RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-211ENST00000633035 KIF15Q9NS87 1388 aa25.45■■□□□ 1.67
JMJD1C-211ENST00000633035 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
JMJD1C-211ENST00000633035 NPATQ14207 1427 aa25.45■■□□□ 1.66
JMJD1C-211ENST00000633035 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.44■■□□□ 1.66
JMJD1C-211ENST00000633035 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.44■■□□□ 1.66
JMJD1C-211ENST00000633035 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.42■■□□□ 1.66
JMJD1C-211ENST00000633035 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.39■■□□□ 1.66
JMJD1C-211ENST00000633035 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.38■■□□□ 1.65
JMJD1C-211ENST00000633035 PTPRKQ15262 1439 aa25.37■■□□□ 1.65
JMJD1C-211ENST00000633035 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
JMJD1C-211ENST00000633035 ERBINQ96RT1 1412 aa25.36■■□□□ 1.65
JMJD1C-211ENST00000633035 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.35■■□□□ 1.65
JMJD1C-211ENST00000633035 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.34■■□□□ 1.65
JMJD1C-211ENST00000633035 NCOA1Q15788 1441 aa25.34■■□□□ 1.65
JMJD1C-211ENST00000633035 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
JMJD1C-211ENST00000633035 ITGAEP38570 1179 aa25.32■■□□□ 1.64
JMJD1C-211ENST00000633035 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
JMJD1C-211ENST00000633035 KANK1Q14678 1352 aa25.31■■□□□ 1.64
JMJD1C-211ENST00000633035 PZPP20742 1482 aa25.29■■□□□ 1.64
JMJD1C-211ENST00000633035 TNRQ92752 1358 aa25.29■■□□□ 1.64
JMJD1C-211ENST00000633035 ADGRL2O95490 1459 aa25.28■■□□□ 1.64
JMJD1C-211ENST00000633035 ABCC3O15438 1527 aa25.27■■□□□ 1.64
JMJD1C-211ENST00000633035 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
JMJD1C-211ENST00000633035 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.631e-12■■□□□ 11.4
JMJD1C-211ENST00000633035 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.23■■□□□ 1.63
JMJD1C-211ENST00000633035 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.23■■□□□ 1.63
JMJD1C-211ENST00000633035 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.22■■□□□ 1.63
JMJD1C-211ENST00000633035 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
JMJD1C-211ENST00000633035 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.2■■□□□ 1.62
JMJD1C-211ENST00000633035 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.2■■□□□ 1.62
JMJD1C-211ENST00000633035 ROCK1Q13464 1354 aa25.19■■□□□ 1.62
JMJD1C-211ENST00000633035 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
JMJD1C-211ENST00000633035 CEP152O94986 1710 aa25.18■■□□□ 1.62
JMJD1C-211ENST00000633035 PKD2Q13563 968 aa25.17■■□□□ 1.62
JMJD1C-211ENST00000633035 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
JMJD1C-211ENST00000633035 STRCQ7RTU9 1775 aa25.17■■□□□ 1.62
JMJD1C-211ENST00000633035 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
JMJD1C-211ENST00000633035 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.16■■□□□ 1.62
JMJD1C-211ENST00000633035 DEPDC5O75140 1603 aa25.15■■□□□ 1.62
JMJD1C-211ENST00000633035 NLRP1Q9C000 1473 aa25.15■■□□□ 1.62
JMJD1C-211ENST00000633035 PTPRTO14522 1441 aa25.14■■□□□ 1.62
JMJD1C-211ENST00000633035 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
JMJD1C-211ENST00000633035 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.13■■□□□ 1.61
JMJD1C-211ENST00000633035 ERVK-7P63135 1459 aa25.13■■□□□ 1.61
JMJD1C-211ENST00000633035 PLA2R1Q13018 1463 aa25.12■■□□□ 1.61
JMJD1C-211ENST00000633035 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.11■■□□□ 1.61
JMJD1C-211ENST00000633035 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
JMJD1C-211ENST00000633035 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.09■■□□□ 1.61
JMJD1C-211ENST00000633035 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
JMJD1C-211ENST00000633035 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.08■■□□□ 1.61
