RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KDM5CP41229 1560 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLA2R1Q13018 1463 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OSCARQ8IYS5 282 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATP10AO60312 1499 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.72■■□□□ 1.71
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FANCAO15360 1455 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AFAP1Q8N556 730 aa25.7■■□□□ 1.71
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ASXL2Q76L83 1435 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.65■■□□□ 1.7
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RGL3Q3MIN7 710 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADGRL1O94910 1474 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A2MP01023 1474 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.62■■□□□ 1.69
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATP7AQ04656 1500 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXC-AS2-202ENST00000604081 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXC-AS2-202ENST00000604081 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MRS2Q9HD23 443 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KANK1Q14678 1352 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DEPDC5O75140 1603 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC184Q52MB2 194 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NEFLP07196 543 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LAMC1P11047 1609 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXC-AS2-202ENST00000604081 E9PCH4 1651 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRPM2O94759 1503 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PTPRTO14522 1441 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXC-AS2-202ENST00000604081 STAC3Q96MF2 364 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FKBP8Q14318 412 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIF3BO15066 747 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TET3O43151 1660 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXC-AS2-202ENST00000604081 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.45■■□□□ 1.67
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CD109Q6YHK3 1445 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.43■■□□□ 1.66
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 CEP152O94986 1710 aa25.39■■□□□ 1.65
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 CLTCL1P53675 1640 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TESK2Q96S53 571 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMF1P82094 1093 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMC1Q8TDI8 760 aa25.32■■□□□ 1.64
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 BCANQ96GW7 911 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NEO1Q92859 1461 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
HOXC-AS2-202ENST00000604081 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.26■■□□□ 1.63
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IQGAP1P46940 1657 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CDCA8Q53HL2 280 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYOM2P54296 1465 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NLRP13Q86W25 1043 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PANK3Q9H999 370 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIF1BO60333 1816 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC24A1O60721 1099 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GGT6Q6P531 493 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ABCA6Q8N139 1617 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
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