RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 ANKLE2Q86XL3 938 aa13.1□□□□□ -0.31
GGA3-218ENST00000584243 ATAD2Q6PL18 1390 aa13.09□□□□□ -0.31
GGA3-218ENST00000584243 NHSL1Q5SYE7 1610 aa13.09□□□□□ -0.31
GGA3-218ENST00000584243 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
GGA3-218ENST00000584243 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa13.08□□□□□ -0.32
GGA3-218ENST00000584243 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
GGA3-218ENST00000584243 ITSN2Q9NZM3 1697 aa13.06□□□□□ -0.32
GGA3-218ENST00000584243 MYT1LQ9UL68 1186 aa13.06□□□□□ -0.32
GGA3-218ENST00000584243 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa13.06□□□□□ -0.32
GGA3-218ENST00000584243 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa13.05□□□□□ -0.32
GGA3-218ENST00000584243 AFF2P51816 1311 aa13.04□□□□□ -0.32
GGA3-218ENST00000584243 MAP3K1Q13233 1512 aa13.03□□□□□ -0.32
GGA3-218ENST00000584243 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
GGA3-218ENST00000584243 FGD6Q6ZV73 1430 aa13.02□□□□□ -0.33
GGA3-218ENST00000584243 BCL9LQ86UU0 1499 aa13.02□□□□□ -0.33
GGA3-218ENST00000584243 KDM5DQ9BY66 1539 aa13.01□□□□□ -0.33
GGA3-218ENST00000584243 MYO5CQ9NQX4 1742 aa13□□□□□ -0.33
GGA3-218ENST00000584243 SHPRHQ149N8 1683 aa12.99□□□□□ -0.33
GGA3-218ENST00000584243 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa12.99□□□□□ -0.33
GGA3-218ENST00000584243 TMEM94Q12767 1356 aa12.99□□□□□ -0.33
GGA3-218ENST00000584243 TNRQ92752 1358 aa12.99□□□□□ -0.33
GGA3-218ENST00000584243 SLC34A2O95436 690 aa12.99□□□□□ -0.33
GGA3-218ENST00000584243 HRCP23327 699 aa12.99□□□□□ -0.33
GGA3-218ENST00000584243 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
GGA3-218ENST00000584243 SAMD9Q5K651 1589 aa12.98□□□□□ -0.33
GGA3-218ENST00000584243 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
GGA3-218ENST00000584243 NWD1Q149M9 1564 aa12.97□□□□□ -0.33
GGA3-218ENST00000584243 PLXNC1O60486 1568 aa12.96□□□□□ -0.33
GGA3-218ENST00000584243 UGGT1Q9NYU2 1555 aa12.96□□□□□ -0.33
GGA3-218ENST00000584243 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
GGA3-218ENST00000584243 ATP7AQ04656 1500 aa12.96□□□□□ -0.33
GGA3-218ENST00000584243 C1QTNF8P60827 252 aa12.95□□□□□ -0.34
GGA3-218ENST00000584243 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
GGA3-218ENST00000584243 CCDC125Q86Z20 511 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-218ENST00000584243 ARHGAP5Q13017 1502 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-218ENST00000584243 DEFB132Q7Z7B7 95 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-218ENST00000584243 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
GGA3-218ENST00000584243 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
GGA3-218ENST00000584243 DIP2AQ14689 1571 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-218ENST00000584243 FAM135AQ9P2D6 1515 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-218ENST00000584243 UTRNP46939 3433 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-218ENST00000584243 SLAIN2Q9P270 581 aa12.91□□□□□ -0.34
GGA3-218ENST00000584243 KIF14Q15058 1648 aa12.91□□□□□ -0.34
GGA3-218ENST00000584243 GGT6Q6P531 493 aa12.89□□□□□ -0.35
GGA3-218ENST00000584243 NLRP1Q9C000 1473 aa12.89□□□□□ -0.35
GGA3-218ENST00000584243 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
GGA3-218ENST00000584243 TIAM1Q13009 1591 aa12.87□□□□□ -0.35
GGA3-218ENST00000584243 PZPP20742 1482 aa12.87□□□□□ -0.35
GGA3-218ENST00000584243 MIA2Q96PC5 1412 aa12.87□□□□□ -0.35
