RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 FAM135AQ9P2D6 1515 aa19.29■□□□□ 0.68
CTIF-208ENST00000590422 PZPP20742 1482 aa19.28■□□□□ 0.68
CTIF-208ENST00000590422 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
CTIF-208ENST00000590422 MAP3K1Q13233 1512 aa19.27■□□□□ 0.68
CTIF-208ENST00000590422 IQSEC2Q5JU85 1478 aa19.27■□□□□ 0.67
CTIF-208ENST00000590422 MAST1Q9Y2H9 1570 aa19.27■□□□□ 0.67
CTIF-208ENST00000590422 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
CTIF-208ENST00000590422 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
CTIF-208ENST00000590422 RSPH4AQ5TD94 716 aa19.26■□□□□ 0.67
CTIF-208ENST00000590422 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
CTIF-208ENST00000590422 TNRQ92752 1358 aa19.25■□□□□ 0.67
CTIF-208ENST00000590422 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
CTIF-208ENST00000590422 NEURL4Q96JN8 1562 aa19.24■□□□□ 0.67
CTIF-208ENST00000590422 PKD2Q13563 968 aa19.24■□□□□ 0.67
CTIF-208ENST00000590422 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.23■□□□□ 0.67
CTIF-208ENST00000590422 MROH1Q8NDA8 1641 aa19.22■□□□□ 0.67
CTIF-208ENST00000590422 ABCC3O15438 1527 aa19.21■□□□□ 0.67
CTIF-208ENST00000590422 TSPY4P0CV99 314 aa19.21■□□□□ 0.67
CTIF-208ENST00000590422 TSPY10P0CW01 314 aa19.21■□□□□ 0.67
CTIF-208ENST00000590422 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
CTIF-208ENST00000590422 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa19.21■□□□□ 0.67
CTIF-208ENST00000590422 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
CTIF-208ENST00000590422 MIA2Q96PC5 1412 aa19.19■□□□□ 0.66
CTIF-208ENST00000590422 CROCC2H7BZ55 1655 aa19.18■□□□□ 0.66
CTIF-208ENST00000590422 CEP152O94986 1710 aa19.17■□□□□ 0.66
CTIF-208ENST00000590422 NLRP1Q9C000 1473 aa19.16■□□□□ 0.66
CTIF-208ENST00000590422 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa19.15■□□□□ 0.66
CTIF-208ENST00000590422 UGGT1Q9NYU2 1555 aa19.15■□□□□ 0.66
CTIF-208ENST00000590422 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP19.14■□□□□ 0.65
CTIF-208ENST00000590422 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.14■□□□□ 0.65
CTIF-208ENST00000590422 ERVK-7P63135 1459 aa19.13■□□□□ 0.65
CTIF-208ENST00000590422 DUOX2Q9NRD8 1548 aa19.13■□□□□ 0.65
CTIF-208ENST00000590422 DISP3Q9P2K9 1392 aa19.12■□□□□ 0.65
CTIF-208ENST00000590422 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
CTIF-208ENST00000590422 DEPDC5O75140 1603 aa19.11■□□□□ 0.65
CTIF-208ENST00000590422 SHANK2Q9UPX8 1470 aa19.11■□□□□ 0.65
CTIF-208ENST00000590422 ABCC5O15440 1437 aa19.11■□□□□ 0.65
CTIF-208ENST00000590422 VWDEQ8N2E2 1590 aa19.1■□□□□ 0.65
CTIF-208ENST00000590422 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
CTIF-208ENST00000590422 KIF15Q9NS87 1388 aa19.09■□□□□ 0.65
CTIF-208ENST00000590422 UBAP1LF5GYI3 381 aa19.09■□□□□ 0.65
CTIF-208ENST00000590422 IQGAP1P46940 1657 aa19.08■□□□□ 0.65
CTIF-208ENST00000590422 MED14O60244 1454 aa19.08■□□□□ 0.64
CTIF-208ENST00000590422 CPS1P31327 1500 aa19.07■□□□□ 0.64
CTIF-208ENST00000590422 ILDR2Q71H61 639 aa19.07■□□□□ 0.64
CTIF-208ENST00000590422 UBR1Q8IWV7 1749 aa19.07■□□□□ 0.64
CTIF-208ENST00000590422 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
CTIF-208ENST00000590422 DAPK1P53355 1430 aa19.07■□□□□ 0.64
CTIF-208ENST00000590422 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.07■□□□□ 0.64
CTIF-208ENST00000590422 ANKLE2Q86XL3 938 aa19.06■□□□□ 0.64
CTIF-208ENST00000590422 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
