RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602285.1

NSD1-215, Transcript of nuclear receptor binding SET domain protein 1, human

TSL 1 (best)

Gene NSD1, Length 1,414 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSD1-215	ENST00000602285	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.15	■■■□□ 2.9
NSD1-215	ENST00000602285	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.13	■■■□□ 2.89
NSD1-215	ENST00000602285	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.13	■■■□□ 2.89
NSD1-215	ENST00000602285	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.09	■■■□□ 2.89
NSD1-215	ENST00000602285	KANK1	Q14678	1352 aa		33.09	■■■□□ 2.89
NSD1-215	ENST00000602285	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		33.07	■■■□□ 2.88
NSD1-215	ENST00000602285	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		33.06	■■■□□ 2.88
NSD1-215	ENST00000602285	PKD2	Q13563	968 aa		33.06	■■■□□ 2.88
NSD1-215	ENST00000602285	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	33.05	■■■□□ 2.88
NSD1-215	ENST00000602285	NEUROD1	Q13562	356 aa		33.04	■■■□□ 2.88
NSD1-215	ENST00000602285	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		33.04	■■■□□ 2.88
NSD1-215	ENST00000602285	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
NSD1-215	ENST00000602285	KIF3B	O15066	747 aa		33.03	■■■□□ 2.88
NSD1-215	ENST00000602285	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
NSD1-215	ENST00000602285	TONSL	Q96HA7	1378 aa		33.01	■■■□□ 2.88
NSD1-215	ENST00000602285	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
NSD1-215	ENST00000602285	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.98	■■■□□ 2.87
NSD1-215	ENST00000602285	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.98	■■■□□ 2.87
NSD1-215	ENST00000602285	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		32.97	■■■□□ 2.87
NSD1-215	ENST00000602285	ATP10A	O60312	1499 aa		32.96	■■■□□ 2.87
NSD1-215	ENST00000602285	FOXD1	Q16676	465 aa		32.96	■■■□□ 2.87
NSD1-215	ENST00000602285	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
NSD1-215	ENST00000602285	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.94	■■■□□ 2.86
NSD1-215	ENST00000602285	TET3	O43151	1660 aa		32.93	■■■□□ 2.86
NSD1-215	ENST00000602285	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		32.91	■■■□□ 2.86
NSD1-215	ENST00000602285	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
NSD1-215	ENST00000602285	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.89	■■■□□ 2.86
NSD1-215	ENST00000602285	AGL	P35573	1532 aa		32.85	■■■□□ 2.85
NSD1-215	ENST00000602285		E9PCH4	1651 aa		32.81	■■■□□ 2.84
NSD1-215	ENST00000602285	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
NSD1-215	ENST00000602285	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.79	■■■□□ 2.84
NSD1-215	ENST00000602285	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		32.79	■■■□□ 2.84
NSD1-215	ENST00000602285	GGT6	Q6P531	493 aa		32.78	■■■□□ 2.84
NSD1-215	ENST00000602285	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
NSD1-215	ENST00000602285	CEP152	O94986	1710 aa		32.76	■■■□□ 2.83
NSD1-215	ENST00000602285	ABCC3	O15438	1527 aa		32.74	■■■□□ 2.83
NSD1-215	ENST00000602285	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.74	■■■□□ 2.83
NSD1-215	ENST00000602285	TRPM2	O94759	1503 aa		32.73	■■■□□ 2.83
NSD1-215	ENST00000602285	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.73	■■■□□ 2.83
NSD1-215	ENST00000602285	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		32.72	■■■□□ 2.83
NSD1-215	ENST00000602285	PTPRT	O14522	1441 aa		32.71	■■■□□ 2.83
NSD1-215	ENST00000602285	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.7	■■■□□ 2.83
NSD1-215	ENST00000602285	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.67	■■■□□ 2.82
NSD1-215	ENST00000602285	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.66	■■■□□ 2.82
NSD1-215	ENST00000602285	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.64	■■■□□ 2.82
NSD1-215	ENST00000602285	NPAT	Q14207	1427 aa		32.59	■■■□□ 2.81
NSD1-215	ENST00000602285	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.58	■■■□□ 2.81
NSD1-215	ENST00000602285	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
NSD1-215	ENST00000602285	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.55	■■■□□ 2.8
