RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600058.5

FCHO1-230, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 2

Gene FCHO1, Length 910 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-230ENST00000600058 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.31■■□□□ 1.96
FCHO1-230ENST00000600058 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.3■■□□□ 1.96
FCHO1-230ENST00000600058 TNRQ92752 1358 aa27.29■■□□□ 1.96
FCHO1-230ENST00000600058 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.28■■□□□ 1.96
FCHO1-230ENST00000600058 PZPP20742 1482 aa27.28■■□□□ 1.96
FCHO1-230ENST00000600058 CPS1P31327 1500 aa27.27■■□□□ 1.96
FCHO1-230ENST00000600058 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.26■■□□□ 1.95
FCHO1-230ENST00000600058 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
FCHO1-230ENST00000600058 KIF3BO15066 747 aa27.25■■□□□ 1.95
FCHO1-230ENST00000600058 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.24■■□□□ 1.95
FCHO1-230ENST00000600058 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.22■■□□□ 1.95
FCHO1-230ENST00000600058 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.19■■□□□ 1.94
FCHO1-230ENST00000600058 TOM1O60784 492 aa27.19■■□□□ 1.94
FCHO1-230ENST00000600058 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.19■■□□□ 1.94
FCHO1-230ENST00000600058 NCOA2Q15596 1464 aa27.19■■□□□ 1.94
FCHO1-230ENST00000600058 NLRP1Q9C000 1473 aa27.19■■□□□ 1.94
FCHO1-230ENST00000600058 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
FCHO1-230ENST00000600058 HSPA1LP34931 641 aa27.18■■□□□ 1.94
FCHO1-230ENST00000600058 MIA2Q96PC5 1412 aa27.17■■□□□ 1.94
FCHO1-230ENST00000600058 PIP4K2BP78356 416 aa27.17■■□□□ 1.94
FCHO1-230ENST00000600058 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.17■■□□□ 1.94
FCHO1-230ENST00000600058 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.17■■□□□ 1.94
FCHO1-230ENST00000600058 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
FCHO1-230ENST00000600058 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.17■■□□□ 1.94
FCHO1-230ENST00000600058 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
FCHO1-230ENST00000600058 DEPDC5O75140 1603 aa27.16■■□□□ 1.94
FCHO1-230ENST00000600058 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.15■■□□□ 1.94
FCHO1-230ENST00000600058 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.15■■□□□ 1.94
FCHO1-230ENST00000600058 MED14O60244 1454 aa27.15■■□□□ 1.94
FCHO1-230ENST00000600058 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
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FCHO1-230ENST00000600058 TSPY10P0CW01 314 aa27.07■■□□□ 1.92
FCHO1-230ENST00000600058 ALKQ9UM73 1620 aa27.07■■□□□ 1.92
FCHO1-230ENST00000600058 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
FCHO1-230ENST00000600058 ABCC3O15438 1527 aa27.05■■□□□ 1.92
FCHO1-230ENST00000600058 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.03■■□□□ 1.92
FCHO1-230ENST00000600058 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.02■■□□□ 1.92
FCHO1-230ENST00000600058 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.92
FCHO1-230ENST00000600058 SYNMO15061 1565 aa26.99■■□□□ 1.91
FCHO1-230ENST00000600058 ERVK-7P63135 1459 aa26.99■■□□□ 1.91
FCHO1-230ENST00000600058 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.98■■□□□ 1.91
FCHO1-230ENST00000600058 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.97■■□□□ 1.91
FCHO1-230ENST00000600058 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.95■■□□□ 1.91
FCHO1-230ENST00000600058 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.95■■□□□ 1.9
FCHO1-230ENST00000600058 CEP152O94986 1710 aa26.94■■□□□ 1.9
FCHO1-230ENST00000600058 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
FCHO1-230ENST00000600058 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
FCHO1-230ENST00000600058 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
