RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588230.5

CIRBP-217, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CIRBP, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-217ENST00000588230 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
CIRBP-217ENST00000588230 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.67■■■□□ 2.34
CIRBP-217ENST00000588230 DAPK1P53355 1430 aa29.65■■■□□ 2.34
CIRBP-217ENST00000588230 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
CIRBP-217ENST00000588230 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
CIRBP-217ENST00000588230 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.63■■■□□ 2.33
CIRBP-217ENST00000588230 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
CIRBP-217ENST00000588230 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.62■■■□□ 2.33
CIRBP-217ENST00000588230 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.61■■■□□ 2.33
CIRBP-217ENST00000588230 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
CIRBP-217ENST00000588230 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
CIRBP-217ENST00000588230 PZPP20742 1482 aa29.58■■■□□ 2.33
CIRBP-217ENST00000588230 NCOA1Q15788 1441 aa29.57■■■□□ 2.32
CIRBP-217ENST00000588230 KIF15Q9NS87 1388 aa29.57■■■□□ 2.32
CIRBP-217ENST00000588230 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
CIRBP-217ENST00000588230 ABCC3O15438 1527 aa29.56■■■□□ 2.32
CIRBP-217ENST00000588230 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.54■■■□□ 2.32
CIRBP-217ENST00000588230 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
CIRBP-217ENST00000588230 ERBINQ96RT1 1412 aa29.53■■■□□ 2.32
CIRBP-217ENST00000588230 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.53■■■□□ 2.32
CIRBP-217ENST00000588230 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
CIRBP-217ENST00000588230 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.5■■■□□ 2.31
CIRBP-217ENST00000588230 PTPRTO14522 1441 aa29.49■■■□□ 2.31
CIRBP-217ENST00000588230 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.49■■■□□ 2.31
CIRBP-217ENST00000588230 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
CIRBP-217ENST00000588230 TNRQ92752 1358 aa29.48■■■□□ 2.31
CIRBP-217ENST00000588230 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.48■■■□□ 2.31
CIRBP-217ENST00000588230 ADGRL2O95490 1459 aa29.48■■■□□ 2.31
CIRBP-217ENST00000588230 DEPDC5O75140 1603 aa29.46■■■□□ 2.31
CIRBP-217ENST00000588230 PLA2R1Q13018 1463 aa29.46■■■□□ 2.31
CIRBP-217ENST00000588230 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.45■■■□□ 2.31
CIRBP-217ENST00000588230 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.45■■■□□ 2.31
CIRBP-217ENST00000588230 CEP152O94986 1710 aa29.45■■■□□ 2.3
CIRBP-217ENST00000588230 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.42■■■□□ 2.3
CIRBP-217ENST00000588230 FBXO41Q8TF61 875 aa29.39■■■□□ 2.3
CIRBP-217ENST00000588230 ERVK-7P63135 1459 aa29.38■■■□□ 2.29
CIRBP-217ENST00000588230 NLRP1Q9C000 1473 aa29.37■■■□□ 2.29
CIRBP-217ENST00000588230 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.37■■■□□ 2.29
CIRBP-217ENST00000588230 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.37■■■□□ 2.29
CIRBP-217ENST00000588230 CERKQ8TCT0 537 aa29.34■■■□□ 2.29
CIRBP-217ENST00000588230 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.34■■■□□ 2.29
CIRBP-217ENST00000588230 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.33■■■□□ 2.295e-6■■■□□ 18.7
CIRBP-217ENST00000588230 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.32■■■□□ 2.28
CIRBP-217ENST00000588230 ITGAEP38570 1179 aa29.32■■■□□ 2.28
CIRBP-217ENST00000588230 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.31■■■□□ 2.28
CIRBP-217ENST00000588230 PKD2Q13563 968 aa29.31■■■□□ 2.28
CIRBP-217ENST00000588230 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.29■■■□□ 2.28
CIRBP-217ENST00000588230 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.28■■■□□ 2.28
