RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619989.1

CCL3L3-203, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL3L3, Length 784 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-203ENST00000619989 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.82■□□□□ 0.92
CCL3L3-203ENST00000619989 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.81■□□□□ 0.92
CCL3L3-203ENST00000619989 KIF15Q9NS87 1388 aa20.81■□□□□ 0.92
CCL3L3-203ENST00000619989 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.8■□□□□ 0.92
CCL3L3-203ENST00000619989 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.76■□□□□ 0.91
CCL3L3-203ENST00000619989 NCOA1Q15788 1441 aa20.76■□□□□ 0.91
CCL3L3-203ENST00000619989 PTPRKQ15262 1439 aa20.75■□□□□ 0.91
CCL3L3-203ENST00000619989 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.75■□□□□ 0.91
CCL3L3-203ENST00000619989 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.74■□□□□ 0.91
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CCL3L3-203ENST00000619989 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.73■□□□□ 0.91
CCL3L3-203ENST00000619989 ZMYM3Q14202 1370 aa20.72■□□□□ 0.91
CCL3L3-203ENST00000619989 ADGRL2O95490 1459 aa20.71■□□□□ 0.91
CCL3L3-203ENST00000619989 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.7■□□□□ 0.9
CCL3L3-203ENST00000619989 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
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CCL3L3-203ENST00000619989 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
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CCL3L3-203ENST00000619989 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.64■□□□□ 0.89
CCL3L3-203ENST00000619989 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
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CCL3L3-203ENST00000619989 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CCL3L3-203ENST00000619989 KANK1Q14678 1352 aa20.6■□□□□ 0.89
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CCL3L3-203ENST00000619989 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.59■□□□□ 0.89
CCL3L3-203ENST00000619989 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.59■□□□□ 0.89
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CCL3L3-203ENST00000619989 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
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CCL3L3-203ENST00000619989 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.55■□□□□ 0.88
CCL3L3-203ENST00000619989 PZPP20742 1482 aa20.55■□□□□ 0.88
CCL3L3-203ENST00000619989 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.54■□□□□ 0.88
CCL3L3-203ENST00000619989 CEP152O94986 1710 aa20.54■□□□□ 0.88
CCL3L3-203ENST00000619989 DEPDC5O75140 1603 aa20.53■□□□□ 0.88
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CCL3L3-203ENST00000619989 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.49■□□□□ 0.87
CCL3L3-203ENST00000619989 NAIPQ13075 1403 aa20.49■□□□□ 0.87
CCL3L3-203ENST00000619989 NUP155O75694 1391 aa20.47■□□□□ 0.87
CCL3L3-203ENST00000619989 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CCL3L3-203ENST00000619989 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.47■□□□□ 0.87
CCL3L3-203ENST00000619989 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.45■□□□□ 0.86
CCL3L3-203ENST00000619989 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.45■□□□□ 0.86
CCL3L3-203ENST00000619989 HFM1A2PYH4 1435 aa20.44■□□□□ 0.86
CCL3L3-203ENST00000619989 ERVK-7P63135 1459 aa20.44■□□□□ 0.86
CCL3L3-203ENST00000619989 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.44■□□□□ 0.86
CCL3L3-203ENST00000619989 UNC13BO14795 1591 aa20.43■□□□□ 0.86
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CCL3L3-203ENST00000619989 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.41■□□□□ 0.86
CCL3L3-203ENST00000619989 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CCL3L3-203ENST00000619989 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.4■□□□□ 0.86
CCL3L3-203ENST00000619989 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.39■□□□□ 0.85
CCL3L3-203ENST00000619989 NLRP1Q9C000 1473 aa20.38■□□□□ 0.85
CCL3L3-203ENST00000619989 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CCL3L3-203ENST00000619989 TET3O43151 1660 aa20.37■□□□□ 0.85
CCL3L3-203ENST00000619989 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CCL3L3-203ENST00000619989 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.36■□□□□ 0.85
CCL3L3-203ENST00000619989 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.36■□□□□ 0.85
CCL3L3-203ENST00000619989 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.35■□□□□ 0.85
CCL3L3-203ENST00000619989 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.34■□□□□ 0.85
CCL3L3-203ENST00000619989 IDI1Q13907 227 aa20.34■□□□□ 0.85
CCL3L3-203ENST00000619989 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CCL3L3-203ENST00000619989 NOS1P29475 1434 aa20.33■□□□□ 0.84
CCL3L3-203ENST00000619989 STRCQ7RTU9 1775 aa20.32■□□□□ 0.84
CCL3L3-203ENST00000619989 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.32■□□□□ 0.84
CCL3L3-203ENST00000619989 PKD2Q13563 968 aa20.31■□□□□ 0.84
CCL3L3-203ENST00000619989 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CCL3L3-203ENST00000619989 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.31■□□□□ 0.84
CCL3L3-203ENST00000619989 E9PCH4 1651 aa20.3■□□□□ 0.84
CCL3L3-203ENST00000619989 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.3■□□□□ 0.84
CCL3L3-203ENST00000619989 SYNMO15061 1565 aa20.29■□□□□ 0.84
CCL3L3-203ENST00000619989 PLA2R1Q13018 1463 aa20.29■□□□□ 0.84
CCL3L3-203ENST00000619989 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CCL3L3-203ENST00000619989 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CCL3L3-203ENST00000619989 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCL3L3-203ENST00000619989 PIK3C2BO00750 1634 aa20.26■□□□□ 0.83
CCL3L3-203ENST00000619989 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.25■□□□□ 0.83
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CCL3L3-203ENST00000619989 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CCL3L3-203ENST00000619989 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.24■□□□□ 0.83
CCL3L3-203ENST00000619989 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.23■□□□□ 0.83
CCL3L3-203ENST00000619989 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.22■□□□□ 0.83
CCL3L3-203ENST00000619989 EID1Q9Y6B2 187 aa20.22■□□□□ 0.83
CCL3L3-203ENST00000619989 LTKP29376 864 aa20.21■□□□□ 0.83
CCL3L3-203ENST00000619989 TMEM2Q9UHN6 1383 aa20.19■□□□□ 0.82
CCL3L3-203ENST00000619989 ADGRB3O60242 1522 aa20.17■□□□□ 0.82
CCL3L3-203ENST00000619989 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CCL3L3-203ENST00000619989 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.16■□□□□ 0.82
CCL3L3-203ENST00000619989 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CCL3L3-203ENST00000619989 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.16■□□□□ 0.82
CCL3L3-203ENST00000619989 SLIT1O75093 1534 aa20.16■□□□□ 0.82
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