.34■■□□□ 1.65
CLN8-211ENST00000636934 CCDC184Q52MB2 194 aa25.33■■□□□ 1.65
CLN8-211ENST00000636934 FKBP8Q14318 412 aa25.31■■□□□ 1.64
CLN8-211ENST00000636934 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.3■■□□□ 1.64
CLN8-211ENST00000636934 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CLN8-211ENST00000636934 KIF3BO15066 747 aa25.29■■□□□ 1.64
CLN8-211ENST00000636934 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.29■■□□□ 1.64
CLN8-211ENST00000636934 CD109Q6YHK3 1445 aa25.29■■□□□ 1.64
CLN8-211ENST00000636934 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.28■■□□□ 1.64
CLN8-211ENST00000636934 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.28■■□□□ 1.64
CLN8-211ENST00000636934 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.26■■□□□ 1.63
CLN8-211ENST00000636934 CLTCL1P53675 1640 aa25.26■■□□□ 1.63
CLN8-211ENST00000636934 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.25■■□□□ 1.63
CLN8-211ENST00000636934 MADDQ8WXG6 1647 aa25.25■■□□□ 1.63
CLN8-211ENST00000636934 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CLN8-211ENST00000636934 RALBP1Q15311 655 aa25.24■■□□□ 1.63
CLN8-211ENST00000636934 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.23■■□□□ 1.63
CLN8-211ENST00000636934 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.22■■□□□ 1.63
CLN8-211ENST00000636934 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.22■■□□□ 1.63
CLN8-211ENST00000636934 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.21■■□□□ 1.63
CLN8-211ENST00000636934 TMF1P82094 1093 aa25.19■■□□□ 1.62
CLN8-211ENST00000636934 NEO1Q92859 1461 aa25.19■■□□□ 1.62
CLN8-211ENST00000636934 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.18■■□□□ 1.62
CLN8-211ENST00000636934 TESK2Q96S53 571 aa25.18■■□□□ 1.62
CLN8-211ENST00000636934 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CLN8-211ENST00000636934 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.17■■□□□ 1.62
CLN8-211ENST00000636934 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CLN8-211ENST00000636934 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.17■■□□□ 1.62
CLN8-211ENST00000636934 IQGAP1P46940 1657 aa25.16■■□□□ 1.62
CLN8-211ENST00000636934 TMC1Q8TDI8 760 aa25.16■■□□□ 1.62
CLN8-211ENST00000636934 KIF1BO60333 1816 aa25.13■■□□□ 1.61
CLN8-211ENST00000636934 MYOM2P54296 1465 aa25.12■■□□□ 1.61
CLN8-211ENST00000636934 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CLN8-211ENST00000636934 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CLN8-211ENST00000636934 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.12■■□□□ 1.61
CLN8-211ENST00000636934 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.11■■□□□ 1.61
CLN8-211ENST00000636934 CDCA8Q53HL2 280 aa25.1■■□□□ 1.61
CLN8-211ENST00000636934 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CLN8-211ENST00000636934 BCANQ96GW7 911 aa25.1■■□□□ 1.61
CLN8-211ENST00000636934 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CLN8-211ENST00000636934 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.09■■□□□ 1.61
CLN8-211ENST00000636934 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CLN8-211ENST00000636934 SLC24A1O60721 1099 aa25.08■■□□□ 1.6
CLN8-211ENST00000636934 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.07■■□□□ 1.6
CLN8-211ENST00000636934 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.06■■□□□ 1.6
CLN8-211ENST00000636934 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CLN8-211ENST00000636934 NLRP13Q86W25 1043 aa25.05■■□□□ 1.6
CLN8-211ENST00000636934 ABCA6Q8N139 1617 aa25.05■■□□□ 1.6
CLN8-211ENST00000636934 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CLN8-211ENST00000636934 IFT172Q9UG01 1749 aa25.03■■□□□ 1.6
CLN8-211ENST00000636934 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CLN8-211ENST00000636934 PANK3Q9H999 370 aa25■■□□□ 1.59
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