CTIF-208ENST00000590422 ERBINQ96RT1 1412 aa19.06■□□□□ 0.64
CTIF-208ENST00000590422 STRCP1A6NGW2 1772 aa19.04■□□□□ 0.64
CTIF-208ENST00000590422 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa19.03■□□□□ 0.64
CTIF-208ENST00000590422 ALKQ9UM73 1620 aa19.01■□□□□ 0.63
CTIF-208ENST00000590422 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa19■□□□□ 0.63
CTIF-208ENST00000590422 APLP2Q06481 763 aa19■□□□□ 0.63
CTIF-208ENST00000590422 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
CTIF-208ENST00000590422 PIK3C2BO00750 1634 aa18.97■□□□□ 0.63
CTIF-208ENST00000590422 ARHGAP23Q9P227 1491 aa18.97■□□□□ 0.63
CTIF-208ENST00000590422 SLIT1O75093 1534 aa18.96■□□□□ 0.63
CTIF-208ENST00000590422 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.96■□□□□ 0.63
CTIF-208ENST00000590422 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.96■□□□□ 0.63
CTIF-208ENST00000590422 SYNMO15061 1565 aa18.95■□□□□ 0.62
CTIF-208ENST00000590422 PIP4K2BP78356 416 aa18.95■□□□□ 0.62
CTIF-208ENST00000590422 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
CTIF-208ENST00000590422 LMTK2Q8IWU2 1503 aa18.95■□□□□ 0.62
CTIF-208ENST00000590422 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.94■□□□□ 0.62
CTIF-208ENST00000590422 LRRC7Q96NW7 1537 aa18.94■□□□□ 0.62
CTIF-208ENST00000590422 HSPA1LP34931 641 aa18.93■□□□□ 0.62
CTIF-208ENST00000590422 ADGRL2O95490 1459 aa18.92■□□□□ 0.62
CTIF-208ENST00000590422 EFCAB6Q5THR3 1501 aa18.92■□□□□ 0.62
CTIF-208ENST00000590422 LTKP29376 864 aa18.92■□□□□ 0.62
CTIF-208ENST00000590422 TOM1O60784 492 aa18.91■□□□□ 0.62
CTIF-208ENST00000590422 KANK1Q14678 1352 aa18.91■□□□□ 0.62
CTIF-208ENST00000590422 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
CTIF-208ENST00000590422 SOCS7O14512 581 aa18.89■□□□□ 0.61
CTIF-208ENST00000590422 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
CTIF-208ENST00000590422 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
CTIF-208ENST00000590422 TXNDC2Q86VQ3 553 aa18.87■□□□□ 0.61
CTIF-208ENST00000590422 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.87■□□□□ 0.61
CTIF-208ENST00000590422 NOS1P29475 1434 aa18.86■□□□□ 0.61
CTIF-208ENST00000590422 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
CTIF-208ENST00000590422 ADGRB3O60242 1522 aa18.85■□□□□ 0.61
CTIF-208ENST00000590422 IDI1Q13907 227 aa18.84■□□□□ 0.61
CTIF-208ENST00000590422 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.83■□□□□ 0.61
CTIF-208ENST00000590422 TET3O43151 1660 aa18.82■□□□□ 0.6
CTIF-208ENST00000590422 MYO5BQ9ULV0 1848 aa18.81■□□□□ 0.6
CTIF-208ENST00000590422 EID1Q9Y6B2 187 aa18.81■□□□□ 0.6
CTIF-208ENST00000590422 UNC13BO14795 1591 aa18.81■□□□□ 0.6
CTIF-208ENST00000590422 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.8■□□□□ 0.6
CTIF-208ENST00000590422 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
CTIF-208ENST00000590422 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.79■□□□□ 0.6
CTIF-208ENST00000590422 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CTIF-208ENST00000590422 NWD1Q149M9 1564 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-208ENST00000590422 E9PCH4 1651 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-208ENST00000590422 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-208ENST00000590422 SLC26A8Q96RN1 970 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-208ENST00000590422 ZFYVE9O95405 1425 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-208ENST00000590422 TMEM94Q12767 1356 aa18.73■□□□□ 0.59
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