RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619976.1

SYNRG-227, Transcript of synergin gamma, human

TSL 2

Gene SYNRG, Length 1,375 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SYNRG-227	ENST00000619976	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		43.13	■■■■■ 4.49
SYNRG-227	ENST00000619976	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	43.1	■■■■■ 4.49
SYNRG-227	ENST00000619976	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		43.09	■■■■■ 4.49
SYNRG-227	ENST00000619976	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		43.09	■■■■■ 4.49
SYNRG-227	ENST00000619976	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	43.09	■■■■■ 4.49
SYNRG-227	ENST00000619976	STRC	Q7RTU9	1775 aa		43.06	■■■■■ 4.48
SYNRG-227	ENST00000619976	KIF15	Q9NS87	1388 aa		43.05	■■■■■ 4.48
SYNRG-227	ENST00000619976	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		43.02	■■■■■ 4.48
SYNRG-227	ENST00000619976	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		43.02	■■■■■ 4.48
SYNRG-227	ENST00000619976	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	42.99	■■■■■ 4.47
SYNRG-227	ENST00000619976	PZP	P20742	1482 aa		42.98	■■■■■ 4.47
SYNRG-227	ENST00000619976	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		42.97	■■■■■ 4.47
SYNRG-227	ENST00000619976	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	42.96	■■■■■ 4.47
SYNRG-227	ENST00000619976	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	42.96	■■■■■ 4.47
SYNRG-227	ENST00000619976	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		42.95	■■■■■ 4.47
SYNRG-227	ENST00000619976	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		42.95	■■■■■ 4.47
SYNRG-227	ENST00000619976	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		42.94	■■■■■ 4.47
SYNRG-227	ENST00000619976	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	42.94	■■■■■ 4.46
SYNRG-227	ENST00000619976	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		42.93	■■■■■ 4.46
SYNRG-227	ENST00000619976	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	42.93	■■■■■ 4.46
SYNRG-227	ENST00000619976	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	42.93	■■■■■ 4.46
SYNRG-227	ENST00000619976	ABCC3	O15438	1527 aa		42.93	■■■■■ 4.46
SYNRG-227	ENST00000619976	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		42.9	■■■■■ 4.46
SYNRG-227	ENST00000619976	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.9	■■■■■ 4.46
SYNRG-227	ENST00000619976	TNR	Q92752	1358 aa		42.88	■■■■■ 4.45
SYNRG-227	ENST00000619976	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	42.84	■■■■■ 4.45
SYNRG-227	ENST00000619976	CEP152	O94986	1710 aa		42.84	■■■■■ 4.45
SYNRG-227	ENST00000619976	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		42.83	■■■■■ 4.45
SYNRG-227	ENST00000619976	ADGRL2	O95490	1459 aa		42.83	■■■■■ 4.45
SYNRG-227	ENST00000619976	PTPRT	O14522	1441 aa		42.83	■■■■■ 4.45
SYNRG-227	ENST00000619976	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	42.81	■■■■■ 4.44
SYNRG-227	ENST00000619976	DEPDC5	O75140	1603 aa		42.77	■■■■■ 4.44
SYNRG-227	ENST00000619976	PLA2R1	Q13018	1463 aa		42.76	■■■■■ 4.44
SYNRG-227	ENST00000619976	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	42.74	■■■■■ 4.43	3e-6	■■□□□ 11.4
SYNRG-227	ENST00000619976	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		42.72	■■■■■ 4.43
SYNRG-227	ENST00000619976	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		42.7	■■■■■ 4.43
SYNRG-227	ENST00000619976	FBXO41	Q8TF61	875 aa		42.7	■■■■■ 4.43
SYNRG-227	ENST00000619976	NLRP1	Q9C000	1473 aa		42.7	■■■■■ 4.43
SYNRG-227	ENST00000619976	KANK1	Q14678	1352 aa		42.69	■■■■■ 4.42
SYNRG-227	ENST00000619976	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	42.69	■■■■■ 4.42
SYNRG-227	ENST00000619976	PKD2	Q13563	968 aa		42.68	■■■■■ 4.42
SYNRG-227	ENST00000619976	ERVK-7	P63135	1459 aa		42.68	■■■■■ 4.42
SYNRG-227	ENST00000619976	CERK	Q8TCT0	537 aa		42.66	■■■■■ 4.42
SYNRG-227	ENST00000619976	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		42.64	■■■■■ 4.42
SYNRG-227	ENST00000619976	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		42.62	■■■■■ 4.41
SYNRG-227	ENST00000619976	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		42.6	■■■■■ 4.41
SYNRG-227	ENST00000619976	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	42.6	■■■■■ 4.41
SYNRG-227	ENST00000619976	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		42.59	■■■■■ 4.41
