RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-210ENST00000589497 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.92■■■□□ 2.22
GIPC1-210ENST00000589497 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.91■■■□□ 2.22
GIPC1-210ENST00000589497 MROH2AA6NES4 1674 aa28.9■■■□□ 2.22
GIPC1-210ENST00000589497 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
GIPC1-210ENST00000589497 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.87■■■□□ 2.21
GIPC1-210ENST00000589497 ITGAEP38570 1179 aa28.87■■■□□ 2.21
GIPC1-210ENST00000589497 NPATQ14207 1427 aa28.86■■■□□ 2.21
GIPC1-210ENST00000589497 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.85■■■□□ 2.21
GIPC1-210ENST00000589497 ERBINQ96RT1 1412 aa28.84■■■□□ 2.21
GIPC1-210ENST00000589497 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.84■■■□□ 2.21
GIPC1-210ENST00000589497 NCOA1Q15788 1441 aa28.83■■■□□ 2.21
GIPC1-210ENST00000589497 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
GIPC1-210ENST00000589497 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.81■■■□□ 2.2
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GIPC1-210ENST00000589497 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
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GIPC1-210ENST00000589497 ADGRL2O95490 1459 aa28.76■■■□□ 2.19
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GIPC1-210ENST00000589497 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
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GIPC1-210ENST00000589497 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.59■■■□□ 2.17
GIPC1-210ENST00000589497 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
GIPC1-210ENST00000589497 DEPDC5O75140 1603 aa28.58■■■□□ 2.17
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GIPC1-210ENST00000589497 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
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GIPC1-210ENST00000589497 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.55■■■□□ 2.16
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GIPC1-210ENST00000589497 ERVK-7P63135 1459 aa28.53■■■□□ 2.16
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
GIPC1-210ENST00000589497 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
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GIPC1-210ENST00000589497 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.49■■■□□ 2.15
GIPC1-210ENST00000589497 PLA2R1Q13018 1463 aa28.48■■■□□ 2.15
GIPC1-210ENST00000589497 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.48■■■□□ 2.15
GIPC1-210ENST00000589497 PTPRTO14522 1441 aa28.48■■■□□ 2.15
GIPC1-210ENST00000589497 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.47■■■□□ 2.15
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GIPC1-210ENST00000589497 NUP155O75694 1391 aa28.47■■■□□ 2.15
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GIPC1-210ENST00000589497 UNC13BO14795 1591 aa28.4■■■□□ 2.14
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GIPC1-210ENST00000589497 TET3O43151 1660 aa28.35■■■□□ 2.13
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GIPC1-210ENST00000589497 NOS1P29475 1434 aa28.33■■■□□ 2.13
GIPC1-210ENST00000589497 HFM1A2PYH4 1435 aa28.32■■■□□ 2.12
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GIPC1-210ENST00000589497 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
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GIPC1-210ENST00000589497 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
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GIPC1-210ENST00000589497 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.09
GIPC1-210ENST00000589497 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.1■■■□□ 2.09
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
GIPC1-210ENST00000589497 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
GIPC1-210ENST00000589497 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.06■■■□□ 2.08
GIPC1-210ENST00000589497 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.05■■■□□ 2.08
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