CIRBP-217ENST00000588230 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.28■■■□□ 2.28
CIRBP-217ENST00000588230 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.27■■■□□ 2.28
CIRBP-217ENST00000588230 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
CIRBP-217ENST00000588230 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CIRBP-217ENST00000588230 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CIRBP-217ENST00000588230 ROCK1Q13464 1354 aa29.24■■■□□ 2.27
CIRBP-217ENST00000588230 KANK1Q14678 1352 aa29.24■■■□□ 2.27
CIRBP-217ENST00000588230 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.21■■■□□ 2.27
CIRBP-217ENST00000588230 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
CIRBP-217ENST00000588230 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.19■■■□□ 2.26
CIRBP-217ENST00000588230 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
CIRBP-217ENST00000588230 UNC13BO14795 1591 aa29.17■■■□□ 2.26
CIRBP-217ENST00000588230 MED14O60244 1454 aa29.16■■■□□ 2.26
CIRBP-217ENST00000588230 SYNMO15061 1565 aa29.14■■■□□ 2.26
CIRBP-217ENST00000588230 NOS1P29475 1434 aa29.13■■■□□ 2.25
CIRBP-217ENST00000588230 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.12■■■□□ 2.25
CIRBP-217ENST00000588230 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.11■■■□□ 2.25
CIRBP-217ENST00000588230 PIK3C2BO00750 1634 aa29.11■■■□□ 2.25
CIRBP-217ENST00000588230 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.1■■■□□ 2.25
CIRBP-217ENST00000588230 TET3O43151 1660 aa29.1■■■□□ 2.25
CIRBP-217ENST00000588230 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
CIRBP-217ENST00000588230 SLIT1O75093 1534 aa29.09■■■□□ 2.25
CIRBP-217ENST00000588230 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CIRBP-217ENST00000588230 IQGAP1P46940 1657 aa29.06■■■□□ 2.24
CIRBP-217ENST00000588230 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CIRBP-217ENST00000588230 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.05■■■□□ 2.24
CIRBP-217ENST00000588230 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.04■■■□□ 2.24
CIRBP-217ENST00000588230 IDI1Q13907 227 aa29.03■■■□□ 2.24
CIRBP-217ENST00000588230 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
CIRBP-217ENST00000588230 LTKP29376 864 aa29■■■□□ 2.23
CIRBP-217ENST00000588230 ADGRB3O60242 1522 aa28.99■■■□□ 2.23
CIRBP-217ENST00000588230 E9PCH4 1651 aa28.99■■■□□ 2.23
CIRBP-217ENST00000588230 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.98■■■□□ 2.23
CIRBP-217ENST00000588230 CPS1P31327 1500 aa28.96■■■□□ 2.23
CIRBP-217ENST00000588230 NUP155O75694 1391 aa28.95■■■□□ 2.22
CIRBP-217ENST00000588230 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.94■■■□□ 2.22
CIRBP-217ENST00000588230 NAIPQ13075 1403 aa28.93■■■□□ 2.22
CIRBP-217ENST00000588230 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.93■■■□□ 2.22
CIRBP-217ENST00000588230 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.92■■■□□ 2.22
CIRBP-217ENST00000588230 HFM1A2PYH4 1435 aa28.88■■■□□ 2.21
CIRBP-217ENST00000588230 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.87■■■□□ 2.21
CIRBP-217ENST00000588230 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.87■■■□□ 2.21
CIRBP-217ENST00000588230 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.85■■■□□ 2.21
CIRBP-217ENST00000588230 EID1Q9Y6B2 187 aa28.85■■■□□ 2.21
CIRBP-217ENST00000588230 ZFYVE9O95405 1425 aa28.85■■■□□ 2.21
CIRBP-217ENST00000588230 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.81■■■□□ 2.2
CIRBP-217ENST00000588230 TRIM52Q96A61 297 aa28.8■■■□□ 2.2
CIRBP-217ENST00000588230 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.79■■■□□ 2.2
CIRBP-217ENST00000588230 ALKQ9UM73 1620 aa28.78■■■□□ 2.2
CIRBP-217ENST00000588230 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.76■■■□□ 2.19
CIRBP-217ENST00000588230 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.75■■■□□ 2.19
CIRBP-217ENST00000588230 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.71■■■□□ 2.19
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