RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590381.5

PQLC1-211, Transcript of PQ loop repeat containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PQLC1, Length 1,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC1-211ENST00000590381 MYO3AQ8NEV4 1616 aa44.95■■■■■ 4.79
PQLC1-211ENST00000590381 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP44.93■■■■■ 4.78
PQLC1-211ENST00000590381 NCOA1Q15788 1441 aa44.92■■■■■ 4.78
PQLC1-211ENST00000590381 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa44.91■■■■■ 4.78
PQLC1-211ENST00000590381 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP44.9■■■■■ 4.78
PQLC1-211ENST00000590381 FAM135AQ9P2D6 1515 aa44.89■■■■■ 4.78
PQLC1-211ENST00000590381 CROCC2H7BZ55 1655 aa44.87■■■■■ 4.77
PQLC1-211ENST00000590381 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP44.86■■■■■ 4.77
PQLC1-211ENST00000590381 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP44.86■■■■■ 4.77
PQLC1-211ENST00000590381 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP44.86■■■■■ 4.77
PQLC1-211ENST00000590381 PTPRTO14522 1441 aa44.86■■■■■ 4.77
PQLC1-211ENST00000590381 DAPK1P53355 1430 aa44.86■■■■■ 4.77
PQLC1-211ENST00000590381 CERKQ8TCT0 537 aa44.86■■■■■ 4.77
PQLC1-211ENST00000590381 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa44.85■■■■■ 4.77
PQLC1-211ENST00000590381 PZPP20742 1482 aa44.85■■■■■ 4.77
PQLC1-211ENST00000590381 SHANK2Q9UPX8 1470 aa44.85■■■■■ 4.77
PQLC1-211ENST00000590381 DUOX2Q9NRD8 1548 aa44.84■■■■■ 4.77
PQLC1-211ENST00000590381 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
PQLC1-211ENST00000590381 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
PQLC1-211ENST00000590381 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa44.82■■■■■ 4.77
PQLC1-211ENST00000590381 KIF15Q9NS87 1388 aa44.82■■■■■ 4.76
PQLC1-211ENST00000590381 TNRQ92752 1358 aa44.81■■■■■ 4.76
PQLC1-211ENST00000590381 CHIC2Q9UKJ5 165 aa44.79■■■■■ 4.76
PQLC1-211ENST00000590381 A2ML1A8K2U0 1454 aa44.76■■■■■ 4.76
PQLC1-211ENST00000590381 ABCC3O15438 1527 aa44.75■■■■■ 4.76
PQLC1-211ENST00000590381 MROH1Q8NDA8 1641 aa44.75■■■■■ 4.75
PQLC1-211ENST00000590381 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP44.71■■■■■ 4.75
PQLC1-211ENST00000590381 PLA2R1Q13018 1463 aa44.7■■■■■ 4.75
PQLC1-211ENST00000590381 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
PQLC1-211ENST00000590381 CEP152O94986 1710 aa44.67■■■■■ 4.74
PQLC1-211ENST00000590381 ERBINQ96RT1 1412 aa44.67■■■■■ 4.74
PQLC1-211ENST00000590381 PKD2Q13563 968 aa44.66■■■■■ 4.74
PQLC1-211ENST00000590381 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa44.65■■■■■ 4.74
PQLC1-211ENST00000590381 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP44.61■■■■■ 4.73
PQLC1-211ENST00000590381 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP44.58■■■■■ 4.73
PQLC1-211ENST00000590381 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.57■■■■■ 4.73
PQLC1-211ENST00000590381 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP44.55■■■■■ 4.72
PQLC1-211ENST00000590381 NLRP1Q9C000 1473 aa44.55■■■■■ 4.72
PQLC1-211ENST00000590381 LTBP4Q8N2S1 1624 aa44.55■■■■■ 4.72
PQLC1-211ENST00000590381 ERVK-7P63135 1459 aa44.54■■■■■ 4.72
PQLC1-211ENST00000590381 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa44.54■■■■■ 4.72
PQLC1-211ENST00000590381 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP44.5■■■■■ 4.717e-7■■■■□ 22.8
PQLC1-211ENST00000590381 ADGRL2O95490 1459 aa44.5■■■■■ 4.71
PQLC1-211ENST00000590381 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP44.49■■■■■ 4.71
PQLC1-211ENST00000590381 DEPDC5O75140 1603 aa44.49■■■■■ 4.71
PQLC1-211ENST00000590381 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP44.49■■■■■ 4.71
