RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608473.5

GTF3C2-AS1-211, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTF3C2-AS1, Length 554 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TSPY10P0CW01 314 aa13.66□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NCOA1Q15788 1441 aa13.64□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 STRCQ7RTU9 1775 aa13.64□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KIF3BO15066 747 aa13.64□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PKD2Q13563 968 aa13.64□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa13.64□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.64□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MROH2AA6NES4 1674 aa13.63□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TIAM1Q13009 1591 aa13.62□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CAPN15O75808 1086 aa13.62□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa13.61□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa13.61□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NCOA2Q15596 1464 aa13.61□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MBD5Q9P267 1494 aa13.61□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PLXNC1O60486 1568 aa13.6□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PTPRKQ15262 1439 aa13.6□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CCDC141Q6ZP82 1450 aa13.6□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ADGBQ8N7X0 1667 aa13.59□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DISP3Q9P2K9 1392 aa13.58□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa13.57□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa13.57□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PLA2R1Q13018 1463 aa13.56□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 UBAP1LF5GYI3 381 aa13.56□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TNRQ92752 1358 aa13.56□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IQSEC2Q5JU85 1478 aa13.55□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 VPS8Q8N3P4 1428 aa13.55□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 A2ML1A8K2U0 1454 aa13.54□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LTBP4Q8N2S1 1624 aa13.53□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MYO3AQ8NEV4 1616 aa13.53□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ANKLE2Q86XL3 938 aa13.53□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa13.52□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KDM5DQ9BY66 1539 aa13.52□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FAM135AQ9P2D6 1515 aa13.51□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PZPP20742 1482 aa13.5□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ARHGEF5Q12774 1597 aa13.49□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MIA2Q96PC5 1412 aa13.49□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP13.47□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TOM1O60784 492 aa13.47□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NLRP1Q9C000 1473 aa13.47□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MYOM3Q5VTT5 1437 aa13.47□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MAP3K1Q13233 1512 aa13.45□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PIP4K2BP78356 416 aa13.45□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa13.43□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 UGGT1Q9NYU2 1555 aa13.43□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SOCS7O14512 581 aa13.42□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ILDR2Q71H61 639 aa13.42□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CPS1P31327 1500 aa13.42□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SHANK2Q9UPX8 1470 aa13.42□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MAST1Q9Y2H9 1570 aa13.41□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 STAG3Q9UJ98 1225 aa13.41□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KANK1Q14678 1352 aa13.41□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa13.41□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DUOX2Q9NRD8 1548 aa13.4□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KIF15Q9NS87 1388 aa13.4□□□□□ -0.26
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ABCC3O15438 1527 aa13.39□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ABCB7O75027 752 aa13.39□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 POLA2Q14181 598 aa13.39□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 EID1Q9Y6B2 187 aa13.39□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ERVK-7P63135 1459 aa13.37□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TXNDC2Q86VQ3 553 aa13.37□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CHIC2Q9UKJ5 165 aa13.37□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MED14O60244 1454 aa13.36□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa13.36□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HSPA1LP34931 641 aa13.36□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ERBINQ96RT1 1412 aa13.36□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NEURL4Q96JN8 1562 aa13.36□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ABCC5O15440 1437 aa13.35□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DEPDC5O75140 1603 aa13.34□□□□□ -0.27
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DAPK1P53355 1430 aa13.33□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FGD6Q6ZV73 1430 aa13.33□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PTPN23Q9H3S7 1636 aa13.32□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa13.32□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 BCANQ96GW7 911 aa13.31□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 VWDEQ8N2E2 1590 aa13.31□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IQGAP1P46940 1657 aa13.31□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LTKP29376 864 aa13.3□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MROH1Q8NDA8 1641 aa13.3□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CEP152O94986 1710 aa13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms