RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617744.4

NUDT13-208, Transcript of nudix hydrolase 13, human

TSL 5 BASIC

Gene NUDT13, Length 928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUDT13-208	ENST00000617744	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		12.17	□□□□□ -0.46
NUDT13-208	ENST00000617744	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
NUDT13-208	ENST00000617744	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		12.15	□□□□□ -0.46
NUDT13-208	ENST00000617744	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		12.14	□□□□□ -0.47
NUDT13-208	ENST00000617744	PTPRK	Q15262	1439 aa		12.14	□□□□□ -0.47
NUDT13-208	ENST00000617744	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		12.13	□□□□□ -0.47
NUDT13-208	ENST00000617744	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		12.13	□□□□□ -0.47
NUDT13-208	ENST00000617744	NCOA1	Q15788	1441 aa		12.12	□□□□□ -0.47
NUDT13-208	ENST00000617744	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		12.12	□□□□□ -0.47
NUDT13-208	ENST00000617744	KANK1	Q14678	1352 aa		12.12	□□□□□ -0.47
NUDT13-208	ENST00000617744	TNR	Q92752	1358 aa		12.12	□□□□□ -0.47
NUDT13-208	ENST00000617744	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		12.12	□□□□□ -0.47
NUDT13-208	ENST00000617744	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
NUDT13-208	ENST00000617744	MROH2A	A6NES4	1674 aa		12.1	□□□□□ -0.47
NUDT13-208	ENST00000617744	NPAT	Q14207	1427 aa		12.1	□□□□□ -0.47
NUDT13-208	ENST00000617744	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		12.1	□□□□□ -0.47
NUDT13-208	ENST00000617744	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
NUDT13-208	ENST00000617744	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		12.09	□□□□□ -0.47
NUDT13-208	ENST00000617744	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
NUDT13-208	ENST00000617744	ABCC3	O15438	1527 aa		12.08	□□□□□ -0.48
NUDT13-208	ENST00000617744	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
NUDT13-208	ENST00000617744	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		12.08	□□□□□ -0.48
NUDT13-208	ENST00000617744	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		12.08	□□□□□ -0.48
NUDT13-208	ENST00000617744	CEP152	O94986	1710 aa		12.08	□□□□□ -0.48
NUDT13-208	ENST00000617744	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		12.07	□□□□□ -0.48
NUDT13-208	ENST00000617744	PZP	P20742	1482 aa		12.07	□□□□□ -0.48
NUDT13-208	ENST00000617744	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
NUDT13-208	ENST00000617744	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	12.05	□□□□□ -0.48
NUDT13-208	ENST00000617744	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		12.05	□□□□□ -0.48
NUDT13-208	ENST00000617744	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		12.05	□□□□□ -0.48
NUDT13-208	ENST00000617744	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
NUDT13-208	ENST00000617744	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
NUDT13-208	ENST00000617744	TRIM52	Q96A61	297 aa		12.05	□□□□□ -0.48
NUDT13-208	ENST00000617744	ADGRL2	O95490	1459 aa		12.05	□□□□□ -0.48
NUDT13-208	ENST00000617744	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
NUDT13-208	ENST00000617744	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
NUDT13-208	ENST00000617744	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		12.03	□□□□□ -0.48
NUDT13-208	ENST00000617744	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		12.03	□□□□□ -0.48
NUDT13-208	ENST00000617744	CERK	Q8TCT0	537 aa		12.03	□□□□□ -0.48
NUDT13-208	ENST00000617744	NUP155	O75694	1391 aa		12.03	□□□□□ -0.48
NUDT13-208	ENST00000617744	STRC	Q7RTU9	1775 aa		12.02	□□□□□ -0.48
NUDT13-208	ENST00000617744	PKD2	Q13563	968 aa		12.02	□□□□□ -0.49
NUDT13-208	ENST00000617744	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
NUDT13-208	ENST00000617744	ERVK-7	P63135	1459 aa		12.02	□□□□□ -0.49
NUDT13-208	ENST00000617744	BCAN	Q96GW7	911 aa		12.01	□□□□□ -0.49
NUDT13-208	ENST00000617744	ROCK1	Q13464	1354 aa		12.01	□□□□□ -0.49
NUDT13-208	ENST00000617744	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
NUDT13-208	ENST00000617744	IDI1	Q13907	227 aa		12	□□□□□ -0.49
NUDT13-208	ENST00000617744	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		12	□□□□□ -0.49
NUDT13-208	ENST00000617744	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
