RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa9.42□□□□□ -0.9
CAPNS1-208ENST00000589162 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.42□□□□□ -0.9
CAPNS1-208ENST00000589162 KDM5BQ9UGL1 1544 aa9.41□□□□□ -0.9
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC18Q5T9S5 1454 aa9.4□□□□□ -0.9
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLGA2Q08379 1002 aa9.4□□□□□ -0.9
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa9.4□□□□□ -0.91
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF14Q15058 1648 aa9.39□□□□□ -0.91
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.39□□□□□ -0.91
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.39□□□□□ -0.91
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM205CA6NFA0 338 aa9.38□□□□□ -0.91
CAPNS1-208ENST00000589162 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CAPNS1-208ENST00000589162 MTUS2Q5JR59 1369 aa9.37□□□□□ -0.91
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP3K1Q13233 1512 aa9.37□□□□□ -0.91
CAPNS1-208ENST00000589162 DCAF8Q5TAQ9 597 aa9.37□□□□□ -0.91
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNH8Q96L42 1107 aa9.37□□□□□ -0.91
CAPNS1-208ENST00000589162 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa9.36□□□□□ -0.91
CAPNS1-208ENST00000589162 ASXL2Q76L83 1435 aa9.36□□□□□ -0.91
CAPNS1-208ENST00000589162 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
CAPNS1-208ENST00000589162 NCOA2Q15596 1464 aa9.34□□□□□ -0.91
CAPNS1-208ENST00000589162 TTC37Q6PGP7 1564 aa9.34□□□□□ -0.91
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHD1A6NEE1 506 aa9.34□□□□□ -0.91
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CAPNS1-208ENST00000589162 PHLDB1Q86UU1 1377 aa9.34□□□□□ -0.91
CAPNS1-208ENST00000589162 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.92
CAPNS1-208ENST00000589162 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR7Q9Y4E6 1490 aa9.33□□□□□ -0.92
CAPNS1-208ENST00000589162 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
CAPNS1-208ENST00000589162 PYGBP11216 843 aa9.31□□□□□ -0.92
CAPNS1-208ENST00000589162 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCC10Q5T3U5 1492 aa9.31□□□□□ -0.92
CAPNS1-208ENST00000589162 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-208ENST00000589162 MAPKBP1O60336 1514 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-208ENST00000589162 G3V3G9 751 aa9.29□□□□□ -0.92
CAPNS1-208ENST00000589162 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
CAPNS1-208ENST00000589162 CCNB3Q8WWL7 1395 aa9.28□□□□□ -0.92
CAPNS1-208ENST00000589162 POTEB3A0JP26 581 aa9.28□□□□□ -0.92
CAPNS1-208ENST00000589162 POTEBQ6S5H4 581 aa9.28□□□□□ -0.92
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.28□□□□□ -0.92
CAPNS1-208ENST00000589162 DIP2BQ9P265 1576 aa9.28□□□□□ -0.92
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CAPNS1-208ENST00000589162 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF13AQ9H1H9 1805 aa9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 PTGER2P43116 358 aa9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 GSE1Q14687 1217 aa9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 TSPOAP1O95153 1857 aa9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 MYO5CQ9NQX4 1742 aa9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 MYOM3Q5VTT5 1437 aa9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 ITGAEP38570 1179 aa9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM69CQ0P6D2 419 aa9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 PREX2Q70Z35 1606 aa9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCA9Q8IUA7 1624 aa9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 FGD6Q6ZV73 1430 aa9.25□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 DOK7Q18PE1 504 aa9.25□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 ITSN2Q9NZM3 1697 aa9.25□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPN23Q9H3S7 1636 aa9.24□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 RIMBP2O15034 1052 aa9.24□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP5Q13017 1502 aa9.24□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 ERBB3P21860 1342 aa9.24□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa9.24□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 CD109Q6YHK3 1445 aa9.22□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa9.22□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 GLI2P10070 1586 aa9.22□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 PCGF6Q9BYE7 350 aa9.22□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 PLCH2O75038 1416 aa9.22□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CAPNS1-208ENST00000589162 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP9.21□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.21□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa9.21□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 SYCP2Q9BX26 1530 aa9.2□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXO3Q9UK99 471 aa9.19□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPRKQ15262 1439 aa9.19□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 FANCAO15360 1455 aa9.19□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 PSEN1P49768 467 aa9.18□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 MIA2Q96PC5 1412 aa9.18□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.18□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.18□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCC1P33527 1531 aa9.17□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa9.17□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa9.17□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.17□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 AKNAQ7Z591 1439 aa9.16□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 ADGRL1O94910 1474 aa9.15□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCC5O15440 1437 aa9.15□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 SCAPERQ9BY12 1400 aa9.15□□□□□ -0.94
CAPNS1-208ENST00000589162 ARAP3Q8WWN8 1544 aa9.15□□□□□ -0.95
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