RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580809.5

SEPT4-215, Transcript of septin 4, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEPT4, Length 952 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEPT4-215	ENST00000580809	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SEPT4-215	ENST00000580809	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SEPT4-215	ENST00000580809	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
SEPT4-215	ENST00000580809	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SEPT4-215	ENST00000580809	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
SEPT4-215	ENST00000580809	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SEPT4-215	ENST00000580809	PZP	P20742	1482 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SEPT4-215	ENST00000580809	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
SEPT4-215	ENST00000580809	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
SEPT4-215	ENST00000580809	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SEPT4-215	ENST00000580809	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SEPT4-215	ENST00000580809	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
SEPT4-215	ENST00000580809	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SEPT4-215	ENST00000580809	ABCC5	O15440	1437 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SEPT4-215	ENST00000580809	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SEPT4-215	ENST00000580809	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SEPT4-215	ENST00000580809	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
SEPT4-215	ENST00000580809	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SEPT4-215	ENST00000580809	PKD2	Q13563	968 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SEPT4-215	ENST00000580809	DAPK1	P53355	1430 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SEPT4-215	ENST00000580809	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
SEPT4-215	ENST00000580809	TNR	Q92752	1358 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SEPT4-215	ENST00000580809	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SEPT4-215	ENST00000580809	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SEPT4-215	ENST00000580809	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
SEPT4-215	ENST00000580809	ABCC3	O15438	1527 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SEPT4-215	ENST00000580809	NLRP1	Q9C000	1473 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SEPT4-215	ENST00000580809	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SEPT4-215	ENST00000580809	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SEPT4-215	ENST00000580809	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SEPT4-215	ENST00000580809	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SEPT4-215	ENST00000580809	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
SEPT4-215	ENST00000580809	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
SEPT4-215	ENST00000580809	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SEPT4-215	ENST00000580809	KANK1	Q14678	1352 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SEPT4-215	ENST00000580809	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SEPT4-215	ENST00000580809	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SEPT4-215	ENST00000580809	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SEPT4-215	ENST00000580809	DEPDC5	O75140	1603 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SEPT4-215	ENST00000580809	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SEPT4-215	ENST00000580809	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
SEPT4-215	ENST00000580809	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SEPT4-215	ENST00000580809	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SEPT4-215	ENST00000580809	CEP152	O94986	1710 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SEPT4-215	ENST00000580809	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SEPT4-215	ENST00000580809	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SEPT4-215	ENST00000580809	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
SEPT4-215	ENST00000580809	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.39	■■■□□ 2.78
SEPT4-215	ENST00000580809	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.38	■■■□□ 2.77
SEPT4-215	ENST00000580809	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SEPT4-215	ENST00000580809	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
SEPT4-215	ENST00000580809	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SEPT4-215	ENST00000580809	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SEPT4-215	ENST00000580809	MED14	O60244	1454 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SEPT4-215	ENST00000580809	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SEPT4-215	ENST00000580809	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
SEPT4-215	ENST00000580809	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SEPT4-215	ENST00000580809	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.76
SEPT4-215	ENST00000580809	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SEPT4-215	ENST00000580809	CPS1	P31327	1500 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SEPT4-215	ENST00000580809	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SEPT4-215	ENST00000580809	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
SEPT4-215	ENST00000580809	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SEPT4-215	ENST00000580809	SLIT1	O75093	1534 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SEPT4-215	ENST00000580809	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
SEPT4-215	ENST00000580809	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.17	■■■□□ 2.74
SEPT4-215	ENST00000580809	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
SEPT4-215	ENST00000580809	NOS1	P29475	1434 aa		32.16	■■■□□ 2.74
SEPT4-215	ENST00000580809	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.15	■■■□□ 2.74
SEPT4-215	ENST00000580809	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.15	■■■□□ 2.74
SEPT4-215	ENST00000580809	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.15	■■■□□ 2.74
SEPT4-215	ENST00000580809	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SEPT4-215	ENST00000580809	UNC13B	O14795	1591 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SEPT4-215	ENST00000580809	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SEPT4-215	ENST00000580809	TET3	O43151	1660 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SEPT4-215	ENST00000580809	IDI1	Q13907	227 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SEPT4-215	ENST00000580809	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SEPT4-215	ENST00000580809	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SEPT4-215	ENST00000580809	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
SEPT4-215	ENST00000580809	SYNM	O15061	1565 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SEPT4-215	ENST00000580809	LTK	P29376	864 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SEPT4-215	ENST00000580809	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SEPT4-215	ENST00000580809	ITGAE	P38570	1179 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SEPT4-215	ENST00000580809	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
SEPT4-215	ENST00000580809	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SEPT4-215	ENST00000580809	TOM1	O60784	492 aa		32.01	■■■□□ 2.71
SEPT4-215	ENST00000580809	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32	■■■□□ 2.71
SEPT4-215	ENST00000580809	NUP155	O75694	1391 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SEPT4-215	ENST00000580809	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.71
SEPT4-215	ENST00000580809		E9PCH4	1651 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SEPT4-215	ENST00000580809	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SEPT4-215	ENST00000580809	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SEPT4-215	ENST00000580809	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SEPT4-215	ENST00000580809	ZFYVE9	O95405	1425 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SEPT4-215	ENST00000580809	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	31.83	■■■□□ 2.69
SEPT4-215	ENST00000580809	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
SEPT4-215	ENST00000580809	PIP4K2B	P78356	416 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SEPT4-215	ENST00000580809	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SEPT4-215	ENST00000580809	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SEPT4-215	ENST00000580809	KCNA6	P17658	529 aa		31.8	■■■□□ 2.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.8 ms