RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588767.5

SLC25A39-211, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 5

Gene SLC25A39, Length 807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-211ENST00000588767 GGT6Q6P531 493 aa23.44■■□□□ 1.34
SLC25A39-211ENST00000588767 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SLC25A39-211ENST00000588767 MBD5Q9P267 1494 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC25A39-211ENST00000588767 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
SLC25A39-211ENST00000588767 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.39■■□□□ 1.33
SLC25A39-211ENST00000588767 CPS1P31327 1500 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC25A39-211ENST00000588767 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC25A39-211ENST00000588767 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SLC25A39-211ENST00000588767 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.35■■□□□ 1.33
SLC25A39-211ENST00000588767 HSPA1LP34931 641 aa23.35■■□□□ 1.33
SLC25A39-211ENST00000588767 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SLC25A39-211ENST00000588767 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SLC25A39-211ENST00000588767 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.34■■□□□ 1.33
SLC25A39-211ENST00000588767 PZPP20742 1482 aa23.33■■□□□ 1.33
SLC25A39-211ENST00000588767 TNRQ92752 1358 aa23.33■■□□□ 1.33
SLC25A39-211ENST00000588767 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-211ENST00000588767 TOM1O60784 492 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-211ENST00000588767 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-211ENST00000588767 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.29■■□□□ 1.32
SLC25A39-211ENST00000588767 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SLC25A39-211ENST00000588767 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.28■■□□□ 1.32
SLC25A39-211ENST00000588767 PIP4K2BP78356 416 aa23.27■■□□□ 1.32
SLC25A39-211ENST00000588767 ALKQ9UM73 1620 aa23.26■■□□□ 1.31
SLC25A39-211ENST00000588767 MIA2Q96PC5 1412 aa23.26■■□□□ 1.31
SLC25A39-211ENST00000588767 MED14O60244 1454 aa23.26■■□□□ 1.31
SLC25A39-211ENST00000588767 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.26■■□□□ 1.31
SLC25A39-211ENST00000588767 NLRP1Q9C000 1473 aa23.25■■□□□ 1.31
SLC25A39-211ENST00000588767 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SLC25A39-211ENST00000588767 DEPDC5O75140 1603 aa23.24■■□□□ 1.31
SLC25A39-211ENST00000588767 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
SLC25A39-211ENST00000588767 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.24■■□□□ 1.31
SLC25A39-211ENST00000588767 KIF3BO15066 747 aa23.23■■□□□ 1.31
SLC25A39-211ENST00000588767 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.23■■□□□ 1.31
SLC25A39-211ENST00000588767 TSPY4P0CV99 314 aa23.21■■□□□ 1.31
SLC25A39-211ENST00000588767 TSPY10P0CW01 314 aa23.21■■□□□ 1.31
SLC25A39-211ENST00000588767 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SLC25A39-211ENST00000588767 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.2■■□□□ 1.3
SLC25A39-211ENST00000588767 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SLC25A39-211ENST00000588767 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.2■■□□□ 1.3
SLC25A39-211ENST00000588767 IQGAP1P46940 1657 aa23.16■■□□□ 1.3
SLC25A39-211ENST00000588767 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.14■■□□□ 1.29
SLC25A39-211ENST00000588767 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.13■■□□□ 1.29
SLC25A39-211ENST00000588767 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.13■■□□□ 1.29
SLC25A39-211ENST00000588767 SYNMO15061 1565 aa23.12■■□□□ 1.29
SLC25A39-211ENST00000588767 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SLC25A39-211ENST00000588767 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SLC25A39-211ENST00000588767 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.11■■□□□ 1.29
SLC25A39-211ENST00000588767 ABCC3O15438 1527 aa23.1■■□□□ 1.29
