RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589235.5

CIRBP-222, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene CIRBP, Length 1,073 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-222	ENST00000589235	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CIRBP-222	ENST00000589235	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CIRBP-222	ENST00000589235	PKD2	Q13563	968 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CIRBP-222	ENST00000589235	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.11	■■■□□ 2.89
CIRBP-222	ENST00000589235	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
CIRBP-222	ENST00000589235	TNR	Q92752	1358 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CIRBP-222	ENST00000589235	PZP	P20742	1482 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CIRBP-222	ENST00000589235	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		33.07	■■■□□ 2.88
CIRBP-222	ENST00000589235	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
CIRBP-222	ENST00000589235	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33.06	■■■□□ 2.88
CIRBP-222	ENST00000589235	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
CIRBP-222	ENST00000589235	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		33.06	■■■□□ 2.88
CIRBP-222	ENST00000589235	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.05	■■■□□ 2.88
CIRBP-222	ENST00000589235	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		33.04	■■■□□ 2.88
CIRBP-222	ENST00000589235	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		33.04	■■■□□ 2.88
CIRBP-222	ENST00000589235	ABCC5	O15440	1437 aa		33.03	■■■□□ 2.88
CIRBP-222	ENST00000589235	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		33.03	■■■□□ 2.88
CIRBP-222	ENST00000589235	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
CIRBP-222	ENST00000589235	KIF15	Q9NS87	1388 aa		33	■■■□□ 2.87
CIRBP-222	ENST00000589235	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		33	■■■□□ 2.87
CIRBP-222	ENST00000589235	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
CIRBP-222	ENST00000589235	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
CIRBP-222	ENST00000589235	DAPK1	P53355	1430 aa		32.99	■■■□□ 2.87
CIRBP-222	ENST00000589235	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
CIRBP-222	ENST00000589235	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.95	■■■□□ 2.87
CIRBP-222	ENST00000589235	NLRP1	Q9C000	1473 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CIRBP-222	ENST00000589235	ABCC3	O15438	1527 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CIRBP-222	ENST00000589235	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
CIRBP-222	ENST00000589235	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CIRBP-222	ENST00000589235	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
CIRBP-222	ENST00000589235	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.9	■■■□□ 2.86
CIRBP-222	ENST00000589235	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.9	■■■□□ 2.86
CIRBP-222	ENST00000589235	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.86
CIRBP-222	ENST00000589235	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.89	■■■□□ 2.86
CIRBP-222	ENST00000589235	KANK1	Q14678	1352 aa		32.87	■■■□□ 2.85
CIRBP-222	ENST00000589235	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.87	■■■□□ 2.85
CIRBP-222	ENST00000589235	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.86	■■■□□ 2.85	1e-19	■□□□□ 10
CIRBP-222	ENST00000589235	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.85	■■■□□ 2.85
CIRBP-222	ENST00000589235	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CIRBP-222	ENST00000589235	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CIRBP-222	ENST00000589235	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
CIRBP-222	ENST00000589235	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.83	■■■□□ 2.85	5e-6	■■■□□ 18.7
CIRBP-222	ENST00000589235	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CIRBP-222	ENST00000589235	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CIRBP-222	ENST00000589235	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
CIRBP-222	ENST00000589235	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CIRBP-222	ENST00000589235	CEP152	O94986	1710 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CIRBP-222	ENST00000589235	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CIRBP-222	ENST00000589235	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
CIRBP-222	ENST00000589235	DEPDC5	O75140	1603 aa		32.69	■■■□□ 2.82
CIRBP-222	ENST00000589235	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
CIRBP-222	ENST00000589235	MED14	O60244	1454 aa		32.67	■■■□□ 2.82
CIRBP-222	ENST00000589235	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.66	■■■□□ 2.82
CIRBP-222	ENST00000589235	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.65	■■■□□ 2.82
CIRBP-222	ENST00000589235	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.64	■■■□□ 2.82
CIRBP-222	ENST00000589235	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.64	■■■□□ 2.82
CIRBP-222	ENST00000589235	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CIRBP-222	ENST00000589235	CPS1	P31327	1500 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CIRBP-222	ENST00000589235	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.6	■■■□□ 2.81
CIRBP-222	ENST00000589235	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CIRBP-222	ENST00000589235	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
CIRBP-222	ENST00000589235	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.57	■■■□□ 2.8
CIRBP-222	ENST00000589235	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.55	■■■□□ 2.8
CIRBP-222	ENST00000589235	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.54	■■■□□ 2.8
CIRBP-222	ENST00000589235	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
CIRBP-222	ENST00000589235	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.53	■■■□□ 2.8
CIRBP-222	ENST00000589235	IDI1	Q13907	227 aa		32.52	■■■□□ 2.8
CIRBP-222	ENST00000589235	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
CIRBP-222	ENST00000589235	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.52	■■■□□ 2.8
CIRBP-222	ENST00000589235	TOM1	O60784	492 aa		32.51	■■■□□ 2.79
CIRBP-222	ENST00000589235	SLIT1	O75093	1534 aa		32.5	■■■□□ 2.79
CIRBP-222	ENST00000589235	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.5	■■■□□ 2.79
CIRBP-222	ENST00000589235	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.49	■■■□□ 2.79
CIRBP-222	ENST00000589235	ITGAE	P38570	1179 aa		32.49	■■■□□ 2.79
CIRBP-222	ENST00000589235	LTK	P29376	864 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CIRBP-222	ENST00000589235	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
CIRBP-222	ENST00000589235	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CIRBP-222	ENST00000589235	NOS1	P29475	1434 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CIRBP-222	ENST00000589235	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.45	■■■□□ 2.79
CIRBP-222	ENST00000589235	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
CIRBP-222	ENST00000589235	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
CIRBP-222	ENST00000589235	SYNM	O15061	1565 aa		32.39	■■■□□ 2.78
CIRBP-222	ENST00000589235	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
CIRBP-222	ENST00000589235	PIP4K2B	P78356	416 aa		32.37	■■■□□ 2.77
CIRBP-222	ENST00000589235	TET3	O43151	1660 aa		32.36	■■■□□ 2.77
CIRBP-222	ENST00000589235	UNC13B	O14795	1591 aa		32.36	■■■□□ 2.77
CIRBP-222	ENST00000589235	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		32.34	■■■□□ 2.77
CIRBP-222	ENST00000589235	NUP155	O75694	1391 aa		32.33	■■■□□ 2.77
CIRBP-222	ENST00000589235	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.33	■■■□□ 2.77
CIRBP-222	ENST00000589235	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CIRBP-222	ENST00000589235	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CIRBP-222	ENST00000589235	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.28	■■■□□ 2.76
CIRBP-222	ENST00000589235	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
CIRBP-222	ENST00000589235	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
CIRBP-222	ENST00000589235	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
CIRBP-222	ENST00000589235	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.24	■■■□□ 2.75
CIRBP-222	ENST00000589235	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.23	■■■□□ 2.75
CIRBP-222	ENST00000589235	KCNA6	P17658	529 aa		32.23	■■■□□ 2.75
CIRBP-222	ENST00000589235	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	32.23	■■■□□ 2.75
CIRBP-222	ENST00000589235	HSPA1L	P34931	641 aa		32.22	■■■□□ 2.75

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