RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587752.5

CTIF-203, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 5

Gene CTIF, Length 683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-203ENST00000587752 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.4■■□□□ 1.34
CTIF-203ENST00000587752 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.39■■□□□ 1.34
CTIF-203ENST00000587752 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CTIF-203ENST00000587752 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.38■■□□□ 1.33
CTIF-203ENST00000587752 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.38■■□□□ 1.33
CTIF-203ENST00000587752 DAPK1P53355 1430 aa23.38■■□□□ 1.33
CTIF-203ENST00000587752 NCOA1Q15788 1441 aa23.37■■□□□ 1.33
CTIF-203ENST00000587752 FBXO41Q8TF61 875 aa23.37■■□□□ 1.33
CTIF-203ENST00000587752 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.36■■□□□ 1.33
CTIF-203ENST00000587752 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CTIF-203ENST00000587752 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CTIF-203ENST00000587752 KIF15Q9NS87 1388 aa23.36■■□□□ 1.33
CTIF-203ENST00000587752 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.36■■□□□ 1.33
CTIF-203ENST00000587752 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CTIF-203ENST00000587752 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.35■■□□□ 1.33
CTIF-203ENST00000587752 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.35■■□□□ 1.33
CTIF-203ENST00000587752 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CTIF-203ENST00000587752 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CTIF-203ENST00000587752 PZPP20742 1482 aa23.34■■□□□ 1.33
CTIF-203ENST00000587752 TNRQ92752 1358 aa23.33■■□□□ 1.33
CTIF-203ENST00000587752 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CTIF-203ENST00000587752 CERKQ8TCT0 537 aa23.33■■□□□ 1.33
CTIF-203ENST00000587752 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.33■■□□□ 1.32
CTIF-203ENST00000587752 PTPRTO14522 1441 aa23.32■■□□□ 1.32
CTIF-203ENST00000587752 ABCC3O15438 1527 aa23.31■■□□□ 1.32
CTIF-203ENST00000587752 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.3■■□□□ 1.32
CTIF-203ENST00000587752 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.3■■□□□ 1.32
CTIF-203ENST00000587752 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CTIF-203ENST00000587752 CEP152O94986 1710 aa23.28■■□□□ 1.32
CTIF-203ENST00000587752 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.322e-9■■■□□ 16.8
CTIF-203ENST00000587752 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.27■■□□□ 1.31
CTIF-203ENST00000587752 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CTIF-203ENST00000587752 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CTIF-203ENST00000587752 ERBINQ96RT1 1412 aa23.25■■□□□ 1.31
CTIF-203ENST00000587752 PLA2R1Q13018 1463 aa23.24■■□□□ 1.31
CTIF-203ENST00000587752 PKD2Q13563 968 aa23.23■■□□□ 1.31
CTIF-203ENST00000587752 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CTIF-203ENST00000587752 ERVK-7P63135 1459 aa23.19■■□□□ 1.3
CTIF-203ENST00000587752 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.18■■□□□ 1.3
CTIF-203ENST00000587752 NLRP1Q9C000 1473 aa23.18■■□□□ 1.3
CTIF-203ENST00000587752 ADGRL2O95490 1459 aa23.17■■□□□ 1.3
CTIF-203ENST00000587752 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.39e-7■■□□□ 13.7
CTIF-203ENST00000587752 KANK1Q14678 1352 aa23.16■■□□□ 1.3
CTIF-203ENST00000587752 DEPDC5O75140 1603 aa23.16■■□□□ 1.3
CTIF-203ENST00000587752 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CTIF-203ENST00000587752 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.16■■□□□ 1.3
CTIF-203ENST00000587752 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.15■■□□□ 1.3
CTIF-203ENST00000587752 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CTIF-203ENST00000587752 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CTIF-203ENST00000587752 ITGAEP38570 1179 aa23.12■■□□□ 1.29