PQLC1-211ENST00000590381 UGGT1Q9NYU2 1555 aa44.48■■■■■ 4.71
PQLC1-211ENST00000590381 KANK1Q14678 1352 aa44.44■■■■■ 4.71
PQLC1-211ENST00000590381 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa44.41■■■■■ 4.7
PQLC1-211ENST00000590381 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
PQLC1-211ENST00000590381 ANKLE2Q86XL3 938 aa44.41■■■■■ 4.7
PQLC1-211ENST00000590381 NEURL4Q96JN8 1562 aa44.39■■■■■ 4.7
PQLC1-211ENST00000590381 VWDEQ8N2E2 1590 aa44.34■■■■■ 4.69
PQLC1-211ENST00000590381 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa44.33■■■■■ 4.69
PQLC1-211ENST00000590381 LMTK2Q8IWU2 1503 aa44.3■■■■■ 4.68
PQLC1-211ENST00000590381 ITGAEP38570 1179 aa44.26■■■■■ 4.68
PQLC1-211ENST00000590381 UBR1Q8IWV7 1749 aa44.26■■■■■ 4.68
PQLC1-211ENST00000590381 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP44.24■■■■■ 4.67
PQLC1-211ENST00000590381 IQSEC2Q5JU85 1478 aa44.24■■■■■ 4.67
PQLC1-211ENST00000590381 MED14O60244 1454 aa44.21■■■■■ 4.67
PQLC1-211ENST00000590381 EFCAB6Q5THR3 1501 aa44.17■■■■■ 4.66
PQLC1-211ENST00000590381 ROCK1Q13464 1354 aa44.17■■■■■ 4.66
PQLC1-211ENST00000590381 PIK3C2BO00750 1634 aa44.15■■■■■ 4.66
PQLC1-211ENST00000590381 IDI1Q13907 227 aa44.13■■■■■ 4.66
PQLC1-211ENST00000590381 IQGAP1P46940 1657 aa44.13■■■■■ 4.65
PQLC1-211ENST00000590381 SYNMO15061 1565 aa44.11■■■■■ 4.65
PQLC1-211ENST00000590381 LTKP29376 864 aa44.1■■■■■ 4.65
PQLC1-211ENST00000590381 STAG3Q9UJ98 1225 aa44.1■■■■■ 4.65
PQLC1-211ENST00000590381 NOS1P29475 1434 aa44.09■■■■■ 4.65
PQLC1-211ENST00000590381 ARHGAP23Q9P227 1491 aa44.08■■■■■ 4.65
PQLC1-211ENST00000590381 TXNDC2Q86VQ3 553 aa44.08■■■■■ 4.65
PQLC1-211ENST00000590381 SLIT1O75093 1534 aa44.06■■■■■ 4.64
PQLC1-211ENST00000590381 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
PQLC1-211ENST00000590381 UNC13BO14795 1591 aa44.05■■■■■ 4.64
PQLC1-211ENST00000590381 UBAP1LF5GYI3 381 aa44.05■■■■■ 4.64
PQLC1-211ENST00000590381 TET3O43151 1660 aa44.03■■■■■ 4.64
PQLC1-211ENST00000590381 CPS1P31327 1500 aa44.03■■■■■ 4.64
PQLC1-211ENST00000590381 EID1Q9Y6B2 187 aa43.99■■■■■ 4.63
PQLC1-211ENST00000590381 TMEM2Q9UHN6 1383 aa43.99■■■■■ 4.63
PQLC1-211ENST00000590381 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP43.98■■■■■ 4.63
PQLC1-211ENST00000590381 GCC2Q8IWJ2 1684 aa43.95■■■■■ 4.63
PQLC1-211ENST00000590381 SLC52A1Q9NWF4 448 aa43.95■■■■■ 4.63
PQLC1-211ENST00000590381 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP43.95■■■■■ 4.63
PQLC1-211ENST00000590381 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP43.93■■■■■ 4.62
PQLC1-211ENST00000590381 STRCP1A6NGW2 1772 aa43.92■■■■■ 4.62
PQLC1-211ENST00000590381 NUP155O75694 1391 aa43.91■■■■■ 4.62
PQLC1-211ENST00000590381 ADGRB3O60242 1522 aa43.89■■■■■ 4.62
PQLC1-211ENST00000590381 IQGAP3Q86VI3 1631 aa43.88■■■■■ 4.62
PQLC1-211ENST00000590381 E9PCH4 1651 aa43.88■■■■■ 4.61
PQLC1-211ENST00000590381 LRRC7Q96NW7 1537 aa43.78■■■■■ 4.6
PQLC1-211ENST00000590381 MYO5BQ9ULV0 1848 aa43.78■■■■■ 4.6
PQLC1-211ENST00000590381 TOM1O60784 492 aa43.76■■■■■ 4.6
PQLC1-211ENST00000590381 PIP4K2BP78356 416 aa43.76■■■■■ 4.6
PQLC1-211ENST00000590381 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP43.75■■■■■ 4.59
PQLC1-211ENST00000590381 CHGAP10645 457 aaKnown RBP43.74■■■■■ 4.59
PQLC1-211ENST00000590381 SLC26A8Q96RN1 970 aa43.73■■■■■ 4.59
PQLC1-211ENST00000590381 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP43.72■■■■■ 4.59
PQLC1-211ENST00000590381 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa43.72■■■■■ 4.59
PQLC1-211ENST00000590381 NAIPQ13075 1403 aa43.69■■■■■ 4.58
PQLC1-211ENST00000590381 RIMS2Q9UQ26 1411 aa43.67■■■■■ 4.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms