RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, human

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAPPC3-208	ENST00000616074	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
TRAPPC3-208	ENST00000616074	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
TRAPPC3-208	ENST00000616074	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.93	■■■□□ 2.86
TRAPPC3-208	ENST00000616074	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.93	■■■□□ 2.86
TRAPPC3-208	ENST00000616074	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.93	■■■□□ 2.86
TRAPPC3-208	ENST00000616074	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
TRAPPC3-208	ENST00000616074	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		32.92	■■■□□ 2.86
TRAPPC3-208	ENST00000616074	PZP	P20742	1482 aa		32.91	■■■□□ 2.86
TRAPPC3-208	ENST00000616074	PKD2	Q13563	968 aa		32.9	■■■□□ 2.86
TRAPPC3-208	ENST00000616074	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.88	■■■□□ 2.85
TRAPPC3-208	ENST00000616074	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
TRAPPC3-208	ENST00000616074	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.87	■■■□□ 2.85
TRAPPC3-208	ENST00000616074	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.87	■■■□□ 2.85
TRAPPC3-208	ENST00000616074	TNR	Q92752	1358 aa		32.86	■■■□□ 2.85
TRAPPC3-208	ENST00000616074	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.85	■■■□□ 2.85
TRAPPC3-208	ENST00000616074	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
TRAPPC3-208	ENST00000616074	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
TRAPPC3-208	ENST00000616074	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ABCC3	O15438	1527 aa		32.76	■■■□□ 2.83
TRAPPC3-208	ENST00000616074	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.75	■■■□□ 2.83
TRAPPC3-208	ENST00000616074	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.74	■■■□□ 2.83
TRAPPC3-208	ENST00000616074	NLRP1	Q9C000	1473 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TRAPPC3-208	ENST00000616074	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TRAPPC3-208	ENST00000616074	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TRAPPC3-208	ENST00000616074	CEP152	O94986	1710 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TRAPPC3-208	ENST00000616074	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TRAPPC3-208	ENST00000616074	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		32.69	■■■□□ 2.82
TRAPPC3-208	ENST00000616074	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TRAPPC3-208	ENST00000616074	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.67	■■■□□ 2.82
TRAPPC3-208	ENST00000616074	APLP2	Q06481	763 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TRAPPC3-208	ENST00000616074	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ABCC5	O15440	1437 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TRAPPC3-208	ENST00000616074	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
TRAPPC3-208	ENST00000616074	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TRAPPC3-208	ENST00000616074	DEPDC5	O75140	1603 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TRAPPC3-208	ENST00000616074	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
TRAPPC3-208	ENST00000616074	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TRAPPC3-208	ENST00000616074	DAPK1	P53355	1430 aa		32.59	■■■□□ 2.81
TRAPPC3-208	ENST00000616074	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
TRAPPC3-208	ENST00000616074	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TRAPPC3-208	ENST00000616074	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TRAPPC3-208	ENST00000616074	MED14	O60244	1454 aa		32.56	■■■□□ 2.8
TRAPPC3-208	ENST00000616074	CPS1	P31327	1500 aa		32.56	■■■□□ 2.8
TRAPPC3-208	ENST00000616074	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
TRAPPC3-208	ENST00000616074	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TRAPPC3-208	ENST00000616074	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TRAPPC3-208	ENST00000616074	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.53	■■■□□ 2.8
TRAPPC3-208	ENST00000616074	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.51	■■■□□ 2.8
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.48	■■■□□ 2.79
TRAPPC3-208	ENST00000616074	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.43	■■■□□ 2.78
TRAPPC3-208	ENST00000616074	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ILDR2	Q71H61	639 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TRAPPC3-208	ENST00000616074	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TRAPPC3-208	ENST00000616074	KANK1	Q14678	1352 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TRAPPC3-208	ENST00000616074	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.37	■■■□□ 2.77
TRAPPC3-208	ENST00000616074	SLIT1	O75093	1534 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TRAPPC3-208	ENST00000616074	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TRAPPC3-208	ENST00000616074	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TRAPPC3-208	ENST00000616074	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
TRAPPC3-208	ENST00000616074	TOM1	O60784	492 aa		32.34	■■■□□ 2.77
TRAPPC3-208	ENST00000616074	PIP4K2B	P78356	416 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TRAPPC3-208	ENST00000616074	SYNM	O15061	1565 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TRAPPC3-208	ENST00000616074	LTK	P29376	864 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TRAPPC3-208	ENST00000616074	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TRAPPC3-208	ENST00000616074	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TRAPPC3-208	ENST00000616074	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
TRAPPC3-208	ENST00000616074	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TRAPPC3-208	ENST00000616074	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
TRAPPC3-208	ENST00000616074	HSPA1L	P34931	641 aa		32.26	■■■□□ 2.75
TRAPPC3-208	ENST00000616074	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TRAPPC3-208	ENST00000616074	NOS1	P29475	1434 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TRAPPC3-208	ENST00000616074	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TRAPPC3-208	ENST00000616074	IDI1	Q13907	227 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TRAPPC3-208	ENST00000616074	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TRAPPC3-208	ENST00000616074	SOCS7	O14512	581 aa		32.18	■■■□□ 2.74
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TRAPPC3-208	ENST00000616074	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
TRAPPC3-208	ENST00000616074	TET3	O43151	1660 aa		32.12	■■■□□ 2.73
TRAPPC3-208	ENST00000616074	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
TRAPPC3-208	ENST00000616074	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
TRAPPC3-208	ENST00000616074	UNC13B	O14795	1591 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TRAPPC3-208	ENST00000616074	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.08	■■■□□ 2.73
TRAPPC3-208	ENST00000616074	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TRAPPC3-208	ENST00000616074	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.06	■■■□□ 2.72
TRAPPC3-208	ENST00000616074	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.01	■■■□□ 2.71
TRAPPC3-208	ENST00000616074	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.71
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.01	■■■□□ 2.71
TRAPPC3-208	ENST00000616074		E9PCH4	1651 aa		31.99	■■■□□ 2.71
TRAPPC3-208	ENST00000616074	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		31.98	■■■□□ 2.71
TRAPPC3-208	ENST00000616074	KCNA6	P17658	529 aa		31.97	■■■□□ 2.71

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