RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635747.1

CLN6-210, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN6, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-210ENST00000635747 DAPK1P53355 1430 aa28.27■■■□□ 2.12
CLN6-210ENST00000635747 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
CLN6-210ENST00000635747 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.26■■■□□ 2.11
CLN6-210ENST00000635747 KIF15Q9NS87 1388 aa28.24■■■□□ 2.11
CLN6-210ENST00000635747 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
CLN6-210ENST00000635747 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.23■■■□□ 2.11
CLN6-210ENST00000635747 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
CLN6-210ENST00000635747 PZPP20742 1482 aa28.21■■■□□ 2.11
CLN6-210ENST00000635747 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.21■■■□□ 2.11
CLN6-210ENST00000635747 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
CLN6-210ENST00000635747 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.2■■■□□ 2.11
CLN6-210ENST00000635747 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
CLN6-210ENST00000635747 ERBINQ96RT1 1412 aa28.19■■■□□ 2.1
CLN6-210ENST00000635747 PTPRTO14522 1441 aa28.18■■■□□ 2.1
CLN6-210ENST00000635747 NCOA1Q15788 1441 aa28.18■■■□□ 2.1
CLN6-210ENST00000635747 STRCQ7RTU9 1775 aa28.17■■■□□ 2.1
CLN6-210ENST00000635747 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
CLN6-210ENST00000635747 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.17■■■□□ 2.1
CLN6-210ENST00000635747 TNRQ92752 1358 aa28.16■■■□□ 2.1
CLN6-210ENST00000635747 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.15■■■□□ 2.1
CLN6-210ENST00000635747 FBXO41Q8TF61 875 aa28.14■■■□□ 2.1
CLN6-210ENST00000635747 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
CLN6-210ENST00000635747 PKD2Q13563 968 aa28.13■■■□□ 2.09
CLN6-210ENST00000635747 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.13■■■□□ 2.09
CLN6-210ENST00000635747 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.13■■■□□ 2.09
CLN6-210ENST00000635747 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
CLN6-210ENST00000635747 ABCC3O15438 1527 aa28.13■■■□□ 2.09
CLN6-210ENST00000635747 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
CLN6-210ENST00000635747 PLA2R1Q13018 1463 aa28.11■■■□□ 2.09
CLN6-210ENST00000635747 ADGRL2O95490 1459 aa28.08■■■□□ 2.09
CLN6-210ENST00000635747 CERKQ8TCT0 537 aa28.08■■■□□ 2.09
CLN6-210ENST00000635747 KANK1Q14678 1352 aa28.08■■■□□ 2.09
CLN6-210ENST00000635747 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.07■■■□□ 2.08
CLN6-210ENST00000635747 NLRP1Q9C000 1473 aa28.07■■■□□ 2.08
CLN6-210ENST00000635747 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.05■■■□□ 2.08
CLN6-210ENST00000635747 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.05■■■□□ 2.08
CLN6-210ENST00000635747 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
CLN6-210ENST00000635747 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
CLN6-210ENST00000635747 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.01■■■□□ 2.08
CLN6-210ENST00000635747 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.99■■■□□ 2.07
CLN6-210ENST00000635747 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
CLN6-210ENST00000635747 ERVK-7P63135 1459 aa27.99■■■□□ 2.07
CLN6-210ENST00000635747 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.99■■■□□ 2.07
CLN6-210ENST00000635747 DEPDC5O75140 1603 aa27.98■■■□□ 2.07
CLN6-210ENST00000635747 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.97■■■□□ 2.07
CLN6-210ENST00000635747 CEP152O94986 1710 aa27.96■■■□□ 2.07
CLN6-210ENST00000635747 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.96■■■□□ 2.07
CLN6-210ENST00000635747 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.95■■■□□ 2.07
CLN6-210ENST00000635747 ROCK1Q13464 1354 aa27.95■■■□□ 2.06
CLN6-210ENST00000635747 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.92■■■□□ 2.06
CLN6-210ENST00000635747 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.9■■■□□ 2.06
CLN6-210ENST00000635747 ITGAEP38570 1179 aa27.86■■■□□ 2.05
CLN6-210ENST00000635747 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.85■■■□□ 2.05
CLN6-210ENST00000635747 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
CLN6-210ENST00000635747 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
CLN6-210ENST00000635747 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.81■■■□□ 2.04
CLN6-210ENST00000635747 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
CLN6-210ENST00000635747 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
CLN6-210ENST00000635747 MED14O60244 1454 aa27.8■■■□□ 2.04
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CLN6-210ENST00000635747 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.78■■■□□ 2.04
CLN6-210ENST00000635747 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
CLN6-210ENST00000635747 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
CLN6-210ENST00000635747 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.77■■■□□ 2.04
CLN6-210ENST00000635747 NOS1P29475 1434 aa27.76■■■□□ 2.04
CLN6-210ENST00000635747 IDI1Q13907 227 aa27.75■■■□□ 2.03
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CLN6-210ENST00000635747 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.75■■■□□ 2.03
CLN6-210ENST00000635747 UNC13BO14795 1591 aa27.73■■■□□ 2.03
CLN6-210ENST00000635747 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.72■■■□□ 2.03
CLN6-210ENST00000635747 SLIT1O75093 1534 aa27.71■■■□□ 2.03
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CLN6-210ENST00000635747 NUP155O75694 1391 aa27.69■■■□□ 2.02
CLN6-210ENST00000635747 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.69■■■□□ 2.02
CLN6-210ENST00000635747 PIK3C2BO00750 1634 aa27.68■■■□□ 2.02
CLN6-210ENST00000635747 LTKP29376 864 aa27.68■■■□□ 2.02
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CLN6-210ENST00000635747 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
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CLN6-210ENST00000635747 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.63■■■□□ 2.01
CLN6-210ENST00000635747 ADGRB3O60242 1522 aa27.59■■■□□ 2.01
CLN6-210ENST00000635747 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.59■■■□□ 2.01
CLN6-210ENST00000635747 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
CLN6-210ENST00000635747 NAIPQ13075 1403 aa27.57■■■□□ 2
CLN6-210ENST00000635747 E9PCH4 1651 aa27.54■■■□□ 2
CLN6-210ENST00000635747 HFM1A2PYH4 1435 aa27.52■■■□□ 2
CLN6-210ENST00000635747 TOM1O60784 492 aa27.52■■■□□ 2
CLN6-210ENST00000635747 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
CLN6-210ENST00000635747 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.5■■□□□ 1.99
CLN6-210ENST00000635747 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
CLN6-210ENST00000635747 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.46■■□□□ 1.99
CLN6-210ENST00000635747 BCANQ96GW7 911 aa27.46■■□□□ 1.99
CLN6-210ENST00000635747 ZFYVE9O95405 1425 aa27.46■■□□□ 1.99
CLN6-210ENST00000635747 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.46■■□□□ 1.99
CLN6-210ENST00000635747 TRIM52Q96A61 297 aa27.45■■□□□ 1.98
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