NUDT13-208	ENST00000617744	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		12	□□□□□ -0.49
NUDT13-208	ENST00000617744	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		12	□□□□□ -0.49
NUDT13-208	ENST00000617744	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
NUDT13-208	ENST00000617744	NLRP1	Q9C000	1473 aa		11.98	□□□□□ -0.49
NUDT13-208	ENST00000617744	PTPRT	O14522	1441 aa		11.98	□□□□□ -0.49
NUDT13-208	ENST00000617744	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
NUDT13-208	ENST00000617744	DEPDC5	O75140	1603 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUDT13-208	ENST00000617744	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUDT13-208	ENST00000617744	FBXO41	Q8TF61	875 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUDT13-208	ENST00000617744	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
NUDT13-208	ENST00000617744	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUDT13-208	ENST00000617744	LTK	P29376	864 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUDT13-208	ENST00000617744	EID1	Q9Y6B2	187 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUDT13-208	ENST00000617744	PLA2R1	Q13018	1463 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUDT13-208	ENST00000617744	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NUDT13-208	ENST00000617744	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NUDT13-208	ENST00000617744	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
NUDT13-208	ENST00000617744	NAIP	Q13075	1403 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NUDT13-208	ENST00000617744	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
NUDT13-208	ENST00000617744	FOXD1	Q16676	465 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NUDT13-208	ENST00000617744	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
NUDT13-208	ENST00000617744	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NUDT13-208	ENST00000617744	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NUDT13-208	ENST00000617744	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
NUDT13-208	ENST00000617744	PIK3C2B	O00750	1634 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NUDT13-208	ENST00000617744	UNC13B	O14795	1591 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NUDT13-208	ENST00000617744	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
NUDT13-208	ENST00000617744	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUDT13-208	ENST00000617744	NOS1	P29475	1434 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUDT13-208	ENST00000617744	SYNM	O15061	1565 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUDT13-208	ENST00000617744	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NUDT13-208	ENST00000617744	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUDT13-208	ENST00000617744	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUDT13-208	ENST00000617744	TET3	O43151	1660 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUDT13-208	ENST00000617744	PIP4K2B	P78356	416 aa		11.88	□□□□□ -0.51
NUDT13-208	ENST00000617744	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
NUDT13-208	ENST00000617744	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
NUDT13-208	ENST00000617744	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
NUDT13-208	ENST00000617744	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		11.88	□□□□□ -0.51
NUDT13-208	ENST00000617744		E9PCH4	1651 aa		11.87	□□□□□ -0.51
NUDT13-208	ENST00000617744	HFM1	A2PYH4	1435 aa		11.87	□□□□□ -0.51
NUDT13-208	ENST00000617744	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		11.87	□□□□□ -0.51
NUDT13-208	ENST00000617744	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
NUDT13-208	ENST00000617744	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
NUDT13-208	ENST00000617744	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		11.86	□□□□□ -0.51
NUDT13-208	ENST00000617744	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		11.86	□□□□□ -0.51
NUDT13-208	ENST00000617744	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		11.86	□□□□□ -0.51
NUDT13-208	ENST00000617744	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		11.85	□□□□□ -0.51
NUDT13-208	ENST00000617744	ADGRB3	O60242	1522 aa		11.84	□□□□□ -0.51
NUDT13-208	ENST00000617744	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		11.84	□□□□□ -0.51

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