RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa10.02□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 WDR62O43379 1518 aa10.02□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa10.01□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 CEP170Q5SW79 1584 aa10.01□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 RSPH4AQ5TD94 716 aa10.01□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 KIAA0556O60303 1618 aa10.01□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 AKNAQ7Z591 1439 aa10.01□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 POGKQ9P215 609 aa10.01□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 PBRM1Q86U86 1689 aa10□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 CFAP43Q8NDM7 1665 aa10□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 KIF14Q15058 1648 aa10□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 KANK1Q14678 1352 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 SAMD9Q5K651 1589 aa9.99□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 ZBTB7CA1YPR0 619 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 SKAP1Q86WV1 359 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 CNTLNQ9NXG0 1405 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 NBR1Q14596 966 aa9.98□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PKP4-217ENST00000628904 ERCC6L2Q5T890 1561 aa9.96□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 ROCK1Q13464 1354 aa9.96□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.828e-7■■■□□ 15.7
PKP4-217ENST00000628904 BCL2L13Q9BXK5 485 aa9.96□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa9.95□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa9.95□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 C14orf37Q86TY3 774 aa9.95□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 MORC1Q86VD1 984 aa9.95□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 CABP2Q9NPB3 220 aa9.95□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 RGS3P49796 1198 aa9.94□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 PPP4R2Q9NY27 417 aa9.94□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.94□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 NUP160Q12769 1436 aa9.94□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa9.94□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 NLRP13Q86W25 1043 aa9.94□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 EXOC6Q8TAG9 804 aa9.93□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 SYCP2Q9BX26 1530 aa9.93□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 APAF1O14727 1248 aa9.92□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 FBLN1P23142 703 aa9.92□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 CLUAP1Q96AJ1 413 aa9.92□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 RCAN3Q9UKA8 241 aa9.92□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 PZPP20742 1482 aa9.92□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 CCDC141Q6ZP82 1450 aa9.92□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 NUDCQ9Y266 331 aa9.92□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 RALBP1Q15311 655 aa9.9□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.9□□□□□ -0.82
PKP4-217ENST00000628904 DISP3Q9P2K9 1392 aa9.9□□□□□ -0.83
PKP4-217ENST00000628904 CDCA8Q53HL2 280 aa9.9□□□□□ -0.83
PKP4-217ENST00000628904 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.9□□□□□ -0.83
PKP4-217ENST00000628904 ZBED9Q6R2W3 1325 aa9.89□□□□□ -0.83
PKP4-217ENST00000628904 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PKP4-217ENST00000628904 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PKP4-217ENST00000628904 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PKP4-217ENST00000628904 LMOD2Q6P5Q4 547 aa9.87□□□□□ -0.83
PKP4-217ENST00000628904 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PKP4-217ENST00000628904 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PKP4-217ENST00000628904 FANCAO15360 1455 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-217ENST00000628904 IDI1Q13907 227 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-217ENST00000628904 PPP2R1AP30153 589 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-217ENST00000628904 ADGRL1O94910 1474 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-217ENST00000628904 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PKP4-217ENST00000628904 CD109Q6YHK3 1445 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-217ENST00000628904 WAPLQ7Z5K2 1190 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-217ENST00000628904 NEFMP07197 916 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-217ENST00000628904 ASXL2Q76L83 1435 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-217ENST00000628904 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PKP4-217ENST00000628904 CRBNQ96SW2 442 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-217ENST00000628904 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PKP4-217ENST00000628904 ERBINQ96RT1 1412 aa9.83□□□□□ -0.84
PKP4-217ENST00000628904 PRAM1Q96QH2 718 aa9.83□□□□□ -0.84
PKP4-217ENST00000628904 TESK2Q96S53 571 aa9.83□□□□□ -0.84
PKP4-217ENST00000628904 MTHFSP49914 203 aa9.83□□□□□ -0.84
PKP4-217ENST00000628904 TXNDC2Q86VQ3 553 aa9.83□□□□□ -0.84
PKP4-217ENST00000628904 C20orf194Q5TEA3 1177 aa9.82□□□□□ -0.84
PKP4-217ENST00000628904 PLCH2O75038 1416 aa9.82□□□□□ -0.84
PKP4-217ENST00000628904 TEX14Q8IWB6 1497 aa9.82□□□□□ -0.84
PKP4-217ENST00000628904 NUTM2GQ5VZR2 741 aa9.82□□□□□ -0.84
PKP4-217ENST00000628904 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PKP4-217ENST00000628904 MBD5Q9P267 1494 aa9.82□□□□□ -0.84
PKP4-217ENST00000628904 SLC26A8Q96RN1 970 aa9.82□□□□□ -0.84
PKP4-217ENST00000628904 HMOX1P09601 288 aa9.81□□□□□ -0.84
PKP4-217ENST00000628904 GOLGA2Q08379 1002 aa9.81□□□□□ -0.84
PKP4-217ENST00000628904 CFAP53Q96M91 514 aa9.81□□□□□ -0.84
PKP4-217ENST00000628904 FAM135AQ9P2D6 1515 aa9.81□□□□□ -0.84
PKP4-217ENST00000628904 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PKP4-217ENST00000628904 BCAR3O75815 825 aa9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms