RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609445.5

SGMS1-209, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 594 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-209ENST00000609445 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.23■■□□□ 1.63
SGMS1-209ENST00000609445 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.23■■□□□ 1.63
SGMS1-209ENST00000609445 MIA2Q96PC5 1412 aa25.22■■□□□ 1.63
SGMS1-209ENST00000609445 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SGMS1-209ENST00000609445 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.19■■□□□ 1.62
SGMS1-209ENST00000609445 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.19■■□□□ 1.62
SGMS1-209ENST00000609445 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.18■■□□□ 1.62
SGMS1-209ENST00000609445 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.17■■□□□ 1.62
SGMS1-209ENST00000609445 PZPP20742 1482 aa25.17■■□□□ 1.62
SGMS1-209ENST00000609445 PLA2R1Q13018 1463 aa25.17■■□□□ 1.62
SGMS1-209ENST00000609445 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SGMS1-209ENST00000609445 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SGMS1-209ENST00000609445 APLP2Q06481 763 aa25.16■■□□□ 1.62
SGMS1-209ENST00000609445 TNRQ92752 1358 aa25.16■■□□□ 1.62
SGMS1-209ENST00000609445 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SGMS1-209ENST00000609445 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.13■■□□□ 1.61
SGMS1-209ENST00000609445 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SGMS1-209ENST00000609445 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.12■■□□□ 1.61
SGMS1-209ENST00000609445 PKD2Q13563 968 aa25.11■■□□□ 1.61
SGMS1-209ENST00000609445 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.1■■□□□ 1.61
SGMS1-209ENST00000609445 ABCC3O15438 1527 aa25.1■■□□□ 1.61
SGMS1-209ENST00000609445 ABCC5O15440 1437 aa25.09■■□□□ 1.61
SGMS1-209ENST00000609445 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SGMS1-209ENST00000609445 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SGMS1-209ENST00000609445 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.07■■□□□ 1.6
SGMS1-209ENST00000609445 CEP152O94986 1710 aa25.07■■□□□ 1.6
SGMS1-209ENST00000609445 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.06■■□□□ 1.6
SGMS1-209ENST00000609445 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SGMS1-209ENST00000609445 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.05■■□□□ 1.6
SGMS1-209ENST00000609445 KIF15Q9NS87 1388 aa25.05■■□□□ 1.6
SGMS1-209ENST00000609445 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SGMS1-209ENST00000609445 DAPK1P53355 1430 aa25.03■■□□□ 1.6
SGMS1-209ENST00000609445 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.02■■□□□ 1.6
SGMS1-209ENST00000609445 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.02■■□□□ 1.6
SGMS1-209ENST00000609445 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.02■■□□□ 1.6
SGMS1-209ENST00000609445 NLRP1Q9C000 1473 aa25.02■■□□□ 1.6
SGMS1-209ENST00000609445 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.591e-7■□□□□ 9.5
SGMS1-209ENST00000609445 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.01■■□□□ 1.59
SGMS1-209ENST00000609445 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25■■□□□ 1.59
SGMS1-209ENST00000609445 ERVK-7P63135 1459 aa24.99■■□□□ 1.59
SGMS1-209ENST00000609445 ERBINQ96RT1 1412 aa24.97■■□□□ 1.59
SGMS1-209ENST00000609445 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.97■■□□□ 1.59
SGMS1-209ENST00000609445 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
SGMS1-209ENST00000609445 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
SGMS1-209ENST00000609445 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.94■■□□□ 1.58
SGMS1-209ENST00000609445 DEPDC5O75140 1603 aa24.93■■□□□ 1.58
SGMS1-209ENST00000609445 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.582e-6■■■□□ 15
SGMS1-209ENST00000609445 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-209ENST00000609445 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.88■■□□□ 1.57