SYNRG-227	ENST00000619976	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	42.57	■■■■■ 4.41
SYNRG-227	ENST00000619976	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		42.57	■■■■■ 4.41
SYNRG-227	ENST00000619976	ROCK1	Q13464	1354 aa		42.55	■■■■■ 4.4
SYNRG-227	ENST00000619976	ITGAE	P38570	1179 aa		42.52	■■■■■ 4.4
SYNRG-227	ENST00000619976	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	42.52	■■■■■ 4.4
SYNRG-227	ENST00000619976	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		42.47	■■■■■ 4.39
SYNRG-227	ENST00000619976	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		42.46	■■■■■ 4.39
SYNRG-227	ENST00000619976	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		42.45	■■■■■ 4.39
SYNRG-227	ENST00000619976	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		42.44	■■■■■ 4.38
SYNRG-227	ENST00000619976	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	42.43	■■■■■ 4.38
SYNRG-227	ENST00000619976	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		42.41	■■■■■ 4.38
SYNRG-227	ENST00000619976	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	42.39	■■■■■ 4.38
SYNRG-227	ENST00000619976	UNC13B	O14795	1591 aa		42.38	■■■■■ 4.38
SYNRG-227	ENST00000619976	TET3	O43151	1660 aa		42.32	■■■■■ 4.37
SYNRG-227	ENST00000619976	MED14	O60244	1454 aa		42.32	■■■■■ 4.37
SYNRG-227	ENST00000619976	PIK3C2B	O00750	1634 aa		42.31	■■■■■ 4.36
SYNRG-227	ENST00000619976	NOS1	P29475	1434 aa		42.31	■■■■■ 4.36
SYNRG-227	ENST00000619976	SYNM	O15061	1565 aa		42.31	■■■■■ 4.36
SYNRG-227	ENST00000619976	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	42.3	■■■■■ 4.36
SYNRG-227	ENST00000619976	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	42.29	■■■■■ 4.36
SYNRG-227	ENST00000619976	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		42.27	■■■■■ 4.36
SYNRG-227	ENST00000619976	IDI1	Q13907	227 aa		42.27	■■■■■ 4.36
SYNRG-227	ENST00000619976	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		42.25	■■■■■ 4.35
SYNRG-227	ENST00000619976	IQGAP1	P46940	1657 aa		42.23	■■■■■ 4.35
SYNRG-227	ENST00000619976	SLIT1	O75093	1534 aa		42.23	■■■■■ 4.35
SYNRG-227	ENST00000619976	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		42.23	■■■■■ 4.35
SYNRG-227	ENST00000619976	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		42.23	■■■■■ 4.35
SYNRG-227	ENST00000619976	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		42.22	■■■■■ 4.35
SYNRG-227	ENST00000619976	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	42.21	■■■■■ 4.35
SYNRG-227	ENST00000619976	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	42.19	■■■■■ 4.34
SYNRG-227	ENST00000619976	NUP155	O75694	1391 aa		42.18	■■■■■ 4.34
SYNRG-227	ENST00000619976	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		42.18	■■■■■ 4.34
SYNRG-227	ENST00000619976	LTK	P29376	864 aa		42.15	■■■■■ 4.34
SYNRG-227	ENST00000619976	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		42.15	■■■■■ 4.34
SYNRG-227	ENST00000619976		E9PCH4	1651 aa		42.15	■■■■■ 4.34
SYNRG-227	ENST00000619976	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		42.14	■■■■■ 4.34
SYNRG-227	ENST00000619976	EID1	Q9Y6B2	187 aa		42.13	■■■■■ 4.33
SYNRG-227	ENST00000619976	ADGRB3	O60242	1522 aa		42.11	■■■■■ 4.33
SYNRG-227	ENST00000619976	CPS1	P31327	1500 aa		42.08	■■■■■ 4.33
SYNRG-227	ENST00000619976	NAIP	Q13075	1403 aa		42.08	■■■■■ 4.33
SYNRG-227	ENST00000619976	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		41.98	■■■■■ 4.31
SYNRG-227	ENST00000619976	HFM1	A2PYH4	1435 aa		41.97	■■■■■ 4.31
SYNRG-227	ENST00000619976	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		41.95	■■■■■ 4.31
SYNRG-227	ENST00000619976	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		41.95	■■■■■ 4.31
SYNRG-227	ENST00000619976	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		41.94	■■■■■ 4.3
SYNRG-227	ENST00000619976	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	41.88	■■■■■ 4.3
SYNRG-227	ENST00000619976	ZFYVE9	O95405	1425 aa		41.86	■■■■■ 4.29
SYNRG-227	ENST00000619976	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		41.86	■■■■■ 4.29
SYNRG-227	ENST00000619976	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		41.85	■■■■■ 4.29
SYNRG-227	ENST00000619976	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	41.82	■■■■■ 4.29
SYNRG-227	ENST00000619976	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		41.82	■■■■■ 4.28
SYNRG-227	ENST00000619976	TRIM52	Q96A61	297 aa		41.81	■■■■■ 4.28

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