RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586291.1

REXO1-202, Transcript of RNA exonuclease 1 homolog, humanhuman

TSL 3

Gene REXO1, Length 544 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO1-202ENST00000586291 GGT6Q6P531 493 aa25.37■■□□□ 1.65
REXO1-202ENST00000586291 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.37■■□□□ 1.65
REXO1-202ENST00000586291 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
REXO1-202ENST00000586291 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
REXO1-202ENST00000586291 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
REXO1-202ENST00000586291 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
REXO1-202ENST00000586291 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.31■■□□□ 1.64
REXO1-202ENST00000586291 MIA2Q96PC5 1412 aa25.31■■□□□ 1.64
REXO1-202ENST00000586291 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.31■■□□□ 1.64
REXO1-202ENST00000586291 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.3■■□□□ 1.64
REXO1-202ENST00000586291 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.27■■□□□ 1.64
REXO1-202ENST00000586291 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.26■■□□□ 1.63
REXO1-202ENST00000586291 TSPY4P0CV99 314 aa25.25■■□□□ 1.63
REXO1-202ENST00000586291 TSPY10P0CW01 314 aa25.25■■□□□ 1.63
REXO1-202ENST00000586291 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
REXO1-202ENST00000586291 APLP2Q06481 763 aa25.22■■□□□ 1.63
REXO1-202ENST00000586291 KIF3BO15066 747 aa25.21■■□□□ 1.63
REXO1-202ENST00000586291 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.2■■□□□ 1.63
REXO1-202ENST00000586291 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.2■■□□□ 1.62
REXO1-202ENST00000586291 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
REXO1-202ENST00000586291 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.19■■□□□ 1.62
REXO1-202ENST00000586291 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
REXO1-202ENST00000586291 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
REXO1-202ENST00000586291 TNRQ92752 1358 aa25.17■■□□□ 1.62
REXO1-202ENST00000586291 PZPP20742 1482 aa25.15■■□□□ 1.62
REXO1-202ENST00000586291 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.13■■□□□ 1.61
REXO1-202ENST00000586291 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
REXO1-202ENST00000586291 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.12■■□□□ 1.61
REXO1-202ENST00000586291 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
REXO1-202ENST00000586291 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.12■■□□□ 1.61
REXO1-202ENST00000586291 CPS1P31327 1500 aa25.11■■□□□ 1.61
REXO1-202ENST00000586291 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.11■■□□□ 1.61
REXO1-202ENST00000586291 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.1■■□□□ 1.61
REXO1-202ENST00000586291 ABCC5O15440 1437 aa25.1■■□□□ 1.61
REXO1-202ENST00000586291 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.09■■□□□ 1.61
REXO1-202ENST00000586291 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.09■■□□□ 1.61
REXO1-202ENST00000586291 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
REXO1-202ENST00000586291 TOM1O60784 492 aa25.08■■□□□ 1.61
REXO1-202ENST00000586291 ABCC3O15438 1527 aa25.07■■□□□ 1.6
REXO1-202ENST00000586291 HSPA1LP34931 641 aa25.06■■□□□ 1.6
REXO1-202ENST00000586291 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.6
REXO1-202ENST00000586291 DAPK1P53355 1430 aa25.05■■□□□ 1.6
REXO1-202ENST00000586291 NLRP1Q9C000 1473 aa25.05■■□□□ 1.6
REXO1-202ENST00000586291 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
REXO1-202ENST00000586291 CEP152O94986 1710 aa25.05■■□□□ 1.6
REXO1-202ENST00000586291 MED14O60244 1454 aa25.02■■□□□ 1.6
REXO1-202ENST00000586291 PIP4K2BP78356 416 aa25.02■■□□□ 1.6
REXO1-202ENST00000586291 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
REXO1-202ENST00000586291 KIF15Q9NS87 1388 aa25.02■■□□□ 1.6
REXO1-202ENST00000586291 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.01■■□□□ 1.59
REXO1-202ENST00000586291 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.01■■□□□ 1.59
REXO1-202ENST00000586291 ERBINQ96RT1 1412 aa25.01■■□□□ 1.59
REXO1-202ENST00000586291 DEPDC5O75140 1603 aa25.01■■□□□ 1.59
REXO1-202ENST00000586291 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
REXO1-202ENST00000586291 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
REXO1-202ENST00000586291 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
REXO1-202ENST00000586291 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.94■■□□□ 1.58
REXO1-202ENST00000586291 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.93■■□□□ 1.58
REXO1-202ENST00000586291 ERVK-7P63135 1459 aa24.92■■□□□ 1.58
REXO1-202ENST00000586291 ALKQ9UM73 1620 aa24.92■■□□□ 1.58
REXO1-202ENST00000586291 ADGRL2O95490 1459 aa24.91■■□□□ 1.58
REXO1-202ENST00000586291 IQGAP1P46940 1657 aa24.91■■□□□ 1.58
REXO1-202ENST00000586291 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.88■■□□□ 1.57
REXO1-202ENST00000586291 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.86■■□□□ 1.57
REXO1-202ENST00000586291 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.86■■□□□ 1.57
REXO1-202ENST00000586291 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.86■■□□□ 1.57
REXO1-202ENST00000586291 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.85■■□□□ 1.57
REXO1-202ENST00000586291 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.84■■□□□ 1.57
REXO1-202ENST00000586291 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
REXO1-202ENST00000586291 KANK1Q14678 1352 aa24.81■■□□□ 1.56
REXO1-202ENST00000586291 SYNMO15061 1565 aa24.8■■□□□ 1.56
REXO1-202ENST00000586291 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.79■■□□□ 1.56
REXO1-202ENST00000586291 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
REXO1-202ENST00000586291 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
REXO1-202ENST00000586291 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.77■■□□□ 1.56
REXO1-202ENST00000586291 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
REXO1-202ENST00000586291 LTKP29376 864 aa24.76■■□□□ 1.55
REXO1-202ENST00000586291 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.76■■□□□ 1.55
REXO1-202ENST00000586291 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.76■■□□□ 1.55
REXO1-202ENST00000586291 SLIT1O75093 1534 aa24.75■■□□□ 1.55
REXO1-202ENST00000586291 PIK3C2BO00750 1634 aa24.75■■□□□ 1.55
REXO1-202ENST00000586291 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.74■■□□□ 1.55
REXO1-202ENST00000586291 UNC13BO14795 1591 aa24.71■■□□□ 1.55
REXO1-202ENST00000586291 ROCK1Q13464 1354 aa24.7■■□□□ 1.55
REXO1-202ENST00000586291 TET3O43151 1660 aa24.7■■□□□ 1.54
REXO1-202ENST00000586291 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.69■■□□□ 1.54
REXO1-202ENST00000586291 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
REXO1-202ENST00000586291 EID1Q9Y6B2 187 aa24.69■■□□□ 1.54
REXO1-202ENST00000586291 NOS1P29475 1434 aa24.68■■□□□ 1.54
REXO1-202ENST00000586291 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
REXO1-202ENST00000586291 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
REXO1-202ENST00000586291 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.65■■□□□ 1.54
REXO1-202ENST00000586291 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.61■■□□□ 1.53
REXO1-202ENST00000586291 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.61■■□□□ 1.53
REXO1-202ENST00000586291 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.61■■□□□ 1.53
REXO1-202ENST00000586291 IDI1Q13907 227 aa24.6■■□□□ 1.53
REXO1-202ENST00000586291 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
REXO1-202ENST00000586291 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
REXO1-202ENST00000586291 ADGRB3O60242 1522 aa24.6■■□□□ 1.53
REXO1-202ENST00000586291 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.2 ms