SGMS1-209ENST00000609445 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SGMS1-209ENST00000609445 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.87■■□□□ 1.57
SGMS1-209ENST00000609445 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.87■■□□□ 1.57
SGMS1-209ENST00000609445 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SGMS1-209ENST00000609445 MED14O60244 1454 aa24.87■■□□□ 1.57
SGMS1-209ENST00000609445 IQGAP1P46940 1657 aa24.86■■□□□ 1.57
SGMS1-209ENST00000609445 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.85■■□□□ 1.57
SGMS1-209ENST00000609445 KANK1Q14678 1352 aa24.84■■□□□ 1.57
SGMS1-209ENST00000609445 ADGRL2O95490 1459 aa24.83■■□□□ 1.57
SGMS1-209ENST00000609445 CPS1P31327 1500 aa24.82■■□□□ 1.56
SGMS1-209ENST00000609445 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.8■■□□□ 1.56
SGMS1-209ENST00000609445 PIK3C2BO00750 1634 aa24.79■■□□□ 1.56
SGMS1-209ENST00000609445 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.77■■□□□ 1.56
SGMS1-209ENST00000609445 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.76■■□□□ 1.55
SGMS1-209ENST00000609445 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SGMS1-209ENST00000609445 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.76■■□□□ 1.55
SGMS1-209ENST00000609445 SLIT1O75093 1534 aa24.75■■□□□ 1.55
SGMS1-209ENST00000609445 LTKP29376 864 aa24.74■■□□□ 1.55
SGMS1-209ENST00000609445 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.74■■□□□ 1.55
SGMS1-209ENST00000609445 SYNMO15061 1565 aa24.74■■□□□ 1.55
SGMS1-209ENST00000609445 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.73■■□□□ 1.55
SGMS1-209ENST00000609445 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.72■■□□□ 1.55
SGMS1-209ENST00000609445 IDI1Q13907 227 aa24.7■■□□□ 1.54
SGMS1-209ENST00000609445 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
SGMS1-209ENST00000609445 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SGMS1-209ENST00000609445 PIP4K2BP78356 416 aa24.69■■□□□ 1.54
SGMS1-209ENST00000609445 NOS1P29475 1434 aa24.69■■□□□ 1.54
SGMS1-209ENST00000609445 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.68■■□□□ 1.54
SGMS1-209ENST00000609445 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.67■■□□□ 1.54
SGMS1-209ENST00000609445 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SGMS1-209ENST00000609445 TOM1O60784 492 aa24.67■■□□□ 1.54
SGMS1-209ENST00000609445 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.66■■□□□ 1.54
SGMS1-209ENST00000609445 EID1Q9Y6B2 187 aa24.66■■□□□ 1.54
SGMS1-209ENST00000609445 ALKQ9UM73 1620 aa24.65■■□□□ 1.54
SGMS1-209ENST00000609445 ILDR2Q71H61 639 aa24.64■■□□□ 1.54
SGMS1-209ENST00000609445 TET3O43151 1660 aa24.64■■□□□ 1.53
SGMS1-209ENST00000609445 UNC13BO14795 1591 aa24.63■■□□□ 1.53
SGMS1-209ENST00000609445 ADGRB3O60242 1522 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-209ENST00000609445 HSPA1LP34931 641 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-209ENST00000609445 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.61■■□□□ 1.53
SGMS1-209ENST00000609445 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SGMS1-209ENST00000609445 ITGAEP38570 1179 aa24.6■■□□□ 1.53
SGMS1-209ENST00000609445 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.59■■□□□ 1.53
SGMS1-209ENST00000609445 ROCK1Q13464 1354 aa24.59■■□□□ 1.53
SGMS1-209ENST00000609445 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SGMS1-209ENST00000609445 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.57■■□□□ 1.52
SGMS1-209ENST00000609445 E9PCH4 1651 aa24.56■■□□□ 1.52
SGMS1-209ENST00000609445 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.53■■□□□ 1.52
SGMS1-209ENST00000609445 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.53■■□□□ 1.52
SGMS1-209ENST00000609445 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
SGMS1-209ENST00000609445 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.5■■□□□ 1.51
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