NSD1-215	ENST00000602285	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.54	■■■□□ 2.8
NSD1-215	ENST00000602285	CLTCL1	P53675	1640 aa		32.53	■■■□□ 2.8
NSD1-215	ENST00000602285	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
NSD1-215	ENST00000602285	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
NSD1-215	ENST00000602285	NOS1	P29475	1434 aa		32.48	■■■□□ 2.79
NSD1-215	ENST00000602285	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.47	■■■□□ 2.79
NSD1-215	ENST00000602285	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.47	■■■□□ 2.79
NSD1-215	ENST00000602285	STAC3	Q96MF2	364 aa		32.46	■■■□□ 2.79
NSD1-215	ENST00000602285	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
NSD1-215	ENST00000602285	KIF1B	O60333	1816 aa		32.44	■■■□□ 2.78
NSD1-215	ENST00000602285	MLEC	Q14165	292 aa		32.42	■■■□□ 2.78
NSD1-215	ENST00000602285	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		32.41	■■■□□ 2.78
NSD1-215	ENST00000602285	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.41	■■■□□ 2.78
NSD1-215	ENST00000602285	RGL3	Q3MIN7	710 aa		32.39	■■■□□ 2.78
NSD1-215	ENST00000602285	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.36	■■■□□ 2.77
NSD1-215	ENST00000602285	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.36	■■■□□ 2.77
NSD1-215	ENST00000602285	SYNM	O15061	1565 aa		32.36	■■■□□ 2.77
NSD1-215	ENST00000602285	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		32.36	■■■□□ 2.77
NSD1-215	ENST00000602285	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.35	■■■□□ 2.77
NSD1-215	ENST00000602285	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.35	■■■□□ 2.77
NSD1-215	ENST00000602285	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		32.34	■■■□□ 2.77
NSD1-215	ENST00000602285	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.34	■■■□□ 2.77
NSD1-215	ENST00000602285	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		32.33	■■■□□ 2.77
NSD1-215	ENST00000602285	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		32.32	■■■□□ 2.76
NSD1-215	ENST00000602285	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.31	■■■□□ 2.76
NSD1-215	ENST00000602285	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		32.31	■■■□□ 2.76
NSD1-215	ENST00000602285	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
NSD1-215	ENST00000602285	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
NSD1-215	ENST00000602285	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.27	■■■□□ 2.76
NSD1-215	ENST00000602285	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		32.25	■■■□□ 2.75
NSD1-215	ENST00000602285	MYOM2	P54296	1465 aa		32.25	■■■□□ 2.75
NSD1-215	ENST00000602285	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	32.25	■■■□□ 2.75
NSD1-215	ENST00000602285	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
NSD1-215	ENST00000602285	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		32.22	■■■□□ 2.75
NSD1-215	ENST00000602285	IFT172	Q9UG01	1749 aa		32.21	■■■□□ 2.75
NSD1-215	ENST00000602285	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.21	■■■□□ 2.75
NSD1-215	ENST00000602285	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.2	■■■□□ 2.75
NSD1-215	ENST00000602285	IDI1	Q13907	227 aa		32.17	■■■□□ 2.74
NSD1-215	ENST00000602285	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
NSD1-215	ENST00000602285	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
NSD1-215	ENST00000602285	LAMC1	P11047	1609 aa		32.16	■■■□□ 2.74
NSD1-215	ENST00000602285	PPL	O60437	1756 aa		32.13	■■■□□ 2.73
NSD1-215	ENST00000602285	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		32.13	■■■□□ 2.73
NSD1-215	ENST00000602285	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.12	■■■□□ 2.73
NSD1-215	ENST00000602285	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		32.12	■■■□□ 2.73
NSD1-215	ENST00000602285	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
NSD1-215	ENST00000602285	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		32.12	■■■□□ 2.73
NSD1-215	ENST00000602285	TNR	Q92752	1358 aa		32.12	■■■□□ 2.73
NSD1-215	ENST00000602285	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		32.1	■■■□□ 2.73
NSD1-215	ENST00000602285	USP47	Q96K76	1375 aa		32.09	■■■□□ 2.73
NSD1-215	ENST00000602285	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73

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