CTIF-203ENST00000587752 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.11■■□□□ 1.29
CTIF-203ENST00000587752 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.11■■□□□ 1.29
CTIF-203ENST00000587752 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.1■■□□□ 1.29
CTIF-203ENST00000587752 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.1■■□□□ 1.29
CTIF-203ENST00000587752 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.07■■□□□ 1.28
CTIF-203ENST00000587752 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.05■■□□□ 1.28
CTIF-203ENST00000587752 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.04■■□□□ 1.28
CTIF-203ENST00000587752 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CTIF-203ENST00000587752 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.01■■□□□ 1.27
CTIF-203ENST00000587752 ROCK1Q13464 1354 aa23.01■■□□□ 1.27
CTIF-203ENST00000587752 PIK3C2BO00750 1634 aa23■■□□□ 1.27
CTIF-203ENST00000587752 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.99■■□□□ 1.27
CTIF-203ENST00000587752 MED14O60244 1454 aa22.98■■□□□ 1.27
CTIF-203ENST00000587752 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.98■■□□□ 1.27
CTIF-203ENST00000587752 SYNMO15061 1565 aa22.97■■□□□ 1.27
CTIF-203ENST00000587752 IQGAP1P46940 1657 aa22.97■■□□□ 1.27
CTIF-203ENST00000587752 IDI1Q13907 227 aa22.97■■□□□ 1.27
CTIF-203ENST00000587752 UNC13BO14795 1591 aa22.95■■□□□ 1.26
CTIF-203ENST00000587752 LTKP29376 864 aa22.95■■□□□ 1.26
CTIF-203ENST00000587752 NOS1P29475 1434 aa22.95■■□□□ 1.26
CTIF-203ENST00000587752 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.95■■□□□ 1.26
CTIF-203ENST00000587752 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CTIF-203ENST00000587752 TET3O43151 1660 aa22.93■■□□□ 1.26
CTIF-203ENST00000587752 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.93■■□□□ 1.26
CTIF-203ENST00000587752 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.93■■□□□ 1.26
CTIF-203ENST00000587752 SLIT1O75093 1534 aa22.92■■□□□ 1.26
CTIF-203ENST00000587752 EID1Q9Y6B2 187 aa22.91■■□□□ 1.26
CTIF-203ENST00000587752 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CTIF-203ENST00000587752 CPS1P31327 1500 aa22.9■■□□□ 1.26
CTIF-203ENST00000587752 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CTIF-203ENST00000587752 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.9■■□□□ 1.26
CTIF-203ENST00000587752 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.89■■□□□ 1.26
CTIF-203ENST00000587752 NUP155O75694 1391 aa22.89■■□□□ 1.25
CTIF-203ENST00000587752 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.87■■□□□ 1.25
CTIF-203ENST00000587752 E9PCH4 1651 aa22.86■■□□□ 1.25
CTIF-203ENST00000587752 ADGRB3O60242 1522 aa22.86■■□□□ 1.25
CTIF-203ENST00000587752 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.86■■□□□ 1.25
CTIF-203ENST00000587752 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.86■■□□□ 1.25
CTIF-203ENST00000587752 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CTIF-203ENST00000587752 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CTIF-203ENST00000587752 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.82■■□□□ 1.24
CTIF-203ENST00000587752 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CTIF-203ENST00000587752 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CTIF-203ENST00000587752 PIP4K2BP78356 416 aa22.79■■□□□ 1.24
CTIF-203ENST00000587752 BCANQ96GW7 911 aa22.78■■□□□ 1.24
CTIF-203ENST00000587752 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.78■■□□□ 1.24
CTIF-203ENST00000587752 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.77■■□□□ 1.24
CTIF-203ENST00000587752 NAIPQ13075 1403 aa22.77■■□□□ 1.24
CTIF-203ENST00000587752 TOM1O60784 492 aa22.77■■□□□ 1.24
CTIF-203ENST00000587752 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 253.8 ms