RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.31■■■■□ 3.4
CAPNS1-215ENST00000628018 DEPDC5O75140 1603 aa36.3■■■■□ 3.4
CAPNS1-215ENST00000628018 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.3■■■■□ 3.4
CAPNS1-215ENST00000628018 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.3■■■■□ 3.4
CAPNS1-215ENST00000628018 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXD1Q16676 465 aa36.26■■■■□ 3.4
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.25■■■■□ 3.39
CAPNS1-215ENST00000628018 PKD2Q13563 968 aa36.24■■■■□ 3.39
CAPNS1-215ENST00000628018 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.24■■■■□ 3.39
CAPNS1-215ENST00000628018 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.24■■■■□ 3.39
CAPNS1-215ENST00000628018 NEUROD1Q13562 356 aa36.23■■■■□ 3.39
CAPNS1-215ENST00000628018 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.21■■■■□ 3.39
CAPNS1-215ENST00000628018 KIF3BO15066 747 aa36.21■■■■□ 3.39
CAPNS1-215ENST00000628018 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
CAPNS1-215ENST00000628018 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-215ENST00000628018 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-215ENST00000628018 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-215ENST00000628018 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.16■■■■□ 3.38
CAPNS1-215ENST00000628018 KANK1Q14678 1352 aa36.1■■■■□ 3.37
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP10AO60312 1499 aa36.1■■■■□ 3.37
CAPNS1-215ENST00000628018 REREQ9P2R6 1566 aa36.08■■■■□ 3.37
CAPNS1-215ENST00000628018 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
CAPNS1-215ENST00000628018 TET3O43151 1660 aa36.05■■■■□ 3.36
CAPNS1-215ENST00000628018 TONSLQ96HA7 1378 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.03■■■■□ 3.36
CAPNS1-215ENST00000628018 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.01■■■■□ 3.35
CAPNS1-215ENST00000628018 E9PCH4 1651 aa36■■■■□ 3.35
CAPNS1-215ENST00000628018 AGLP35573 1532 aa35.96■■■■□ 3.35
CAPNS1-215ENST00000628018 GGT6Q6P531 493 aa35.96■■■■□ 3.35
CAPNS1-215ENST00000628018 PLA2R1Q13018 1463 aa35.95■■■■□ 3.35
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP152O94986 1710 aa35.94■■■■□ 3.34
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
CAPNS1-215ENST00000628018 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.91■■■■□ 3.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCC3O15438 1527 aa35.89■■■■□ 3.34
CAPNS1-215ENST00000628018 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.89■■■■□ 3.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPRTO14522 1441 aa35.85■■■■□ 3.33
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.85■■■■□ 3.33
CAPNS1-215ENST00000628018 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.84■■■■□ 3.33
CAPNS1-215ENST00000628018 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.83■■■■□ 3.33
CAPNS1-215ENST00000628018 L3MBTL2Q969R5 705 aa35.83■■■■□ 3.33
CAPNS1-215ENST00000628018 TRPM2O94759 1503 aa35.82■■■■□ 3.32
CAPNS1-215ENST00000628018 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.8■■■■□ 3.32
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.75■■■■□ 3.31
CAPNS1-215ENST00000628018 NPATQ14207 1427 aa35.75■■■■□ 3.31
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.72■■■■□ 3.31
CAPNS1-215ENST00000628018 CLTCL1P53675 1640 aa35.69■■■■□ 3.3
CAPNS1-215ENST00000628018 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.62■■■■□ 3.29
CAPNS1-215ENST00000628018 NOS1P29475 1434 aa35.61■■■■□ 3.29
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.61■■■■□ 3.29
CAPNS1-215ENST00000628018 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-215ENST00000628018 MLECQ14165 292 aa35.59■■■■□ 3.29
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-215ENST00000628018 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-215ENST00000628018 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.57■■■■□ 3.29
CAPNS1-215ENST00000628018 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.57■■■■□ 3.29
CAPNS1-215ENST00000628018 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
CAPNS1-215ENST00000628018 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.55■■■■□ 3.28
CAPNS1-215ENST00000628018 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-215ENST00000628018 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.53■■■■□ 3.28
CAPNS1-215ENST00000628018 SYNMO15061 1565 aa35.53■■■■□ 3.28
CAPNS1-215ENST00000628018 RGL3Q3MIN7 710 aa35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-215ENST00000628018 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-215ENST00000628018 KIF1BO60333 1816 aa35.51■■■■□ 3.28
CAPNS1-215ENST00000628018 PIK3C2BO00750 1634 aa35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ERVK-7P63135 1459 aa35.44■■■■□ 3.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
CAPNS1-215ENST00000628018 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.44■■■■□ 3.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ADGRB3O60242 1522 aa35.43■■■■□ 3.26
CAPNS1-215ENST00000628018 MROH2AA6NES4 1674 aa35.42■■■■□ 3.26
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ZMYM3Q14202 1370 aa35.4■■■■□ 3.26
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.4■■■■□ 3.26
CAPNS1-215ENST00000628018 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.39■■■■□ 3.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.38■■■■□ 3.25
CAPNS1-215ENST00000628018 STAC3Q96MF2 364 aa35.37■■■■□ 3.25
CAPNS1-215ENST00000628018 RALGAPBQ86X10 1494 aa35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-215ENST00000628018 IFT172Q9UG01 1749 aa35.33■■■■□ 3.25
CAPNS1-215ENST00000628018 IDI1Q13907 227 aa35.32■■■■□ 3.25
CAPNS1-215ENST00000628018 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa35.31■■■■□ 3.24
CAPNS1-215ENST00000628018 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-215ENST00000628018 MADDQ8WXG6 1647 aa35.29■■■■□ 3.24
CAPNS1-215ENST00000628018 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
CAPNS1-215ENST00000628018 MYOM2P54296 1465 aa35.27■■■■□ 3.24
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.25■■■■□ 3.23
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-215ENST00000628018 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa35.23■■■■□ 3.23
CAPNS1-215ENST00000628018 PPLO60437 1756 aa35.23■■■■□ 3.23
CAPNS1-215ENST00000628018 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
CAPNS1-215ENST00000628018 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
CAPNS1-215ENST00000628018 C3P01024 1663 aa35.19■■■■□ 3.22
CAPNS1-215ENST00000628018 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.18■■■■□ 3.22
CAPNS1-215ENST00000628018 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.18■■■■□ 3.22
CAPNS1-215ENST00000628018 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-215ENST00000628018 GPRASP1Q5JY77 1395 aa35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-215ENST00000628018 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-215ENST00000628018 TNRQ92752 1358 aa35.15■■■■□ 3.22
CAPNS1-215ENST00000628018 CARD11Q9BXL7 1154 aa35.15■■■■□ 3.22
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