SLC25A39-211ENST00000588767 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SLC25A39-211ENST00000588767 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SLC25A39-211ENST00000588767 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.07■■□□□ 1.28
SLC25A39-211ENST00000588767 ERVK-7P63135 1459 aa23.06■■□□□ 1.28
SLC25A39-211ENST00000588767 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SLC25A39-211ENST00000588767 ABCC5O15440 1437 aa23.04■■□□□ 1.28
SLC25A39-211ENST00000588767 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.03■■□□□ 1.28
SLC25A39-211ENST00000588767 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SLC25A39-211ENST00000588767 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.02■■□□□ 1.28
SLC25A39-211ENST00000588767 DAPK1P53355 1430 aa23■■□□□ 1.27
SLC25A39-211ENST00000588767 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.99■■□□□ 1.27
SLC25A39-211ENST00000588767 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SLC25A39-211ENST00000588767 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.98■■□□□ 1.27
SLC25A39-211ENST00000588767 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.97■■□□□ 1.27
SLC25A39-211ENST00000588767 SLIT1O75093 1534 aa22.97■■□□□ 1.27
SLC25A39-211ENST00000588767 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.96■■□□□ 1.27
SLC25A39-211ENST00000588767 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SLC25A39-211ENST00000588767 KIF15Q9NS87 1388 aa22.93■■□□□ 1.26
SLC25A39-211ENST00000588767 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.92■■□□□ 1.26
SLC25A39-211ENST00000588767 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.92■■□□□ 1.26
SLC25A39-211ENST00000588767 LTKP29376 864 aa22.92■■□□□ 1.26
SLC25A39-211ENST00000588767 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SLC25A39-211ENST00000588767 CEP152O94986 1710 aa22.91■■□□□ 1.26
SLC25A39-211ENST00000588767 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SLC25A39-211ENST00000588767 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
SLC25A39-211ENST00000588767 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.89■■□□□ 1.26
SLC25A39-211ENST00000588767 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.89■■□□□ 1.25
SLC25A39-211ENST00000588767 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.88■■□□□ 1.25
SLC25A39-211ENST00000588767 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.85■■□□□ 1.25
SLC25A39-211ENST00000588767 ITGAEP38570 1179 aa22.84■■□□□ 1.25
SLC25A39-211ENST00000588767 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.84■■□□□ 1.25
SLC25A39-211ENST00000588767 ERBINQ96RT1 1412 aa22.83■■□□□ 1.25
SLC25A39-211ENST00000588767 ADGRL2O95490 1459 aa22.83■■□□□ 1.25
SLC25A39-211ENST00000588767 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SLC25A39-211ENST00000588767 EID1Q9Y6B2 187 aa22.82■■□□□ 1.24
SLC25A39-211ENST00000588767 PIK3C2BO00750 1634 aa22.81■■□□□ 1.24
SLC25A39-211ENST00000588767 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SLC25A39-211ENST00000588767 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SLC25A39-211ENST00000588767 TMEM94Q12767 1356 aa22.79■■□□□ 1.24
SLC25A39-211ENST00000588767 POTEAQ6S8J7 498 aa22.77■■□□□ 1.24
SLC25A39-211ENST00000588767 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.24
SLC25A39-211ENST00000588767 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.77■■□□□ 1.24
SLC25A39-211ENST00000588767 ROCK1Q13464 1354 aa22.76■■□□□ 1.23
SLC25A39-211ENST00000588767 TET3O43151 1660 aa22.76■■□□□ 1.23
SLC25A39-211ENST00000588767 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.75■■□□□ 1.23
SLC25A39-211ENST00000588767 KCNA6P17658 529 aa22.75■■□□□ 1.23
SLC25A39-211ENST00000588767 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.74■■□□□ 1.23
SLC25A39-211ENST00000588767 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.74■■□□□ 1.23
SLC25A39-211ENST00000588767 NWD1Q149M9 1564 aa22.73■■□□□ 1.23
SLC25A39-211ENST00000588767 KANK1Q14678 1352 aa22.73■■□□□ 1.23
SLC25A39-211ENST00000588767 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SLC25A39-211ENST00000588767 IDI1Q13907 227 aa22.7■■□□□ 1.22
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