FCHO1-230ENST00000600058 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.87■■□□□ 1.89
FCHO1-230ENST00000600058 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.87■■□□□ 1.89
FCHO1-230ENST00000600058 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.86■■□□□ 1.89
FCHO1-230ENST00000600058 SLIT1O75093 1534 aa26.85■■□□□ 1.89
FCHO1-230ENST00000600058 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.84■■□□□ 1.89
FCHO1-230ENST00000600058 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.82■■□□□ 1.88
FCHO1-230ENST00000600058 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
FCHO1-230ENST00000600058 MAP3K1Q13233 1512 aa26.82■■□□□ 1.88
FCHO1-230ENST00000600058 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
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FCHO1-230ENST00000600058 LTKP29376 864 aa26.81■■□□□ 1.88
FCHO1-230ENST00000600058 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.79■■□□□ 1.88
FCHO1-230ENST00000600058 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
FCHO1-230ENST00000600058 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.76■■□□□ 1.87
FCHO1-230ENST00000600058 ERBINQ96RT1 1412 aa26.76■■□□□ 1.87
FCHO1-230ENST00000600058 KIF15Q9NS87 1388 aa26.76■■□□□ 1.87
FCHO1-230ENST00000600058 PIK3C2BO00750 1634 aa26.76■■□□□ 1.87
FCHO1-230ENST00000600058 EID1Q9Y6B2 187 aa26.75■■□□□ 1.87
FCHO1-230ENST00000600058 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
FCHO1-230ENST00000600058 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.71■■□□□ 1.87
FCHO1-230ENST00000600058 ABCC5O15440 1437 aa26.7■■□□□ 1.86
FCHO1-230ENST00000600058 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.68■■□□□ 1.86
FCHO1-230ENST00000600058 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
FCHO1-230ENST00000600058 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.67■■□□□ 1.86
FCHO1-230ENST00000600058 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.67■■□□□ 1.86
FCHO1-230ENST00000600058 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.66■■□□□ 1.86
FCHO1-230ENST00000600058 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.86
FCHO1-230ENST00000600058 KANK1Q14678 1352 aa26.66■■□□□ 1.86
FCHO1-230ENST00000600058 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.65■■□□□ 1.86
FCHO1-230ENST00000600058 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.64■■□□□ 1.85
FCHO1-230ENST00000600058 TMEM94Q12767 1356 aa26.63■■□□□ 1.85
FCHO1-230ENST00000600058 DAPK1P53355 1430 aa26.63■■□□□ 1.85
FCHO1-230ENST00000600058 TET3O43151 1660 aa26.61■■□□□ 1.85
FCHO1-230ENST00000600058 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.61■■□□□ 1.85
FCHO1-230ENST00000600058 KCNA6P17658 529 aa26.6■■□□□ 1.85
FCHO1-230ENST00000600058 IDI1Q13907 227 aa26.6■■□□□ 1.85
FCHO1-230ENST00000600058 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.59■■□□□ 1.85
FCHO1-230ENST00000600058 NOS1P29475 1434 aa26.56■■□□□ 1.84
FCHO1-230ENST00000600058 ADGRB3O60242 1522 aa26.55■■□□□ 1.84
FCHO1-230ENST00000600058 NWD1Q149M9 1564 aa26.55■■□□□ 1.84
FCHO1-230ENST00000600058 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
FCHO1-230ENST00000600058 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.55■■□□□ 1.84
FCHO1-230ENST00000600058 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.55■■□□□ 1.84
FCHO1-230ENST00000600058 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.55■■□□□ 1.84
FCHO1-230ENST00000600058 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
FCHO1-230ENST00000600058 POTEAQ6S8J7 498 aa26.5■■□□□ 1.83
FCHO1-230ENST00000600058 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.5■■□□□ 1.83
FCHO1-230ENST00000600058 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
FCHO1-230ENST00000600058 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.49■■□□□ 1.83
FCHO1-230ENST00000600058 APLP2Q06481 763 aa26.48■■□□□ 1.83
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