RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP33.59■■■□□ 2.97
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANP32CO43423 234 aa33.58■■■□□ 2.97
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC144AA2RUR9 1427 aa33.58■■■□□ 2.97
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa33.56■■■□□ 2.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLA2R1Q13018 1463 aa33.54■■■□□ 2.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CD109Q6YHK3 1445 aa33.54■■■□□ 2.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa33.53■■■□□ 2.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa33.53■■■□□ 2.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa33.52■■■□□ 2.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DCAF11Q8TEB1 546 aa33.51■■■□□ 2.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RALGAPBQ86X10 1494 aa33.45■■■□□ 2.95
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC7Q96M83 1385 aa33.44■■■□□ 2.94
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.44■■■□□ 2.94
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USP47Q96K76 1375 aa33.44■■■□□ 2.94
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FKBP8Q14318 412 aa33.44■■■□□ 2.94
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa33.44■■■□□ 2.94
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RGL3Q3MIN7 710 aa33.43■■■□□ 2.94
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DEPDC5O75140 1603 aa33.43■■■□□ 2.94
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.43■■■□□ 2.94
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATP10AO60312 1499 aa33.41■■■□□ 2.94
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa33.4■■■□□ 2.94
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIF3BO15066 747 aa33.4■■■□□ 2.94
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 E9PCH4 1651 aa33.39■■■□□ 2.94
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KDM5CP41229 1560 aa33.38■■■□□ 2.93
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BCANQ96GW7 911 aa33.37■■■□□ 2.93
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CARD11Q9BXL7 1154 aa33.37■■■□□ 2.93
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.36■■■□□ 2.93
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CNTLNQ9NXG0 1405 aa33.36■■■□□ 2.93
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIF7Q2M1P5 1343 aa33.35■■■□□ 2.93
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP33.35■■■□□ 2.93
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.34■■■□□ 2.93
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.34■■■□□ 2.93
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.34■■■□□ 2.93
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KANK1Q14678 1352 aa33.34■■■□□ 2.93
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A2MP01023 1474 aa33.34■■■□□ 2.93
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRAG1Q86YV5 1406 aa33.31■■■□□ 2.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TET3O43151 1660 aa33.3■■■□□ 2.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VWDEQ8N2E2 1590 aa33.29■■■□□ 2.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.29■■■□□ 2.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP33.28■■■□□ 2.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MROH1Q8NDA8 1641 aa33.28■■■□□ 2.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa33.25■■■□□ 2.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NEO1Q92859 1461 aa33.25■■■□□ 2.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRPM2O94759 1503 aa33.25■■■□□ 2.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa33.25■■■□□ 2.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HECW2Q9P2P5 1572 aa33.24■■■□□ 2.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NEFLP07196 543 aa33.24■■■□□ 2.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MLH3Q9UHC1 1453 aa33.23■■■□□ 2.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PTPRTO14522 1441 aa33.21■■■□□ 2.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 POLR3GLQ9BT43 218 aa33.21■■■□□ 2.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RAPGEF3O95398 923 aa33.2■■■□□ 2.9
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.19■■■□□ 2.9
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa33.17■■■□□ 2.9
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CLTCL1P53675 1640 aa33.17■■■□□ 2.9
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NBPF1Q3BBV0 1214 aa33.16■■■□□ 2.9
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.16■■■□□ 2.9
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABCA6Q8N139 1617 aa33.15■■■□□ 2.9
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEP152O94986 1710 aa33.15■■■□□ 2.9
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP33.13■■■□□ 2.89
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EFCAB6Q5THR3 1501 aa33.12■■■□□ 2.89
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GLI2P10070 1586 aa33.1■■■□□ 2.89
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.1■■■□□ 2.89
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPRASP1Q5JY77 1395 aa33.09■■■□□ 2.89
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GGT6Q6P531 493 aa33.08■■■□□ 2.89
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.06■■■□□ 2.88
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RICTORQ6R327 1708 aa33.05■■■□□ 2.88
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LMTK2Q8IWU2 1503 aa33.05■■■□□ 2.88
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UGGT1Q9NYU2 1555 aa33.04■■■□□ 2.88
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP33.04■■■□□ 2.88
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LAMC1P11047 1609 aa33.04■■■□□ 2.88
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DIP2BQ9P265 1576 aa33.02■■■□□ 2.88
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa33.01■■■□□ 2.88
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MADDQ8WXG6 1647 aa33.01■■■□□ 2.87
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC184Q52MB2 194 aa32.94■■■□□ 2.86
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.94■■■□□ 2.86
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa32.94■■■□□ 2.86
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TSPOAP1O95153 1857 aa32.93■■■□□ 2.86
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NPATQ14207 1427 aa32.93■■■□□ 2.86
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIF1BO60333 1816 aa32.93■■■□□ 2.86
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANP32EQ9BTT0 268 aa32.92■■■□□ 2.86
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABCC3O15438 1527 aa32.92■■■□□ 2.86
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NEURL4Q96JN8 1562 aa32.91■■■□□ 2.86
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STAC3Q96MF2 364 aa32.9■■■□□ 2.86
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP32.9■■■□□ 2.86
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP32.89■■■□□ 2.86
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MROH2AA6NES4 1674 aa32.87■■■□□ 2.85
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TESK2Q96S53 571 aa32.86■■■□□ 2.85
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MRS2Q9HD23 443 aa32.86■■■□□ 2.85
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa32.84■■■□□ 2.85
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.84■■■□□ 2.85
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DISP3Q9P2K9 1392 aa32.83■■■□□ 2.85
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHGAP10645 457 aaKnown RBP32.82■■■□□ 2.85
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IQGAP1P46940 1657 aa32.81■■■□□ 2.84
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