RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623047.1

CU638689.4-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CU638689.4, Length 5,990 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU638689.4-201ENST00000623047 CERKQ8TCT0 537 aa10.03□□□□□ -0.8
CU638689.4-201ENST00000623047 ABCC2Q92887 1545 aa10.03□□□□□ -0.8
CU638689.4-201ENST00000623047 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 KDM6BO15054 1643 aa10.02□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 RAPGEF3O95398 923 aa10.02□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 KIF21BO75037 1637 aa10.02□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 CANXP27824 592 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 IGF1RP08069 1367 aa10.01□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 MIA2Q96PC5 1412 aa10□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa10□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 KIF15Q9NS87 1388 aa9.99□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa9.99□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 DAPK1P53355 1430 aa9.99□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 ARHGEF6Q15052 776 aa9.99□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 PLEKHG5O94827 1062 aa9.98□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 CCDC125Q86Z20 511 aa9.98□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.98□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 TMF1P82094 1093 aa9.97□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 NLRP13Q86W25 1043 aa9.97□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 STK32BQ9NY57 414 aa9.97□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 AMPHP49418 695 aa9.97□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 C1orf141Q5JVX7 400 aa9.97□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 NPHP3Q7Z494 1330 aa9.97□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa9.97□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 NUP155O75694 1391 aa9.96□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa9.96□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 ABCC10Q5T3U5 1492 aa9.96□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 MYH16Q9H6N6 1097 aa9.96□□□□□ -0.81
CU638689.4-201ENST00000623047 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.96□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 KIF14Q15058 1648 aa9.96□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 ATP10AO60312 1499 aa9.96□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 RXRBP28702 533 aa9.96□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 LMOD3Q0VAK6 560 aa9.95□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 YEATS2Q9ULM3 1422 aa9.95□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 KNSTRNQ9Y448 316 aa9.95□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa9.95□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 EVC2Q86UK5 1308 aa9.94□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 KCNH5Q8NCM2 988 aa9.94□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa9.93□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 FLAD1Q8NFF5 587 aa9.93□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 NUP160Q12769 1436 aa9.93□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 PRDM11Q9NQV5 511 aa9.92□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 SMC4Q9NTJ3 1288 aa9.92□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 AIDAQ96BJ3 306 aa9.92□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 TTC5Q8N0Z6 440 aa9.91□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 RGL3Q3MIN7 710 aa9.91□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 ESCO1Q5FWF5 840 aa9.9□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 CCDC144AA2RUR9 1427 aa9.9□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa9.9□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 STK26Q9P289 416 aa9.9□□□□□ -0.82
CU638689.4-201ENST00000623047 MS4A1P11836 297 aa9.9□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 COG3Q96JB2 828 aa9.89□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa9.89□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa9.88□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa9.88□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa9.88□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 C19orf44Q9H6X5 657 aa9.88□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa9.87□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 CLSPNQ9HAW4 1339 aa9.87□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 A0A087WZG4 1122 aa9.87□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 ADAMTS12P58397 1594 aa9.87□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa9.86□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 TRIM34Q9BYJ4 488 aa9.86□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 TATP17735 454 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.86□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 AMOTL1Q8IY63 956 aa9.85□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa9.85□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 SPG7Q9UQ90 795 aa9.85□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 HFM1A2PYH4 1435 aa9.84□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 CCDC141Q6ZP82 1450 aa9.84□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 ZNF652Q9Y2D9 606 aa9.84□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.84□□□□□ -0.83
CU638689.4-201ENST00000623047 KCNA6P17658 529 aa9.84□□□□□ -0.84
CU638689.4-201ENST00000623047 CARD11Q9BXL7 1154 aa9.84□□□□□ -0.84
CU638689.4-201ENST00000623047 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa9.83□□□□□ -0.84
CU638689.4-201ENST00000623047 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CU638689.4-201ENST00000623047 CABP2Q9NPB3 220 aa9.83□□□□□ -0.84
CU638689.4-201ENST00000623047 PLCH2O75038 1416 aa9.83□□□□□ -0.84
CU638689.4-201ENST00000623047 SSFA2P28290 1259 aa9.83□□□□□ -0.84
CU638689.4-201ENST00000623047 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CU638689.4-201ENST00000623047 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70 ms