RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612370.4

COPZ2-209, Transcript of coatomer protein complex subunit zeta 2, human

TSL 3

Gene COPZ2, Length 528 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPZ2-209	ENST00000612370	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		42.44	■■■■■ 4.39
COPZ2-209	ENST00000612370	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		42.43	■■■■■ 4.38
COPZ2-209	ENST00000612370	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	42.43	■■■■■ 4.38
COPZ2-209	ENST00000612370	ABCC5	O15440	1437 aa		42.43	■■■■■ 4.38
COPZ2-209	ENST00000612370	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.43	■■■■■ 4.38
COPZ2-209	ENST00000612370	FBXO41	Q8TF61	875 aa		42.42	■■■■■ 4.38
COPZ2-209	ENST00000612370	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	42.41	■■■■■ 4.38
COPZ2-209	ENST00000612370	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	42.41	■■■■■ 4.38
COPZ2-209	ENST00000612370	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		42.4	■■■■■ 4.38
COPZ2-209	ENST00000612370	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	42.38	■■■■■ 4.38
COPZ2-209	ENST00000612370	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		42.38	■■■■■ 4.38
COPZ2-209	ENST00000612370	DAPK1	P53355	1430 aa		42.38	■■■■■ 4.38
COPZ2-209	ENST00000612370	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.38	■■■■■ 4.38
COPZ2-209	ENST00000612370	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	42.38	■■■■■ 4.37
COPZ2-209	ENST00000612370	PZP	P20742	1482 aa		42.36	■■■■■ 4.37
COPZ2-209	ENST00000612370	PTPRT	O14522	1441 aa		42.35	■■■■■ 4.37
COPZ2-209	ENST00000612370	KIF15	Q9NS87	1388 aa		42.34	■■■■■ 4.37
COPZ2-209	ENST00000612370	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	42.31	■■■■■ 4.36
COPZ2-209	ENST00000612370	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		42.31	■■■■■ 4.36
COPZ2-209	ENST00000612370	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	42.31	■■■■■ 4.36
COPZ2-209	ENST00000612370	TNR	Q92752	1358 aa		42.3	■■■■■ 4.36
COPZ2-209	ENST00000612370	CERK	Q8TCT0	537 aa		42.28	■■■■■ 4.36
COPZ2-209	ENST00000612370	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		42.28	■■■■■ 4.36
COPZ2-209	ENST00000612370	ABCC3	O15438	1527 aa		42.26	■■■■■ 4.36
COPZ2-209	ENST00000612370	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		42.26	■■■■■ 4.36
COPZ2-209	ENST00000612370	PLA2R1	Q13018	1463 aa		42.23	■■■■■ 4.35
COPZ2-209	ENST00000612370	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	42.23	■■■■■ 4.35
COPZ2-209	ENST00000612370	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		42.23	■■■■■ 4.35
COPZ2-209	ENST00000612370	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		42.23	■■■■■ 4.35
COPZ2-209	ENST00000612370	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		42.23	■■■■■ 4.35
COPZ2-209	ENST00000612370	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		42.2	■■■■■ 4.35
COPZ2-209	ENST00000612370	PKD2	Q13563	968 aa		42.19	■■■■■ 4.34
COPZ2-209	ENST00000612370	CEP152	O94986	1710 aa		42.17	■■■■■ 4.34
COPZ2-209	ENST00000612370	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	42.13	■■■■■ 4.33
COPZ2-209	ENST00000612370	NLRP1	Q9C000	1473 aa		42.12	■■■■■ 4.33
COPZ2-209	ENST00000612370	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	42.09	■■■■■ 4.33
COPZ2-209	ENST00000612370	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		42.07	■■■■■ 4.33
COPZ2-209	ENST00000612370	ADGRL2	O95490	1459 aa		42.07	■■■■■ 4.33
COPZ2-209	ENST00000612370	KANK1	Q14678	1352 aa		42.07	■■■■■ 4.33
COPZ2-209	ENST00000612370	DEPDC5	O75140	1603 aa		42.06	■■■■■ 4.32
COPZ2-209	ENST00000612370	ERVK-7	P63135	1459 aa		42.05	■■■■■ 4.32
COPZ2-209	ENST00000612370	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	42.04	■■■■■ 4.32
COPZ2-209	ENST00000612370	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		42.03	■■■■■ 4.32
COPZ2-209	ENST00000612370	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	42.03	■■■■■ 4.32
COPZ2-209	ENST00000612370	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	42	■■■■■ 4.31
COPZ2-209	ENST00000612370	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		41.98	■■■■■ 4.31
COPZ2-209	ENST00000612370	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		41.97	■■■■■ 4.31
COPZ2-209	ENST00000612370	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	41.96	■■■■■ 4.31	1e-6	■■■■■ 32.9