JMJD1C-211ENST00000633035 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.07■■□□□ 1.6
JMJD1C-211ENST00000633035 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.07■■□□□ 1.6
JMJD1C-211ENST00000633035 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.05■■□□□ 1.6
JMJD1C-211ENST00000633035 CERKQ8TCT0 537 aa25.05■■□□□ 1.6
JMJD1C-211ENST00000633035 FBXO41Q8TF61 875 aa25.02■■□□□ 1.6
JMJD1C-211ENST00000633035 NUP155O75694 1391 aa25.01■■□□□ 1.59
JMJD1C-211ENST00000633035 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.99■■□□□ 1.59
JMJD1C-211ENST00000633035 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.98■■□□□ 1.59
JMJD1C-211ENST00000633035 UNC13BO14795 1591 aa24.97■■□□□ 1.59
JMJD1C-211ENST00000633035 IDI1Q13907 227 aa24.97■■□□□ 1.59
JMJD1C-211ENST00000633035 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
JMJD1C-211ENST00000633035 EID1Q9Y6B2 187 aa24.95■■□□□ 1.58
JMJD1C-211ENST00000633035 TET3O43151 1660 aa24.94■■□□□ 1.58
JMJD1C-211ENST00000633035 NOS1P29475 1434 aa24.94■■□□□ 1.58
JMJD1C-211ENST00000633035 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.93■■□□□ 1.58
JMJD1C-211ENST00000633035 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
JMJD1C-211ENST00000633035 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
JMJD1C-211ENST00000633035 NAIPQ13075 1403 aa24.91■■□□□ 1.58
JMJD1C-211ENST00000633035 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.9■■□□□ 1.58
JMJD1C-211ENST00000633035 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
JMJD1C-211ENST00000633035 TRIM52Q96A61 297 aa24.9■■□□□ 1.58
JMJD1C-211ENST00000633035 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.89■■□□□ 1.58
JMJD1C-211ENST00000633035 PIK3C2BO00750 1634 aa24.89■■□□□ 1.57
JMJD1C-211ENST00000633035 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.89■■□□□ 1.57
JMJD1C-211ENST00000633035 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
JMJD1C-211ENST00000633035 SYNMO15061 1565 aa24.87■■□□□ 1.57
JMJD1C-211ENST00000633035 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.86■■□□□ 1.57
JMJD1C-211ENST00000633035 MED14O60244 1454 aa24.86■■□□□ 1.57
JMJD1C-211ENST00000633035 HFM1A2PYH4 1435 aa24.86■■□□□ 1.57
JMJD1C-211ENST00000633035 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
JMJD1C-211ENST00000633035 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.85■■□□□ 1.57
JMJD1C-211ENST00000633035 LTKP29376 864 aa24.85■■□□□ 1.57
JMJD1C-211ENST00000633035 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.84■■□□□ 1.57
JMJD1C-211ENST00000633035 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
JMJD1C-211ENST00000633035 SLIT1O75093 1534 aa24.83■■□□□ 1.57
JMJD1C-211ENST00000633035 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.83■■□□□ 1.56
JMJD1C-211ENST00000633035 E9PCH4 1651 aa24.82■■□□□ 1.56
JMJD1C-211ENST00000633035 BCANQ96GW7 911 aa24.8■■□□□ 1.56
JMJD1C-211ENST00000633035 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
JMJD1C-211ENST00000633035 IQGAP1P46940 1657 aa24.79■■□□□ 1.56
JMJD1C-211ENST00000633035 ADGRB3O60242 1522 aa24.79■■□□□ 1.56
JMJD1C-211ENST00000633035 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
JMJD1C-211ENST00000633035 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
JMJD1C-211ENST00000633035 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.76■■□□□ 1.55
JMJD1C-211ENST00000633035 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
JMJD1C-211ENST00000633035 CPS1P31327 1500 aa24.72■■□□□ 1.55
JMJD1C-211ENST00000633035 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
JMJD1C-211ENST00000633035 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.69■■□□□ 1.54
JMJD1C-211ENST00000633035 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.69■■□□□ 1.54
JMJD1C-211ENST00000633035 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.69■■□□□ 1.54
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