RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.07■■■■□ 3.53
CAPNS1-214ENST00000592483 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKLE2Q86XL3 938 aa37.01■■■■□ 3.52
CAPNS1-214ENST00000592483 ALKQ9UM73 1620 aa36.99■■■■□ 3.51
CAPNS1-214ENST00000592483 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.99■■■■□ 3.51
CAPNS1-214ENST00000592483 TNRQ92752 1358 aa36.99■■■■□ 3.51
CAPNS1-214ENST00000592483 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.98■■■■□ 3.51
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
CAPNS1-214ENST00000592483 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
CAPNS1-214ENST00000592483 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.91■■■■□ 3.5
CAPNS1-214ENST00000592483 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.9■■■■□ 3.5
CAPNS1-214ENST00000592483 MED14O60244 1454 aa36.89■■■■□ 3.5
CAPNS1-214ENST00000592483 MAP3K1Q13233 1512 aa36.89■■■■□ 3.5
CAPNS1-214ENST00000592483 PZPP20742 1482 aa36.88■■■■□ 3.49
CAPNS1-214ENST00000592483 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
CAPNS1-214ENST00000592483 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
CAPNS1-214ENST00000592483 DEPDC5O75140 1603 aa36.84■■■■□ 3.49
CAPNS1-214ENST00000592483 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.84■■■■□ 3.49
CAPNS1-214ENST00000592483 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
CAPNS1-214ENST00000592483 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
CAPNS1-214ENST00000592483 APLP2Q06481 763 aa36.81■■■■□ 3.48
CAPNS1-214ENST00000592483 NLRP1Q9C000 1473 aa36.81■■■■□ 3.48
CAPNS1-214ENST00000592483 MIA2Q96PC5 1412 aa36.8■■■■□ 3.48
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.8■■■■□ 3.48
CAPNS1-214ENST00000592483 TIAM1Q13009 1591 aa36.79■■■■□ 3.48
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF3BO15066 747 aa36.79■■■■□ 3.48
CAPNS1-214ENST00000592483 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.78■■■■□ 3.48
CAPNS1-214ENST00000592483 MBD5Q9P267 1494 aa36.78■■■■□ 3.48
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.78■■■■□ 3.48
CAPNS1-214ENST00000592483 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.78■■■■□ 3.48
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
CAPNS1-214ENST00000592483 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.78■■■■□ 3.48
CAPNS1-214ENST00000592483 IQGAP1P46940 1657 aa36.74■■■■□ 3.47
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
CAPNS1-214ENST00000592483 STRCP1A6NGW2 1772 aa36.71■■■■□ 3.47
CAPNS1-214ENST00000592483 SYNMO15061 1565 aa36.69■■■■□ 3.46
CAPNS1-214ENST00000592483 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.68■■■■□ 3.46
CAPNS1-214ENST00000592483 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.64■■■■□ 3.46
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.62■■■■□ 3.45
CAPNS1-214ENST00000592483 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.55■■■■□ 3.44
CAPNS1-214ENST00000592483 POTEAQ6S8J7 498 aa36.55■■■■□ 3.44
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.53■■■■□ 3.44
CAPNS1-214ENST00000592483 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
CAPNS1-214ENST00000592483 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.47■■■■□ 3.43
CAPNS1-214ENST00000592483 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
CAPNS1-214ENST00000592483 ERVK-7P63135 1459 aa36.41■■■■□ 3.42
CAPNS1-214ENST00000592483 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCC3O15438 1527 aa36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-214ENST00000592483 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.38■■■■□ 3.41
CAPNS1-214ENST00000592483 TSPY4P0CV99 314 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-214ENST00000592483 TSPY10P0CW01 314 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-214ENST00000592483 LTKP29376 864 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-214ENST00000592483 TXNDC2Q86VQ3 553 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-214ENST00000592483 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-214ENST00000592483 NCOA2Q15596 1464 aa36.36■■■■□ 3.41
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.32■■■■□ 3.41
CAPNS1-214ENST00000592483 SLIT1O75093 1534 aa36.31■■■■□ 3.4
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.29■■■■□ 3.4
CAPNS1-214ENST00000592483 EID1Q9Y6B2 187 aa36.28■■■■□ 3.4
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM94Q12767 1356 aa36.24■■■■□ 3.39
CAPNS1-214ENST00000592483 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
CAPNS1-214ENST00000592483 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa36.22■■■■□ 3.39
CAPNS1-214ENST00000592483 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
CAPNS1-214ENST00000592483 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
CAPNS1-214ENST00000592483 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-214ENST00000592483 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNA6P17658 529 aa36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-214ENST00000592483 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP152O94986 1710 aa36.14■■■■□ 3.38
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM2Q9UHN6 1383 aa36.14■■■■□ 3.38
CAPNS1-214ENST00000592483 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
CAPNS1-214ENST00000592483 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.13■■■■□ 3.37
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.11■■■■□ 3.37
CAPNS1-214ENST00000592483 JCADQ9P266 1359 aa36.09■■■■□ 3.37
CAPNS1-214ENST00000592483 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP36.08■■■■□ 3.37
CAPNS1-214ENST00000592483 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
CAPNS1-214ENST00000592483 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.05■■■■□ 3.36
CAPNS1-214ENST00000592483 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-214ENST00000592483 SLAIN2Q9P270 581 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-214ENST00000592483 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
CAPNS1-214ENST00000592483 PIK3C2BO00750 1634 aa36.03■■■■□ 3.36
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC26A8Q96RN1 970 aa36.02■■■■□ 3.36
CAPNS1-214ENST00000592483 PHLPP1O60346 1717 aa36.02■■■■□ 3.36
CAPNS1-214ENST00000592483 MSH6P52701 1360 aa36.01■■■■□ 3.35
CAPNS1-214ENST00000592483 TET3O43151 1660 aa36■■■■□ 3.35
CAPNS1-214ENST00000592483 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
CAPNS1-214ENST00000592483 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.98■■■■□ 3.35
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
CAPNS1-214ENST00000592483 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.96■■■■□ 3.35
CAPNS1-214ENST00000592483 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
CAPNS1-214ENST00000592483 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.94■■■■□ 3.34
CAPNS1-214ENST00000592483 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa35.92■■■■□ 3.34
CAPNS1-214ENST00000592483 IDI1Q13907 227 aa35.92■■■■□ 3.34
CAPNS1-214ENST00000592483 NWD1Q149M9 1564 aa35.92■■■■□ 3.34
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM52Q96A61 297 aa35.91■■■■□ 3.34
CAPNS1-214ENST00000592483 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
CAPNS1-214ENST00000592483 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
CAPNS1-214ENST00000592483 LRP6O75581 1613 aa35.86■■■■□ 3.33
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