GGA3-218ENST00000584243 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa12.86□□□□□ -0.35
GGA3-218ENST00000584243 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
GGA3-218ENST00000584243 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-218ENST00000584243 NGLY1Q96IV0 654 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-218ENST00000584243 C8orf37Q96NL8 207 aa12.85□□□□□ -0.35
GGA3-218ENST00000584243 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
GGA3-218ENST00000584243 ADGBQ8N7X0 1667 aa12.83□□□□□ -0.35
GGA3-218ENST00000584243 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.35
GGA3-218ENST00000584243 LTKP29376 864 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-218ENST00000584243 A2MP01023 1474 aa12.83□□□□□ -0.36
GGA3-218ENST00000584243 PRXQ9BXM0 1461 aa12.79□□□□□ -0.36
GGA3-218ENST00000584243 NCOA2Q15596 1464 aa12.78□□□□□ -0.36
GGA3-218ENST00000584243 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
GGA3-218ENST00000584243 MSH6P52701 1360 aa12.78□□□□□ -0.36
GGA3-218ENST00000584243 ARHGAP23Q9P227 1491 aa12.78□□□□□ -0.36
GGA3-218ENST00000584243 MAST1Q9Y2H9 1570 aa12.77□□□□□ -0.36
GGA3-218ENST00000584243 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.36
GGA3-218ENST00000584243 KCNA6P17658 529 aa12.77□□□□□ -0.37
GGA3-218ENST00000584243 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa12.77□□□□□ -0.37
GGA3-218ENST00000584243 ABCC3O15438 1527 aa12.77□□□□□ -0.37
GGA3-218ENST00000584243 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
GGA3-218ENST00000584243 ATRNO75882 1429 aa12.76□□□□□ -0.37
GGA3-218ENST00000584243 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa12.75□□□□□ -0.37
GGA3-218ENST00000584243 PREX2Q70Z35 1606 aa12.74□□□□□ -0.37
GGA3-218ENST00000584243 PCDH10Q9P2E7 1040 aa12.74□□□□□ -0.37
GGA3-218ENST00000584243 UBR1Q8IWV7 1749 aa12.74□□□□□ -0.37
GGA3-218ENST00000584243 SLIT1O75093 1534 aa12.73□□□□□ -0.37
GGA3-218ENST00000584243 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
GGA3-218ENST00000584243 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
GGA3-218ENST00000584243 SETD5Q9C0A6 1442 aa12.72□□□□□ -0.37
GGA3-218ENST00000584243 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
GGA3-218ENST00000584243 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
GGA3-218ENST00000584243 TXNDC2Q86VQ3 553 aa12.7□□□□□ -0.38
GGA3-218ENST00000584243 USP21Q9UK80 565 aa12.7□□□□□ -0.38
GGA3-218ENST00000584243 SYCP2Q9BX26 1530 aa12.69□□□□□ -0.38
GGA3-218ENST00000584243 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
GGA3-218ENST00000584243 UNC13BO14795 1591 aa12.69□□□□□ -0.38
GGA3-218ENST00000584243 PNPLA6Q8IY17 1366 aa12.69□□□□□ -0.38
GGA3-218ENST00000584243 TET3O43151 1660 aa12.67□□□□□ -0.38
GGA3-218ENST00000584243 ADAMTS2O95450 1211 aa12.67□□□□□ -0.38
GGA3-218ENST00000584243 BRINP3Q76B58 766 aa12.67□□□□□ -0.38
GGA3-218ENST00000584243 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
GGA3-218ENST00000584243 CAPN15O75808 1086 aa12.66□□□□□ -0.38
GGA3-218ENST00000584243 EEA1Q15075 1411 aa12.64□□□□□ -0.39
GGA3-218ENST00000584243 SLC26A8Q96RN1 970 aa12.64□□□□□ -0.39
GGA3-218ENST00000584243 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP12.63□□□□□ -0.39
GGA3-218ENST00000584243 EHMT2Q96KQ7 1210 aa12.63□□□□□ -0.39
GGA3-218ENST00000584243 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa12.63□□□□□ -0.39
GGA3-218ENST00000584243 BRWD3Q6RI45 1802 aa12.62□□□□□ -0.39
GGA3-218ENST00000584243 ERVK-7P63135 1459 aa12.62□□□□□ -0.39
GGA3-218ENST00000584243 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.7 ms