COPZ2-209	ENST00000612370	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		41.94	■■■■■ 4.3
COPZ2-209	ENST00000612370	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	41.94	■■■■■ 4.3
COPZ2-209	ENST00000612370	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	41.9	■■■■■ 4.3
COPZ2-209	ENST00000612370	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		41.89	■■■■■ 4.3
COPZ2-209	ENST00000612370	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		41.88	■■■■■ 4.29
COPZ2-209	ENST00000612370	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		41.88	■■■■■ 4.29
COPZ2-209	ENST00000612370	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		41.87	■■■■■ 4.29
COPZ2-209	ENST00000612370	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		41.84	■■■■■ 4.29
COPZ2-209	ENST00000612370	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		41.8	■■■■■ 4.28
COPZ2-209	ENST00000612370	ROCK1	Q13464	1354 aa		41.78	■■■■■ 4.28
COPZ2-209	ENST00000612370	ITGAE	P38570	1179 aa		41.76	■■■■■ 4.28
COPZ2-209	ENST00000612370	MED14	O60244	1454 aa		41.76	■■■■■ 4.28
COPZ2-209	ENST00000612370	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	41.76	■■■■■ 4.28
COPZ2-209	ENST00000612370	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		41.75	■■■■■ 4.27
COPZ2-209	ENST00000612370	IQGAP1	P46940	1657 aa		41.7	■■■■■ 4.27
COPZ2-209	ENST00000612370	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		41.69	■■■■■ 4.26
COPZ2-209	ENST00000612370	PIK3C2B	O00750	1634 aa		41.69	■■■■■ 4.26
COPZ2-209	ENST00000612370	UNC13B	O14795	1591 aa		41.66	■■■■■ 4.26
COPZ2-209	ENST00000612370	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	41.63	■■■■■ 4.25
COPZ2-209	ENST00000612370	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	41.63	■■■■■ 4.25
COPZ2-209	ENST00000612370	TET3	O43151	1660 aa		41.63	■■■■■ 4.25
COPZ2-209	ENST00000612370	SYNM	O15061	1565 aa		41.63	■■■■■ 4.25
COPZ2-209	ENST00000612370	NOS1	P29475	1434 aa		41.62	■■■■■ 4.25
COPZ2-209	ENST00000612370	SLIT1	O75093	1534 aa		41.62	■■■■■ 4.25
COPZ2-209	ENST00000612370	CPS1	P31327	1500 aa		41.62	■■■■■ 4.25
COPZ2-209	ENST00000612370	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		41.6	■■■■■ 4.25
COPZ2-209	ENST00000612370	IDI1	Q13907	227 aa		41.6	■■■■■ 4.25
COPZ2-209	ENST00000612370	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		41.6	■■■■■ 4.25
COPZ2-209	ENST00000612370	EID1	Q9Y6B2	187 aa		41.6	■■■■■ 4.25
COPZ2-209	ENST00000612370	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	41.59	■■■■■ 4.25
COPZ2-209	ENST00000612370	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		41.58	■■■■■ 4.25
COPZ2-209	ENST00000612370	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	41.55	■■■■■ 4.24
COPZ2-209	ENST00000612370	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		41.55	■■■■■ 4.24
COPZ2-209	ENST00000612370	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		41.54	■■■■■ 4.24
COPZ2-209	ENST00000612370	LTK	P29376	864 aa		41.54	■■■■■ 4.24
COPZ2-209	ENST00000612370	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		41.53	■■■■■ 4.24
COPZ2-209	ENST00000612370	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		41.5	■■■■■ 4.23
COPZ2-209	ENST00000612370	ADGRB3	O60242	1522 aa		41.49	■■■■■ 4.23
COPZ2-209	ENST00000612370	NUP155	O75694	1391 aa		41.48	■■■■■ 4.23
COPZ2-209	ENST00000612370		E9PCH4	1651 aa		41.43	■■■■■ 4.22
COPZ2-209	ENST00000612370	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		41.37	■■■■■ 4.21
COPZ2-209	ENST00000612370	TOM1	O60784	492 aa		41.34	■■■■■ 4.21
COPZ2-209	ENST00000612370	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		41.31	■■■■■ 4.2
COPZ2-209	ENST00000612370	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		41.29	■■■■■ 4.2
COPZ2-209	ENST00000612370	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		41.29	■■■■■ 4.2
COPZ2-209	ENST00000612370	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	41.28	■■■■■ 4.2
COPZ2-209	ENST00000612370	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	41.28	■■■■■ 4.2
COPZ2-209	ENST00000612370	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	41.27	■■■■■ 4.2
COPZ2-209	ENST00000612370	BCAN	Q96GW7	911 aa		41.26	■■■■■ 4.2
COPZ2-209	ENST00000612370	NAIP	Q13075	1403 aa		41.26	■■■■■ 4.19
COPZ2-209	ENST00000612370	PIP4K2B	P78356	416 aa		41.24	■■■■■ 4.19
COPZ2-209	ENST00000612370	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		41.22	■■■■■ 4.19

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